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相似文献
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1.
目的:运用网络药理学与分子对接技术探究六味地黄丸治疗肾阴亏虚型老年性便秘的作用机制。方法:通过TCMSP、TCMID、SwissTargetPrediction获取药物的活性成分并筛选,在Genecards、OMIM、TTD、DisGeNET数据库检索与该疾病相关的主要靶点;运用韦恩图获取六味地黄丸与老年性便秘的交集靶点。将以上数据通过STRING获得交集靶点的蛋白网络,构建药物-活性成分-靶点及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并对药物有效成分和核心靶点进行分子对接验证。结果:共获得58个有效活性成分和675个对应靶点,主要有效成分有槲皮素、羟基芫花素、泽泻醇B等;药物-疾病交集靶点296个,包括丝氨酸/ 苏氨酸蛋白激酶 1 (AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)等。GO功能富集共有3175个条目,KEGG通路富集得到215条通路,主要有癌症通路、磷脂酰肌醇3-激酶/苏氨酸蛋白激酶信号通路、癌症中的蛋白聚糖、丝裂原活化蛋白激酶信号通路等。分子对接显示该药物主要有效成分和核心靶点蛋白有较好的结合力。结论:该研究在总体上预测了六味地黄丸治疗肾阴亏虚型老年性便秘的活性成分、靶点和信号通路,表明了其多成分-多靶点-多途径的治疗特点。  相似文献   

2.
目的:运用网络药理学的方法探讨黄芪治疗肾小球肾炎的作用机制。方法:利用TCMSP平台获取黄芪的活性成分及相关的潜在靶点,通过Gene Cards数据库检索有关肾小球肾炎的相关疾病靶点,对中药-疾病靶点取交集,得到黄芪-肾小球肾炎的药效靶点,并采用Cytoscape3.7.2软件构建黄芪-肾小球肾炎靶点网络;使用String数据库进行蛋白相互作用网络(PPI)的绘制;借助R语言以及Bioconductor数据库对黄芪治疗肾小球肾炎潜在作用靶点进行GO分子功能分析和KEGG通路分析。结果:筛选得到黄芪的20个有效成分及98个中药-疾病共同靶标,GO分子功能显示黄芪治疗肾小球肾炎主要涉及细胞因子受体结合、核激素受体结合、细胞因子活性、受体配体活性、转录因子活性等方面。KEGG通路分析结果显示,黄芪治疗肾小球肾炎核心靶点主要涉及晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路、Toll样受体信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路等。结论:黄芪对于肾小球肾炎的治疗作用是多成分-多靶点-多途径的过程,基于网络药理学对此的研究,为临床应用黄芪治疗肾小球肾炎提供了参考价值。  相似文献   

3.
目的:运用网络药理学和分子对接技术探讨罗汉果治疗糖尿病的作用机制。方法:通过TCMSP平台和Swiss Target Prediction数据库筛选出罗汉果的活性成分及其靶点;利用GeneCard、TTD、OMIM数据库筛选出糖尿病潜在靶点;采用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-活性成分-疾病-靶点的可视化网络;通过STRING数据库对关键靶点构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;利用Metascape数据库进行基因本体(GO)功能以及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;利用Autodock4和Pymol软件对关键活性成分和关键靶点进行分子对接分析和可视化。结果:筛选出有效成分18种,糖尿病靶点146个。GO功能富集分析得到GO条目572条,KEGG通路富集分析得到信号通路167条。分子对接结果显示β-谷甾醇、山柰酚、罗汉果醇等关键活性成分与原癌基因酪氨酸蛋白激酶(SRC)等关键靶点的亲和力较高。结论:罗汉果通过多靶点、多通路发挥抗糖尿病的作用,其关键活性成分通过与SRC、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK-3)等靶点调节晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)、缺氧诱导因子1(HIF-1)、磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶(PI3K-Akt)等信号通路起到治疗糖尿病的作用。  相似文献   

4.
目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨四妙勇安汤治疗糖尿病足(DF)的作用机制。方法:通过TCMSP数据库获取四妙勇安汤中各中药有效成分并预测其作用靶点;通过DisGeNET、GeneCards、OMIM、TDD数据库以“Diabetic Foot”为关键词,筛选出DF的基因靶点。药物活性成分作用靶点与疾病靶点交集为关键靶点,将其导入STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;利用 Cytoscape软件绘制药物-成分-DF-靶点网络图;运用基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析对关键靶点进行分析。利用Autodock软件、Cytoscape软件对核心成分和靶点进行分子对接验证,并运用Pymol 2.5软件进行蛋白对接可视化处理。结果:获得四妙勇安汤有效成分120种,靶点基因251个。药物-成分-DF-靶点网络图中槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇以及人前列腺素内过氧化物合酶2、雌激素受体1为重要节点,主要作用于Lipid and atherosclerosis通路、晚期糖基化终产物及其受体(AGE-RAGE)信号通路。分子对接结果显示核心成分与靶点之间具有一定的结合活性。结论:四妙勇安汤可通过多成分、多靶点、多通路治疗DF,发挥其抗炎、抗氧化等作用,为复方治疗DF提供参考。  相似文献   

