基于网络药理学和分子对接技术探讨杜仲-续断治疗复发性流产作用机制

目的：采用网络药理学和分子对接技术探讨杜仲-续断治疗复发性流产（RSA）的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库（TCMSP）检索杜仲-续断的活性成分和基因靶点。在GeneCards、OMIM和PharmGkb数据库收集RSA疾病靶点,在Cytoscape 3.7.2软件中构建活性成分-靶点网络,基于STRING数据构建杜仲-续断治疗RSA靶点高置信度互作网络,根据拓扑分析参数筛选杜仲-续断治疗RSA的核心靶点。使用AutoDock Vina软件对关键药物成分与核心靶点进行分子对接。对疾病与药物交集靶点进行GO生物学过程富集分析和KEGG通路注释分析。结果：通过筛选获得杜仲-续断治疗RSA有效活性成分26种,预测靶点119个,涉及11个核心靶点。GO富集分析显示杜仲-续断主要参与对脂多糖反应、细胞氧化应激、R固醇激素调节等生物过程,KEGG富集分析结果显示杜仲-续断药对与磷脂酰肌醇-3-激酶（PI3K）/丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶（Akt/PKB）、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、血管内皮生长因子（VEGF）信号通路等关系密切。结论：杜仲-续断治疗RSA的作用机制涉及多成分、多靶点和多通路,为进一步探究其药理作用及临床治疗提供理论基础。     

基于网络药理学探讨芎芷地龙汤治疗偏头痛的作用机制

目的：分析芎芷地龙汤的活性成分,预测其治疗偏头痛的作用靶点及信号通路。方法：通过TCMSP平台收集芎芷地龙汤活性成分并进行ADME筛选,收集活性成分潜在靶点;通过GeneCards数据库收集偏头痛的相关疾病靶点,并与药物活性成分靶点取交集得到共同靶点,进行PPI分析;使用Cytoscape构建“药物-靶点-疾病”网络并进行分析,通过DAVID数据库对共同靶点进行GO富集与KEGG富集分析。结果：共筛选出芎芷地龙汤85个潜在活性成分和145个潜在治疗靶点;芎芷地龙汤治疗偏头痛关键靶点为JUN、TNF、MAPK1、AKT1、RELA等;可能参与的通路有Pathway in cancer通路、HIF-1信号、TNF信号通路、TLR信号通路、神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路、T细胞受体信号通路等。结论：槲皮素、β-谷甾醇等是芎芷地龙汤中的主要活性成分;TNF、MAPK1、AKT1等基因可能在治疗偏头痛时参与调控;芎芷地龙汤主要通过调节氧化应激反应、低氧反应、炎性因子释放、神经递质传递、血管张力等机制治疗偏头痛。     

基于网络药理学探讨黄芪对肾小球肾炎的作用机制

目的：运用网络药理学的方法探讨黄芪治疗肾小球肾炎的作用机制。方法：利用TCMSP平台获取黄芪的活性成分及相关的潜在靶点,通过Gene Cards数据库检索有关肾小球肾炎的相关疾病靶点,对中药-疾病靶点取交集,得到黄芪-肾小球肾炎的药效靶点,并采用Cytoscape3.7.2软件构建黄芪-肾小球肾炎靶点网络;使用String数据库进行蛋白相互作用网络（PPI）的绘制;借助R语言以及Bioconductor数据库对黄芪治疗肾小球肾炎潜在作用靶点进行GO分子功能分析和KEGG通路分析。结果：筛选得到黄芪的20个有效成分及98个中药-疾病共同靶标,GO分子功能显示黄芪治疗肾小球肾炎主要涉及细胞因子受体结合、核激素受体结合、细胞因子活性、受体配体活性、转录因子活性等方面。KEGG通路分析结果显示,黄芪治疗肾小球肾炎核心靶点主要涉及晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体（AGE-RAGE）信号通路、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、白细胞介素-17（IL-17）信号通路、Toll样受体信号通路、缺氧诱导因子-1（HIF-1）信号通路等。结论：黄芪对于肾小球肾炎的治疗作用是多成分-多靶点-多途径的过程,基于网络药理学对此的研究,为临床应用黄芪治疗肾小球肾炎提供了参考价值。     

