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| 基于FIASCO技术的合浦珠母贝微卫星标记分离与筛选研究 | |
| 引用本文： | 曲妮妮,龚世园,黄桂菊,童金苟,喻达辉.基于FIASCO技术的合浦珠母贝微卫星标记分离与筛选研究[J].热带海洋学报,2010,29(3). |
| 作者姓名： | 曲妮妮 龚世园 黄桂菊 童金苟 喻达辉 |
| 作者单位： | 1. 中国水产科学研究院南海水产研究所,广东,广州,510300;华中农业大学水产学院,湖北,武汉,430070 2. 华中农业大学水产学院,湖北,武汉,430070 3. 中国水产科学研究院南海水产研究所,广东,广州,510300 4. 中国科学院水生生物研究所,湖北,武汉,430072 |
| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划("863")项目，国家科技支撑计划项目，广东省科技计划项目 |
| 摘 要： | 用FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing Repeats)技术开展了合浦珠母贝Pinctada fucata基因组微卫星标记的分离与筛选研究.合浦珠母贝基因组DNA经限制性内切酶MseI酶切后与接头连接, 用生物素标记的(CA)15探针与其杂交, 然后用磁珠富集、洗脱获得单链目的片段, 经PCR扩增后形成双链, 最后进行克隆转化, 构建微卫星富集文库.挑选克隆用探针引物(CA)15 和载体引物进行第2次筛选, 获得阳性克隆357个, 测序结果表明, 297个克隆(83.2%)含有微卫星序列, 包括479个微卫星DNA结构域.其中完美型微卫星有370个(77.3%), 非完美型95个(19.8%), 复合型14个(2.9%).合成引物49对, 有31对(63%)扩增出目的产物, 其中9 对在种群中(n=32)具有扩增多态性, 其多态信息含量PIC值在0.375―0.809之间, 平均为0.536;等位基因数在2―9个之间, 平均为4.889个;观测杂合度介于0.200―0.600之间, 平均为0.415;期望杂合度的变化范围为0.454―0.844, 平均为0.598.表明FIASCO技术适合于合浦珠母贝微卫星标记的分离与筛选. |
| 关 键 词： | FIASCO法 合浦珠母贝Pinctada fucata 微卫星标记 分离与筛选 |
Isolation and screening of microsatellite markers from the Chinese pearl oyster Pinctada fucata based on FIASCO |
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| QU Ni-ni,GONG Shi-yuan,HUANG Gui-ju,TONG Jin-gou,YU Da-hui.Isolation and screening of microsatellite markers from the Chinese pearl oyster Pinctada fucata based on FIASCO[J].Journal of Tropical Oceanography,2010,29(3). | |
| Authors: | QU Ni-ni GONG Shi-yuan HUANG Gui-ju TONG Jin-gou YU Da-hui |
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