5.
目的:基于网络药理学方法与分子对接技术研究肉豆蔻治疗抑郁症的作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台TCMSP,获得肉豆蔻的活性成分和作用靶点;利用Uniprot数据库构建中药-成分-靶点网络;从GeneCards、OMIM、DrugBank数据库获得抑郁症疾病靶点、肉豆蔻及抑郁症共有靶点;通过Venny 2.1.0平台、String平台进行肉豆蔻与抑郁症共同靶点相互作用分析;利用Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白互作(PPI)网络,采用Metascape平台对核心靶点进行基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;采用分子对接技术确定肉豆蔻有效成分作用于抑郁症的核心靶点。结果:获得42个潜在作用靶点。乙酰胆碱酯酶(ACHE)、钠依赖性血清素转运体(SLC6A4)、一氧化氮合酶(NOS3)、Alpha-2A肾上腺素能受体(ADRA2A)可能是肉豆蔻治疗抑郁症的核心基因。肉豆蔻作用于抑郁症的通路涉及神经受体相互作用、钙信号通路。分子对接技术验证了肉豆蔻有效成分中的β-谷甾醇与潜在靶点ACHE和NOS3具有较好的结合活性。结论:肉豆蔻的主要活性成分β-谷甾醇可能通过作用于ACHE等多个靶点来调控神经受体相互作用、钙信号通路等多条信号通路,从而发挥抗抑郁作用。  相似文献   

6.
目的:基于网络药理学方法,探究肝复方有效活性物质治疗肝癌的相关作用靶点及潜在分子机制。方法:通过检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及国内外文献筛选出肝复方药味中的化合物以及相关靶点蛋白。通过GeneCards数据库获取肝癌相关疾病靶点。运用Cytoscape 3.2.1软件构建“药物-有效成分-靶点”网络、蛋白相互作用(PPI)网络,并通过网络拓扑分析筛选出核心靶点。最后,通过DAVID进行基因本体(GO)和KEGG信号通路富集分析。结果:通过口服生物利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18的筛选获得有效成分104种,药物对应的靶点1135个,肝癌相关靶点16490个;豆甾醇、人参皂苷、β-谷甾醇为主要核心成分;白细胞介素6(IL-6)、表皮生长因子受体(EGFR)、胱天蛋白酶3(CASP3)为关键靶点。结论:肝复方治疗肝癌具有多成分、多靶点、多通路的作用特点,其作用机制可能是通过IL-6、血管内皮生长因子(VEGF)A、EGFR、CASP3等核心靶点来调节,涉及VEGF、PI3K-Akt与p53等相关信号通路。本研究应用网络药理学预测肝复方治疗肝癌的分子机制,为其临床应用提供了理论依据。  相似文献   

7.
目的:通过网络药理学探析虎地肠溶胶囊治疗溃疡性结肠炎(UC)的作用机制。方法:基于TCMSP和台湾中医药数据库筛查药物的潜在活性成分及靶点;采用GeneCards数据库获取UC的已知靶点,运用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图;应用DAVID数据库对共同靶点基因进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过Cytoscape 3.7.2软件和R语言软件对数据进行可视化。结果:虎地肠溶胶囊治疗UC的活性成分143种,关键成分包括山柰酚、β-谷甾醇、槲皮素等;潜在作用靶点69个,主要有肿瘤蛋白P53(TP53)、原癌基因蛋白(MYC)、胱天蛋白酶3(CASP3)、人雌激素受体α(ESR1)等靶基因。晚期糖基化产物-晚期糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路。GO功能富集分析结果显示主要涉及DNA转录调控、RNA聚合酶Ⅱ特异性、核受体调控、单加氧酶活性、氧化还原反应等。KEGG通路富集分析结果显示主要涉及疾病相关信号通路、炎症相关信号通路和细胞凋亡信号通路。结论:虎地肠溶胶囊的多种活性成分具有从多靶点、多通路治疗UC的作用,为临床研究提供新思路。  相似文献   