基于网络药理学探讨荷叶抗非酒精性脂肪肝的作用机制

目的：基于网络药理学探讨荷叶抗非酒精性脂肪肝（NAFLD）的作用机制。方法：利用TCMSP平台和Swiss Target Prediction 等数据库搜集荷叶活性成分和作用靶点。通过GeneCard、GenCLiP3数据库获取NAFLD的相关靶点,利用Cytoscape 3.8.2 软件构建荷叶成分-疾病-靶点蛋白网络。使用STRING数据库和Cytoscape 3.8.2 软件构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,进行基因本体（GO）功能与京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：获得荷叶活性成分15种,潜在靶点441个,疾病相关靶点1316个,成分-疾病-靶点161个。PPI网络显示,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、白细胞介素6、肿瘤抑制基因 p53、血管内皮生长因子、肿瘤坏死因子等靶点与荷叶抗NAFLD的关系最密切。GO功能主要有药物的反应、凋亡过程的负调控、胞液、核浆、细胞质、线粒体酶结合、细胞因子活性、转录因子结合等。KEGG通路主要涉及乙型肝炎、癌症的途径、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、Toll样受体信号通路、NOD样受体信号通路、缺氧诱导因子-1信号通路等。结论：荷叶通过调控161个靶点参与TNF信号通路、Toll样受体信号通路、NOD样受体信号通路等作用于NAFLD。     

基于网络药理学及分子对接探讨银地消庀汤治疗银屑病的潜在机制

目的：运用网络药理学及分子对接方法探究银地消庀汤治疗银屑病的潜在机制。方法：通过TCMSP平台、GeneCards等数据库获得银地消庀汤的活性成分、药物靶点、疾病靶点,将药物靶点、疾病靶点取交集获得共同靶点,构建“药物-活性成分-共同靶点”网络及蛋白质-蛋白质相互作用网络,并进行基因本体功能和京都基因与基因组百科全书通路富集分析。结果：银地消庀汤包含槲皮素、山柰酚、木犀草素等248种活性成分,涉及219个共同靶点,富集分析主要涉及调节脂质与动脉粥样硬化、肿瘤坏死因子信号通路、白细胞介素-17信号通路。结论：银地消庀汤治疗银屑病的潜在药理学机制及其活性化合物可能与脂质代谢、免疫调节、炎症诱导等多途径协同调节有关。     

桂枝-柴胡治疗慢性心衰伴抑郁的网络药理学研究

目的：运用网络药理学方法挖掘桂枝-柴胡治疗慢性心力衰竭（CHF）伴抑郁（MDD）的主要活性成分、靶点及信号通路,探究其潜在作用机制。方法：通过TCMSP数据库和相关文献检索桂枝-柴胡主要活性成分及其作用靶点,经BATMAN-TCM平台对预测靶点予以补充,构建药物靶点库;通过GeneCards、DisGeNET数据库分别获取CHF与抑郁相关靶标,二者取交集,建立疾病靶标库;利用R语言将药物靶点库与疾病靶标库取交集,构建Venn图;通过STRING数据库和Cytoscape 3.7.1软件及其内在插件构建化合物-靶标网络及PPI核心网络;最后利用DAVID数据库对核心网络靶点进行GO富集和KEGG通路注释分析。结果：筛选出桂枝-柴胡有27个活性成分,288个靶基因;筛选出CHF伴MDD相关靶基因882个,药物与疾病Venn图提取关键靶点83个,PPI核心网络构建筛选出12个关键基因;GO分析（P＜0.05且靶点基因富集度>10%）得到19条生物过程,13条细胞组分表达过程,8个分子功能相关过程;KEGG分析（P＜0.05）显示72条信号通路,包括HIF-1信号通路、TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路、神经活性配体-受体相互作用信号通路等。结论：桂枝-柴胡活性成分通过多成分、多靶点、多通路发挥CHF伴MDD的治疗作用。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨瓜蒌薤白桂枝汤加减防治心绞痛的作用机制

