BAC end sequencing of Pacific white shrimp <Emphasis Type="Italic">Litopenaeus vannamei</Emphasis>: a glimpse into the genome of Penaeid shrimp

Little is known about the genome of Pacific white shrimp (Litopenaeus vannamei). To address this, we conducted BAC (bacterial artificial chromosome) end sequencing of L. vannamei. We selected and sequenced 7 812 BAC clones from the BAC library LvHE from the two ends of the inserts by Sanger sequencing. After trimming and quality filtering, 11 279 BAC end sequences (BESs) including 4 609 paired- ends BESs were obtained. The total length of the BESs was 4 340 753 bp, representing 0.18% of the L. vannamei haploid genome. The lengths of the BESs ranged from 100 bp to 660 bp with an average length of 385 bp. Analysis of the BESs indicated that the L. vannamei genome is AT-rich and that the primary repeats patterns were simple sequence repeats (SSRs) and low complexity sequences. Dinucleotide and hexanucleotide repeats were the most common SSR types in the BESs. The most abundant transposable element was gypsy, which may contribute to the generation of the large genome size of L. vannamei. We successfully annotated 4 519 BESs by BLAST searching, including genes involved in immunity and sex determination. Our results provide an important resource for functional gene studies, map construction and integration, and complete genome assembly for this species.     

隧道工程地震易损性分析研究综述与展望

易损性分析是隧道工程领域防震减灾研究的重要方法。首先,详细综述了国内外隧道地震易损性研究历史与现状;其次,归纳了国内外隧道地震易损性分析主要方法,并总结了各种方法的实际适用性;接着,提出了隧道地震易损性评估步骤,并且讨论了以数值模拟为主要手段的理论易损性曲线建立中的3个关键内容:(1)输入参数确定;(2)破坏状态分级;(3)相关不确定性参数计算;最后,指出该领域一些亟待解决的问题和未来研究发展的方向。结果表明:隧道地震易损性分析能通过考虑相关不确定性因素,反映了隧道在地震荷载作用下的性能,有利于未来的风险评估和损失估算,对基于性能的隧道抗震设计的发展具有重要意义。     

滇池不同湖区浮游动物群落稳定性及其驱动因子分析

为了揭示滇池不同湖区浮游动物群落稳定性及其驱动因子,于2020年对滇池草海、大泊口、外海3个具有一定空间分隔的区域,按季度进行4次采样调查。结果表明,大泊口区域的溶解氧、透明度指标显著高于外海,总氮、总磷、悬浮物、叶绿素a和化学需氧量等指标浓度显著低于外海,草海理化因子浓度介于大泊口与外海之间。研究期间3个区域共鉴定出浮游动物41属(枝角类12属、桡足类8属、轮虫21属),轮虫种类和密度均占较大比例。浮游动物年平均密度大泊口(7771.3 ind./L)>草海(2901.1 ind./L)>外海(634.8 ind./L);年平均生物量草海(3.72 mg/L)>大泊口(2.15 mg/L)>外海(2.09 mg/L)。非参数多元方差分析(PERMANOVA)与相似性百分比分析(SIMPER)结果表明,滇池3个区域间浮游动物群落结构差异极显著,导致大泊口与草海、外海群落结构呈极显著差异的属种为轮虫类群的种类,导致草海与外海群落结构呈极显著差异的属种为枝角类和轮虫类群的种类。此外,浮游动物群落稳定性与物种多样性呈显著的正相关关系,且经过生态修复后水质有所改善的湖区...     

关于黑潮延伸体海域水体的三维热结构时-空变化特征研究

基于西北太平洋Argo数据资料,利用参数化方法,从Argo温盐剖面数据中提取出一系列特征动力参数,定量分析黑潮延伸体海域水体的三维热结构的时-空变化特征、季节变化特征及其与地形和环流的关系。结果表明:黑潮延伸体海域水体的海表面温度存在着明显的冬春弱,夏秋强的季节变化特征,冬季平均海表面温度为15℃,夏季则达到了27℃;混合层深度在春季和夏季都较深,在180 m左右,秋冬较浅,在17 m左右,在水平方向上混合层深度有较强的梯度;温跃层春、夏、秋、冬4季的平均温度表现出明显的南北差异,夏季南部海域平均温度为14℃左右,北部海域较低为5℃左右;季节性温跃层深度大约在100 m左右;黑潮延伸体海域水体的温跃层底部最大深度在800 m左右;黑潮延伸体主体海域中心位置冬天在36°N左右,夏天大约移到34°N。     