8.
目的:基于网络药理学方法探讨党参治疗2型糖尿病(T2DM)的潜在作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP)及OMIM、TTD、Drugbank等网络数据库分别获取药物有效成分、活性靶点、疾病靶点,并取药物成分和疾病的交集靶点,构建药物活性成分与关键靶点网络、蛋白质相互作用(PPI)网络,并对靶蛋白进行GO富集分析和KEGG通路分析。结果:得到药效活性成分21种,药物靶点108个,T2DM靶点2402个,两者匹配映射得到关键靶点28个。党参治疗T2DM的主要成分为木樨草素、7-甲氧基-2-甲基-异黄酮、豆甾醇、黄豆黄素等,关键靶点为白细胞介素-6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、过氧化物酶体增殖物激活受体r(PPARG)等,关键的生物学进程包括药物反应、葡萄糖稳态;关键通路为PI3K-Akt 信号通路、AMPK信号通路、FoxO信号通路、胰岛素抵抗。结论:党参治疗T2DM具有多成分、多靶点、多途径的特点。  相似文献   

9.
目的:基于网络药理学研究香附治疗女性青春期后痤疮的作用机制。方法:通过TCMSP数据库获取香附的活性成分与相应靶点,采用GeneCard数据库获得与痤疮相关的疾病靶点,使用STRING数据库和Cytoscape 3.7.1软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,应用Bioconductor数据库进行基因本体(GO)功能、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:香附的有效活性成分共18种,痤疮相关靶点570个,潜在靶点21个,药物-疾病靶点21个。PPI 网络显示,白细胞介素-6、血管内皮生长因子A、白三醇过氧化物酶体增殖物激活受体γ、表皮生长因子受体、白三烯醇雌激素受体的连接程度最高。GO功能富集分析结果显示,交集基因主要参与了整合素结合、核受体活性、配体激活转录因子活性、ATP酶结合等。KEGG通路主要涉及脂质与动脉粥样硬化、流体剪切应力与动脉粥样硬化、肿瘤坏死因子信号通路、磷脂酰肌醇-3激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路等。结论:香附可通过调节多种生物学功能和各项通路治疗女性青春期后痤疮,为临床运用香附治疗女性青春期后痤疮提供了理论支持。  相似文献   

10.
目的:基于网络药理学探讨养心定悸膏抗心律失常的分子机制。方法:检索TCMSP、BATMAN-TCM等数据库及国内外文献,筛选获得活性成分及其对应靶点;检索GeneCards、OMIM等数据库获得疾病相关靶点;采用STRING分析靶点蛋白的互作关系;利用Cytoscape 3.9.1软件构建并合并活性成分靶点及疾病靶点相互作用关系网络,通过网络拓扑分析筛选出关键基因,并对核心靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:检索到139种活性成分,预测靶点780个,疾病靶点5066个,交集靶点412个,核心靶点10个,包括胰岛素(INS)、血管内皮生长因子α(VEGFA)、胱氨酸蛋白酶3(CASP3)、白蛋白(ALB)、活化蛋白-1的转录因子(JUN)等。GO功能富集分析得到对无机物的反应、神经递质受体活性、突触膜等条目。获得KEGG信号通路222条,主要包括神经活性配体-受体相互作用、神经退行性变、cGMP-PKG等。结论:本研究揭示了养心定悸膏可通过多成分、多靶点作用于神经活性配体-受体相互作用,钙、氨基酸代谢,cGMP-PKG等多通路治疗心律失常。  相似文献   

11.
营口市海水浴场资源环境容量分析   总被引:1,自引:1,他引:0       下载免费PDF全文
营口市位于辽宁省的中南部,面对渤海的辽东湾,背依鞍山市平原丘陵,东邻辽东崇山峻岭,西接盘锦市沿海平原,有辽河蜿蜒人海,海岸线绵延曲折。由于受海洋、河流的影响.营口市四季分明,气候宜人,蕴藏着丰富的滨海旅游资源,海蚀景观、地质珍迹、人文景观等资源各显异彩;尤其是海水浴场,条件极为优越,与国际上一流的海水浴场相比.毫不逊色,在某些特征上还稍胜一筹。  相似文献   

12.
A method for the estimation of the results of reconstruction of the trajectories of drifting buoys is proposed. It is based on the comparison of the estimates of power spectral densities for the components of current velocity computed according to three data sets: the data set of the coordinates of a drifting buoy with a built-in GPS receiver, the data set of coordinates formed on the basis of the first set but with data missing and observational errors corresponding to the actual trajectory measurements by the Argos satellite location and data collection system by the Doppler method, and the data set of coordinates obtained as a result of interpolation of the second set. As an example, we consider the procedure of realization of the proposed method and demonstrate the efficiency of its application for the improvement of the reliability of reconstruction of the trajectories of drifting buoys.  相似文献   