目的：基于网络药理学和分子对接技术探讨瓜蒌薤白桂枝汤加减防治心绞痛（AP）的作用机制。方法：采用TCMSP数据库获取瓜蒌薤白桂枝汤加减的活性成分及靶点,并通过文献检索进行补充。采用Cytoscape软件构建药物-成分-靶点网络模型。采用DrugBank、GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库筛选AP的关键靶点,与药物成分靶点取交集获取潜在基因作用靶点。使用软件的拓扑分析插件筛选核心成分与作用靶点。利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络。对成分-疾病交集靶点进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。基于Autodock软件将核心成分与核心靶点进行分子对接验证。结果：共筛选到300个活性成分靶点,获取疾病靶点1216个,取交集获得潜在基因作用靶点124个,筛选出核心靶点30个,对应100个核心药物成分,发挥作用的核心成分为槲皮素、山柰酚等,核心靶点为肿瘤细胞坏死因子（TNF）、白细胞介素-6（IL-6）、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1（Akt1）、前列腺素G/H合酶2(PTGS2）等。富集分析推测瓜蒌薤白桂枝汤加减主要经过癌症调节、脂质与动脉粥样硬化通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路等20条相关通路发挥作用。分子对接结果显示瓜蒌薤白桂枝汤加减中槲皮素、山柰酚与TNF、Akt1结合性较好。结论：瓜蒌薤白桂枝汤加减可能通过核心成分槲皮素与山柰酚、核心靶点TNF、Akt1,经由脂质与动脉粥样硬化信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路发挥防治AP的作用。     

基于网络药理学探究晕清降压方治疗代谢性高血压病的作用机制

目的：通过网络药理学方法筛选国医大师刘祖贻验方晕清降压方治疗代谢性高血压病的作用成分,并探讨其潜在作用机制。方法：从TCMSP及BATMAN-TCM数据库中筛选出晕清降压方的活性成分及作用靶点。从OMIM及GeneCards中筛选出代谢性高血压病的靶点。利用Bioinformatics & Evolutionary Genomics平台将晕清降压方成分靶点与代谢性高血压病的靶点进行映射,获得晕清降压方-代谢性高血压病的共同靶点,并将其导入STRING数据库获得蛋白-蛋白网络模型,构建“活性成分-靶点”网络,对共同靶点进行GO富集分析及KEGG富集分析。结果：晕清降压方有114种活性成分可能通过143个靶点发挥抗代谢性高血压病的作用;GO富集分析及KEGG富集分析显示,晕清降压方治疗代谢性高血压病主要通过PI3K-AKT信号通路、流体剪切力与动脉粥样硬化、AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、内分泌抵抗等发挥作用。结论：从晕清降压方的12味中药中筛选出114个具有抗代谢性高血压病的活性成分,这些活性成分通过多个靶点、多条通路发挥抗代谢性高血压病的作用。     

基于网络药理学探讨当归芍药散治疗复发性流产的作用机制

目的：利用网络药理学技术研究当归芍药散治疗复发性流产（RSA）的潜在作用机制。方法：通过TCMSP数据库寻找、筛选、预测当归芍药散中5味中药的化学活性成分和对应靶点，通过OMIM数据库、GeneCards 数据库获取与RSA相关的疾病靶点；利用Venny对当归芍药散药物靶点、RSA疾病靶点取交集、绘制韦恩图，从而预测当归芍药散-RSA潜在作用靶点；利用Cytoscape软件构建“当归芍药散—成分—RSA—靶点”网络；分别借助String平台、R软件对RSA药物-疾病潜在作用靶点构建蛋白相互作用网络、分析GO 生物过程、分析KEGG 通路。结果：当归芍药散主要通过芍药苷、芍药内酯苷、泽泻醇、儿茶素、川芎内酯A等30个活性成分作用于IL6、AKT1、JUN、TNF、PTGS2等84个与疾病相关的靶点。通过AGE-RAGE信号通路、肿瘤坏死因子信号通路（TNF）、白细胞介素（IL）-17信号通路、TOLL样受体信号通路、脂多糖反应等生物过程和代谢通路，调节MAPK信号通路和NF-κB信号通路，以达到平衡机体TNF、IL等炎性因子含量，避免了过度自身免疫的发生，从而改善妊娠结局。结论：本研究反应了当归芍药散具有多成分、多靶点、多通路的特点，为当归芍药散治疗复发性流产提供新思路和理论依据。     