西北太平洋热带云团发展与两类El Nio事件的联系

利用1982—2009年全球热带云团数据集、NCEP/NCAR再分析资料和英国Hadley中心海温资料,并引入热带云团生成率(Genesis Productivity,GP)来分析EP(Eastern Pacific)El Nio和CP(Central Pacific)El Nio事件与西北太平洋热带云团发展的相关性。研究表明,1)夏秋两季GP与Nio3指数在东南区(SE)均为显著正相关,在西南区(SW)仅秋季呈显著正相关;GP与EMI(El Nio Modoki Index)指数在夏季SE区域为显著正相关,在秋季南中国海(South China Sea,SCS)区呈负相关。2)在EP El Nio年,夏季SE区域的GP增大与低层涡度、高层散度以及低层相对湿度的相对增大一致。夏季SW区域与秋季SE区域的GP增大与有利的高低空配置相关,La Nia年则与之相反。3)在CP El Nio年,夏季SE区域的GP增大伴随着低层涡度和高层散度的增加,同时与充足的水汽及弱风切变相吻合;而秋季SCS区域的GP下降源于正涡度带、正散度带以及水汽带的东移。     

基于GIS的火电企业煤场数字化管理方法

针对我国火电企业燃料料场管理存在的堆取位置不清、燃料种类不明和自动堆取作业安排难的问题,提出基于GIS的燃料料场管理方法,基于多传感器集成研究固定测量和移动测量相补充的料场实时测量技术,基于GPS定位技术研究料场堆取料自动作业指导方法和基于GIS开发料场数字化管理软件系统,以实现从燃料采购到燃烧全生命周期管理,包括燃料入厂、料场作业、采制化和配比掺烧等多个业务环节。系统在神华集团江油电厂得到实际推广应用,为规范和加强江油电厂燃料管理流程、保证燃料安全、精确配比掺烧、控制燃料成本起到很好支撑作用,产生了良好的社会效益和经济效益。     

基于改进TEQC的区域CORS站点质量检核

TEQC能对GNSS数据进行质量检核,编辑并改善GNSS数据质量,但该软件运行于DOS环境,成果不能图形可视化,存在人机交互性差等不足。文中通过VisualC#编程对TEQC和QCVIEW进行可视化封装,实现基于WINDOWS界面的质量检核与可视化表达,选用5个质量评价指标对CORS站点数据进行质量检核。最后结合实例验证改进软件的可行性,并通过BERNESE软件分别求单天解验证选用的5个质量指标能够对观测数据作准确的质量评估。     

北斗卫星导航系统SISURE初步评估

北斗导航系统自2018年12月27日提供全球服务以来,其服务性能受到了极大关注.以上海天文台iGMAS (International GNSS MonitoringAssessment System)分析中心发布的精密轨道、钟差产品作为基准,评估了2019年年积日3–12 d的北斗二号、北斗三号以及GPS广播星历的轨道、钟差和空间信号用户测距误差(Signal in Space User Ranging Error, SISURE,简称为URE),并且对北斗卫星导航系统结果进行了详细的分析.结果表明:在评估时间段内,北斗三号广播星历轨道精度、URE均明显优于北斗二号,且部分结果优于GPS.北斗三号广播星历轨道径向精度最高,优于0.2 m.北斗三号全部卫星URE均值优于0.4 m, URE RMS (root mean square)优于0.5 m.北斗二号每颗卫星URE均值、95%URE (置信度为95%的URE)、URE RMS小于2 m,北斗三号每颗卫星URE均值、95%URE、URE RMS小于1 m,均达到了系统公开承诺的服务性能标准.     

高海拔地区送电线路GPS测量的问题及解决办法

以青藏直流联网工程测量坐标系统建立为例，分析了高原地区线路测量中坐标系统建立的变形因素，以及解决变形的几种方法和一些细节问题，提出了为方便高原地区线路测量中坐标系统建立的一些应用经验，以此为同行提供有益参考。     

GPS天线阵列变形监测系统设计及应用

GPS是监测大坝以及滑坡安全的有效手段。但是成本过高是限制其发展的关键问题,文中提出的GPS天线阵列变形监测系统很好地解决了这些问题,该系统利用GPS多天线共享器,有效降低了设备成本。此系统已长期运行于云南省漫湾水电站,通过实践证明GPS天线阵列监测系统拥有与常规GPS监测方法相当的精度,但大大降低了监测系统的成本。