13.
An attempt has been made to estimate the fishery potentials of the EEZ of India on the basis of data on primary and secondary production. The total column primary production and zooplankton production have been calculated to be 265·9 and 9 million tonnes of carbon per year, respectively. From these values the fishery potential has been estimated as 2·5 million tonnes per year. To this, if we add the estimated demersal fish catch, being 1·2 million tonnes per year, the total potential yield comes to 3·7 million tonnes per year. Since the present average total catch is about 1·6 million tonnes in a year, the fish catch could be doubled.  相似文献   

14.
韩国的海岸带综合管理   总被引:4,自引:0,他引:4       下载免费PDF全文
1992年,联合国21世纪议程提出了综合管理的概念,并认为它是海岸管理的最重要目标,而海岸管理的目的就是改进业已存在的管理实践的效率和效果。在21世纪议程的实施过程中,沿海国家面临着巨大的困难,即:为了使综合管理在实践中具有可操作性而建立适合的政府机构。韩国正是在国家范围和次一级区域进行这项工作的实验场所。这项工作的最重要成就是在1996年成立了具有综合协调各涉海部门职能的韩国海洋事务与渔业部(MOMAF)。这篇文章的内容主要来自于这些观察,即韩国政府为建立海岸带综合机制而进行了各种努力,特别是1992年联合国环发大会召开后到1997年初海洋事务与渔业部成立了海岸带管理处这段时间里开展的各种工作,文章重点在于评价在建立海岸带综合机制的过程中综合的概念是如何被应用并被挑战的。文章提出了在东亚地区沿海国家开展合作的可能区域的建议。  相似文献   

15.
天然气水合物地球化学特征   总被引:4,自引:0,他引:4  
天然气水合物是在低温、高压以及有足够气体供应条件下形成的一种天然气(主要为甲烷)与水组成的似冰状固态化合物。天然气水合物中包含的甲烷碳是全球甲烷资源的重要组成部分,是一种数量巨大的潜在能源[1]。而且由于甲烷的温室效应,天然气水合物分解释放的甲烷进入大气中会严重  相似文献   

16.
介绍了海鸟系列温盐深测量仪(CTD)原始数据预处理的方法和步骤,解释各个过程中的原理,根据规范和工作实际对处理过程中存在的问题进行分析,提出解决方案,针对资料的标准化提出建议和意见。  相似文献   

17.
18.
We use many-year archival observations of hydrologic and hydrobiologic state of the Sea of Azov for the identification of the structure of a model of its ecosystem. The ecosystem model, supplemented with expert estimates of bioresource consumption (fish reserve), contamination level, and possible ecologic fines for violation of the sea natural state, is formalized by the method of system dynamics. Hereat, the major part of influence functions is found in terms of observational data with application of self-organization algorithms. We also present the results of simulated experiments with the model of the ecosystem, which enable us to analyse scenarios of its behaviour under the influence of various external factors (wind, river discharge, water exchange with the Black Sea, etc.). Translated by Peter V. Malyshev and Dmitry V. Malyshev  相似文献   

19.
Values of root mean square slope 0 and its variations -0 are estimated using the brightness field of an image of the surface of the sea near a speck of light. When 0 and -0 are defined it is highly important to take into account direct as well as dissipated solar radiation.The space-time analysis of the structure of the image brightness field is performed. This gives an opportunity to estimate dispersion relationship and the running effect of a brightness contrast packet. Comparison of the parameters obtained with the theoretical dispersion ratio of internal waves (IW) allows one to make a conclusion that IW surface manifestations are recorded in a frame.UDK 551.463.5  相似文献   

20.
The methods of perturbation theory and integral representations are used to analyze the general properties of a system of equations of the mechanics of inhomogeneous fluids including the equations of momentum, mass, and temperature transfer. We also consider various submodels of this system, including the reduced systems in which some kinetic coefficients are equal to zero and degenerate systems in which the variations of density or some other variables are neglected. We analyze both regularly perturbed and singularly perturbed solutions of the system. In the case of reduction or degeneration of solutions, the order of the system decreases. In this case, regularly perturbed solutions are preserved (with certain modifications) but the number of singularly perturbed components participating in the formation of the boundary layers on contact surfaces and their analogs in the bulk of the fluid, i.e., the elongated high-gradient interlayers, decreases. The interaction between all components of the currents is nonlinear, despite the fact that their characteristic scales are different.  相似文献   

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