六味地黄丸治疗糖尿病肾病作用机制的网络药理学研究

目的：通过网络药理学方法建立六味地黄丸“活性成分-靶点-通路”图,初步探讨六味地黄丸治疗糖尿病肾病的药理机制。方法：通过TCMSP获取六味地黄丸各单药的活性成分和潜在靶点,运用Genecard筛选得分≥20分的糖尿病肾病相关靶点,STRING构建蛋白相互作用网络,Cytoscape拓扑分析网络图,R语言进行GO和KEGG通路富集分析。结果：网络分析得出41个活性成分,共涉及21个靶点和63条通路。其中槲皮素和山奈酚是主要化合物,关键靶点AKT、VEGFA、NOS3、IL6、SERPINE1富集在重要通路AGE-RAGE信号中。结论：为进一步研究六味地黄丸治疗糖尿病肾病的潜在活性成分及其可能的作用机制提供了思路和理论基础。     

基于网络药理学探讨益气泻肺汤治疗慢性心力衰竭的作用机制

目的：运用网络药理学方法分析郭维琴教授经验方益气泻肺汤治疗慢性心力衰竭的潜在作用机制。方法：借助TCMSP、SwissTargetPrediction、DrugBank等数据库,检索益气泻肺汤主要药物的活性成分作用靶点;利用GeneCards、DrugBank、DisGeNET等数据库检索慢性心力衰竭的相关靶点;借助Cytoscape 3.2.1软件构建益气泻肺汤活性成分靶点-慢性心力衰竭疾病靶点网络;通过基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析预测益气泻肺汤治疗慢性心力衰竭的潜在分子生物过程和信号通路。结果：筛选得到益气泻肺汤活性成分靶点795个,慢性心力衰竭疾病靶点356个,取交集得到94个关键靶点,构建益气泻肺汤活性成分靶点-慢性心力衰竭疾病靶点网络,得到肿瘤坏死因子（TNF）、肿瘤抑制蛋白（TP53）、内皮素1（EDN19）、沉默调节蛋白1（SIRT1）、血管紧张素原（AGT）、C反应蛋白（CRP）、类胰岛素生长因子（IGF1）、连环蛋白（CTNNB1）8个核心靶点,此为益气泻肺汤治疗慢性心力衰竭的重要潜在靶点;GO 功能和KEGG 通路富集分析显示益气泻肺汤治疗慢性心力衰竭可能的潜在通路主要有钙信号通路、肾素分泌等。结论：本研究初步揭示了益气泻肺汤有效成分通过多靶点调控、参与多种信息通路和生物学过程治疗慢性心力衰竭的作用机制。     

基于网络药理学与体外细胞实验探讨复方清痹片治疗类风湿性关节炎的作用机制

目的：基于网络药理学与体外细胞实验探讨复方清痹片治疗类风湿性关节炎(RA)的作用机制。方法：基于TCMID、TCMSP和DrugBank数据库筛选复方清痹片的活性成分并预测潜在活性成分靶点;基于GeneCard、OMIM等数据库筛选RA疾病靶点;明确复方清痹片活性成分与RA的共同潜在靶标;利用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,并通过DAVID数据库进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,RT-PCR检测复方清痹片对肿瘤坏死因子（TNF-α）诱导的人类风湿性关节炎成纤维样滑膜细胞（HFLS-RA）模型白介素6（IL-6）、TNF-α、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1（AKT1）和血管内皮生长因子A（VEGFA）mRNA表达的影响。结果：筛选出217种潜在活性成分以及158个潜在靶点;IL-6、TNF、AKT1、白蛋白（ALB）、VEGFA等是复方清痹片治疗RA的关键靶点;复方清痹片主要通过炎性因子、趋化因子、免疫调控等信号通路来发挥治疗RA的作用。复方清痹片能够抑制HFLS-RA增殖,下调IL-6、TNF、AKT1和VEGFA mRNA的表达,这与网络药理学预测的结果相一致。结论：本研究揭示了复方清痹片治疗RA“活性成分-靶点-通路”的复杂关系,为后续该药的临床应用提供了研究基础。     

