| 基于线粒体COI基因序列的4个海域口虾蛄群体的遗传多样性研究 |
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| 引用本文： | 董 鑫,邢 坤,隋宥珍,刘海映. 基于线粒体COI基因序列的4个海域口虾蛄群体的遗传多样性研究[J]. 海洋科学, 2015, 39(7): 29-36 |
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| 作者姓名： | 董 鑫 邢 坤 隋宥珍 刘海映 |
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| 作者单位： | 大连海洋大学 海洋科技与环境学院,大连海洋大学 海洋科技与环境学院,大连海洋大学 海洋科技与环境学院,大连海洋大学 海洋科技与环境学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(41006079); 辽宁省特色产业基地计划产业化项目(2010416022); 浙江省近岸水域生物资源开发与保护重点实验室开放基金(J2012009) |
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| 摘 要： | 为比较中国不同海域口虾蛄(Oratosqilla oratoria)群体的遗传特性, 作者对采自皮口、绥中、青岛和广州4 个海域的口虾蛄群体的线粒体COI基因序列进行扩增和测序, 比较并分析了其遗传多样性和系统进化关系。获得585bp 的口虾蛄线粒体COI基因序列, 发现变异位点54 个, 占总位点数的9.2%。COI基因序列A+T 含量(64.8%)显著高于G+T 含量(35.2%), 符合节肢动物线粒体DNA 碱基组成的特点。转换与颠换的平均比值是7.84, 碱基替换未达到饱和。100 个样本的线粒体COI基因序列共定义35 个单倍型, 单倍型多样性(Hd)为0.9162, 平均核苷酸多样性(π)为0.0203。4 个群体均具有高的单倍型多样性和低的核苷酸多样性的特点, 说明4 个海域口虾蛄的遗传多样性均处于中等水平, 但广州海域的遗传多样性水平最高。AMOVA 分析表明, 来自于群体间的遗传差异(84.53%)明显高于来自群体内的差异(15.47%)。遗传分化系数(Fst)表明皮口、绥中、青岛3 个海域间几乎没有发生分化(Fst<0), 而广州海域口虾蛄遗传分化较大。从GenBank 上下载了19 条粤东海域口虾蛄的同源序列与本实验获得序列共同构建NJ 系统发育树, 结果显示皮口、绥中、青岛聚为一支, 广州和粤东(深圳和汕尾)聚为另一支。单倍型系统发育树和单倍型进化网络关系图均显示出广州海域口虾蛄群体较大的遗传分化。
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| 关 键 词： | 口虾蛄(Oratosqilla oratoria) 线粒体COI 遗传多样性 系统发育 |
| 收稿时间： | 2014-04-12 |
| 修稿时间： | 2014-06-22 |
Genetic diversity of Oratosqilla oratoria from four sea waters based on the mitochondrial COI gene sequences analysis |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Oratosqilla oratoria COI gene genetic diversity phylogeny |
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