刺激隐核虫ADP/ATP 载体蛋白基因的克隆和分子特征分析 |
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引用本文: | 刘 程,倪 炜,郭果为,原丽平,陈金铃,徐 阳,叶忠锋,王正朝,黄晓红.刺激隐核虫ADP/ATP 载体蛋白基因的克隆和分子特征分析[J].海洋科学,2014,38(1):44-51. |
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作者姓名: | 刘 程 倪 炜 郭果为 原丽平 陈金铃 徐 阳 叶忠锋 王正朝 黄晓红 |
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作者单位: | 福建师范大学 生命科学学院, 福建省发育与神经生物学重点实验室;福建师范大学 生命科学学院, 福建省发育与神经生物学重点实验室;福建师范大学 生命科学学院, 福建省发育与神经生物学重点实验室;福建师范大学 生命科学学院, 福建省发育与神经生物学重点实验室;福建师范大学 生命科学学院, 福建省发育与神经生物学重点实验室;福建师范大学 生命科学学院, 福建省发育与神经生物学重点实验室;福建师范大学 生命科学学院, 福建省发育与神经生物学重点实验室;福建师范大学 生命科学学院, 福建省发育与神经生物学重点实验室;福建师范大学 生命科学学院, 福建省发育与神经生物学重点实验室 |
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基金项目: | 福建省自然科学基金项目(2008J0004, 2010J01145); 国家自然科学基金项目(31040084); 福建省人才建设项目 |
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摘 要: | 刺激隐核虫(Cryptocaryon irritans)是严重危害海水鱼类的寄生纤毛虫,为了对其进行分子水平的研究,采用SMART技术构建了刺激隐核虫滋养体期的cDNA文库,并随机挑取克隆做EST测序,获得大量克隆的基因。从中挑选ATP/ADP载体蛋白基因同源物(CiAAC)的克隆进一步测序获得全长的cDNA序列。该序列全长为1029bp,包含编码287个氨基酸的开放阅读框。用RT-PCR分析了其在刺激隐核虫各时期的表达情况,并应用生物信息学分析方法,对CiAAC基因进行不同物种的系统进化树分析、功能区分析、物理性质分析、疏水性分析、跨膜结构域预测、亚细胞定位、二级结构预测等等。结果表明:CiAAC蛋白在刺激隐核虫各时期均有表达;据预测,它为六次跨膜蛋白,与卵形肠虫(Nyctotherus ovalis)的ADP/ATP载体蛋白的同源性最高,相似性达65%;蛋白为疏水性,并定位于刺激隐核虫的细胞质中。随后实验中通过对基因的定点诱变,将纤毛虫的非通用密码进行改造后,构建了pGEX-4T-1/CiAAC表达载体。以上实验为病原生物刺激隐核虫CiAAC载体蛋白的研究及应用提供了基础资料。
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关 键 词: | 刺激隐核虫(Cryptocaryon irritans) ATP/ADP载体蛋白 分子特征 |
收稿时间: | 2012/6/29 0:00:00 |
修稿时间: | 2012/9/28 0:00:00 |
Cloning and molecular characterization of ADP/ATP carrier from Cryptocaryon irritans |
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Abstract: | |
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Keywords: | Cryptocaryon irritans ADP/ATP carrier molecular characterization |
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