基于网络药理学探讨党参治疗2型糖尿病的作用机制

目的：基于网络药理学方法探讨党参治疗2型糖尿病(T2DM)的潜在作用机制。方法：通过中药系统药理学分析平台数据库（TCMSP）及OMIM、TTD、Drugbank等网络数据库分别获取药物有效成分、活性靶点、疾病靶点,并取药物成分和疾病的交集靶点,构建药物活性成分与关键靶点网络、蛋白质相互作用（PPI）网络,并对靶蛋白进行GO富集分析和KEGG通路分析。结果：得到药效活性成分21种,药物靶点108个,T2DM靶点2402个,两者匹配映射得到关键靶点28个。党参治疗T2DM的主要成分为木樨草素、7-甲氧基-2-甲基-异黄酮、豆甾醇、黄豆黄素等,关键靶点为白细胞介素-6（IL-6）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、过氧化物酶体增殖物激活受体r（PPARG）等,关键的生物学进程包括药物反应、葡萄糖稳态;关键通路为PI3K-Akt 信号通路、AMPK信号通路、FoxO信号通路、胰岛素抵抗。结论：党参治疗T2DM具有多成分、多靶点、多途径的特点。     

基于网络药理学探讨玉屏风散治疗过敏性紫癜的作用机制

目的：基于网络药理学方法探讨玉屏风散治疗过敏性紫癜（HSP)的作用机制。方法：利用TCMSP、Pubchem、Swiss target prediction等数据库平台,对玉屏风散的有效活性成分和有效靶点基因进行检索、收集和筛选。通过Genecards、Disgenet、OMIM数据库查询和挖掘HSP的相关基因和玉屏风散治疗HSP的交集靶点,STRING数据库和Cytoscape 3.9.1 软件构建活性-成分-靶点可视化网络和可视化分析。运用DAVID数据库进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：筛选出45个玉屏风散活性成分,212个药物靶点,294个疾病靶点和35个交集靶点,对关键靶点进行蛋白质-蛋白质互作（PPI）网络构建,涉及的主要基因有肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素-6、血管内皮生长因子A、白细胞介素-1β、肿瘤蛋白p53、基质金属蛋白酶-9、趋化因子c-c配体2、白细胞介素-10、丝氨酸蛋白酶抑制因子肽酶抑制因子、CXC趋化因子配体8等。GO功能富集分析得到条目数337个,其中生物过程条目284个,分子功能条目35个,细胞组成条目22个。KEGG通路富集分析得到信号通路101条,主要涉及高级糖基化终末产物-受体信号通路、流体剪切应力和动脉粥样硬化信号通路、脂质和动脉硬化信号通路、疟疾信号通路、白细胞介素-17信号传导通路、TNF信号通路、核因子-κB信号通路等。结论：玉屏风散可能通过多成分、多靶点、多通路治疗HSP。     

基于网络药理学及分子对接探讨牛膝-杜仲-桑寄生治疗膝骨关节炎的作用机制

目的：利用网络药理学平台整合分析牛膝-杜仲-桑寄生治疗膝骨关节炎（KOA）的分子机制,为药组的使用提供理论依据。方法：通过TCMSP平台筛选药组有效成分及靶点,与KOA靶点取交集制作韦恩图,构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络图,筛选关键成分和核心基因,对核心靶点进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：筛选出药组有效成分41种,作用靶点239个;主要有槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、黄芩素、汉黄芩素、β-胡萝卜素等关键成分;磷酸激酶B1（AKT1）、半胱氨酸蛋白酶3（CASP3）、白细胞介素-6（IL-6）、肿瘤坏死因子（TNF）、血管内皮生长因子（VEGF)等核心基因。关键信号通路有晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体（AGE-RAGE）通路、TNF通路、脂肪与动脉粥样硬化通路、磷脂酰肌醇3-激酶/磷酸激酶B（PI3K/Akt）通路等,分子对接结果显示活性成分与核心基因结合能力较强。结论：牛膝-杜仲-桑寄生药组可以通过多靶点、多通路发挥抗炎、抗氧化、调控细胞凋亡及稳定关节内环境的作用,达到治疗膝骨关节炎的目的。     

基于网络药理学探讨虎地肠溶胶囊治疗溃疡性结肠炎的作用机制

目的：通过网络药理学探析虎地肠溶胶囊治疗溃疡性结肠炎（UC）的作用机制。方法：基于TCMSP和台湾中医药数据库筛查药物的潜在活性成分及靶点;采用GeneCards数据库获取UC的已知靶点,运用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络图;应用DAVID数据库对共同靶点基因进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;通过Cytoscape 3.7.2软件和R语言软件对数据进行可视化。结果：虎地肠溶胶囊治疗UC的活性成分143种,关键成分包括山柰酚、β-谷甾醇、槲皮素等;潜在作用靶点69个,主要有肿瘤蛋白P53（TP53）、原癌基因蛋白（MYC）、胱天蛋白酶3（CASP3）、人雌激素受体α（ESR1）等靶基因。晚期糖基化产物-晚期糖基化终末产物受体（AGE-RAGE）信号通路、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路。GO功能富集分析结果显示主要涉及DNA转录调控、RNA聚合酶Ⅱ特异性、核受体调控、单加氧酶活性、氧化还原反应等。KEGG通路富集分析结果显示主要涉及疾病相关信号通路、炎症相关信号通路和细胞凋亡信号通路。结论：虎地肠溶胶囊的多种活性成分具有从多靶点、多通路治疗UC的作用,为临床研究提供新思路。     

基于网络药理学和分子对接法探讨乙字汤治疗

目的：应用网络药理学和分子对接法探究乙字汤治疗痔病的活性成分和作用机制。方法：利用Pubchem和TCMSP数据库筛选乙字汤的有效活性成分并预测作用靶点,通过Genecards数据库获取痔病相关的疾病靶点,并用UniProt数据库标准化蛋白名称。取药物疾病共同靶点,以STRING平台进行蛋白互作（PPI）,借助Cytoscape3.8.0软件进行可视化分析,并构建中药-成分-靶点网络。利用Metascape数据库对交集基因进行KEGG通路分析和GO富集分析。使用Auto Dock 4对度值较高的药物成分与核心靶点进行分子对接验证,并借助Pymol和Lig Plot 2.2进行可视化分析。结果：乙字汤治疗痔病的活性成分126个,潜在靶点53个,以白细胞介素-6（IL-6）、肿瘤坏死因子（TNF）、基质金属蛋白酶9（MMP9）、血管内皮生长因子A（VEGFA）等为核心靶点,主要通过IL-17、核因子-kappa B、丝裂原活化蛋白激酶等信号通路治疗痔病。分子对接结果显示主要活性成分与核心靶点均有较好的结合活性。结论：乙字汤的主要活性成分通过调节IL-6、TNF、MMP9、VEGFA等多种细胞因子治疗痔病。     

基于网络药理学和分子对接探析养心活血通脉汤治疗稳定性冠心病的作用机制

目的：运用网络药理学和分子对接技术探析养心活血通脉汤治疗稳定性冠心病的作用机制。方法：应用TCMSP、Herb、TCMID平台检索养心活血通脉汤成分及作用靶点;经GeneCards、OMIM、DisGeNET平台获取稳定性冠心病靶点;运用Cytoscape 3.9.1建立“药物-活性成分-靶点”网络及蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,筛选核心靶点。由Metascape平台进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。利用Auto Dock Tools软件进行有效成分与和核心靶点分子对接。结果：养心活血通脉汤治疗稳定性冠心病主要成分为槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、芒柄花黄素、黄芩素、丹参酮ⅡA,关键靶点为肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素-6（IL-6）、丝氨酸/苏氨酸激酶1（AKT1）、白细胞介素-1β（IL-1β）、血管内皮生长因子（VEGFA）,关键通路为脂质和动脉粥样硬化（Lipid and atherosclerosis）、磷脂酰肌醇3激酶-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1信号通路（PI3K-Akt信号通路）、肿瘤坏死因子信号通路（TNF信号通路）、丝裂原活化蛋白激酶信号通路（MAPK信号通路）、糖基化终产物/受体信号通路（AGE-RAGE信号通路）等。分子对接结果显示各有效成分与各核心靶点结合活性较好。结论：养心活血通脉汤治疗稳定性冠心病作用机制主要为降脂、抗动脉粥样硬化、抗炎、抗心肌损伤。     

基于网络药理学与分子对接研究肉豆蔻治疗抑郁症的作用机制

目的：基于网络药理学方法与分子对接技术研究肉豆蔻治疗抑郁症的作用机制。方法：通过中药系统药理学分析平台TCMSP,获得肉豆蔻的活性成分和作用靶点;利用Uniprot数据库构建中药-成分-靶点网络;从GeneCards、OMIM、DrugBank数据库获得抑郁症疾病靶点、肉豆蔻及抑郁症共有靶点;通过Venny 2.1.0平台、String平台进行肉豆蔻与抑郁症共同靶点相互作用分析;利用Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白互作（PPI）网络,采用Metascape平台对核心靶点进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;采用分子对接技术确定肉豆蔻有效成分作用于抑郁症的核心靶点。结果：获得42个潜在作用靶点。乙酰胆碱酯酶（ACHE）、钠依赖性血清素转运体（SLC6A4）、一氧化氮合酶（NOS3）、Alpha-2A肾上腺素能受体（ADRA2A）可能是肉豆蔻治疗抑郁症的核心基因。肉豆蔻作用于抑郁症的通路涉及神经受体相互作用、钙信号通路。分子对接技术验证了肉豆蔻有效成分中的β-谷甾醇与潜在靶点ACHE和NOS3具有较好的结合活性。结论：肉豆蔻的主要活性成分β-谷甾醇可能通过作用于ACHE等多个靶点来调控神经受体相互作用、钙信号通路等多条信号通路,从而发挥抗抑郁作用。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨石菖蒲治疗缺血性脑卒中的作用机制

目的：借助网络药理学和分子对接技术研究石菖蒲治疗缺血性脑卒中（CIS）的作用机制。方法：以“石菖蒲”为关键词在中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索其活性成分和作用靶点,利用Uniprot数据库对靶点蛋白信息进行标准化,构建中药、成分、靶点网络。利用GeneCards、TTD、OMIM和DRUGBANK 4个数据库检索CIS相关疾病靶点。将疾病和药物靶点导入微生信软件绘制韦恩图得到交集靶点,使用在线软件String 11.0建立蛋白质相互作用（PPI）网络。采用Cytoscape 3.7.2软件对PPI网络进行可视化分析,筛选出核心靶点。在Metascape数据库对核心靶点进行GO富集分析及KEGG通路分析。最后采用分子对接技术确定石菖蒲的有效成分作用于CIS的核心靶点。结果：获得38个潜在作用靶点,PPI网络拓扑分析发现RAC-α丝氨酸/蛋白激酶（AKT1）、肿瘤坏死因子（TNF）可能是石菖蒲治疗CIS的核心基因。GO富集分析结果显示石菖蒲可能是通过对血压的负向调节、调控白细胞迁移等炎症反应、神经递质合成过程、血管生成以及血液循环等生物学过程来发挥作用。KEGG通路富集分析表明,石菖蒲作用于CIS中的通路涉及血流剪切应力与动脉粥样硬化、钙信号通路、cAMP信号通路、VEG通路以及炎症和癌症等通路。分子对接技术验证了石菖蒲有效成分中的山柰酚与潜在靶点AKT1和TNF具有较好的结合活性。结论：石菖蒲的主要活性成分山柰酚可能通过作用于AKT1等多个靶点,调控钙信号通路等多条信号通路,从而发挥血管生成、抗神经细胞凋亡、抗炎、抑制细胞凋亡等作用,来达到预防或治疗CIS的目的。