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广西文蛤(Meretrix)的fAFLP 及ITS 分析
引用本文:林志华,黄晓婷,董迎辉,包振民,胡景杰. 广西文蛤(Meretrix)的fAFLP 及ITS 分析[J]. 海洋与湖沼, 2009, 40(1): 33-41
作者姓名:林志华  黄晓婷  董迎辉  包振民  胡景杰
作者单位:1. 浙江万里学院,宁波,315100;浙江省海洋水产养殖研究所,温州,325005
2. 中国海洋大学,青岛,266003
3. 浙江万里学院,宁波,315100
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划),浙江省科技厅重大科技攻关计划,国家科技基础条件平台建设计划 
摘    要:利用fAFLP标记技术和PCR-RFLP技术,对采集于广西的形态和壳色变异很大的2个文蛤群体(G、W)以及山东文蛤(S)群体进行了遗传结构和亲缘关系研究.fAFLP分析显示:在457个总扩增位点中存在53个W群体的特异性位点(其中9个为100%显性)、21个G群体的特异性位点、14个S群体的特异性位点,这些位点可作为群体鉴别的特征性标记;通过计算群体间相对遗传距离和聚类分析,发现S和G间的遗传距离最小(0.0424),在系统树上首先聚在一起,而W与S、G的相对遗传距离均很大(0.2308和0.2305),单独分出一支.对文蛤核糖体ITS的PCR-RFLP结果显示:W的三个不同壳色类群(WX、WC、WH)的酶切结果完全一致,而与G和S群体差别较大;G和S群体基本一致,但也稍有差别.进一步的ITS序列分析显示:W的ITS序列长度为1266-1269bp.而G和S分别为1614bp和1520bp;W群体内部序列比较保守,而与G和S群体之间在ITSl和ITS2开始和结尾处均存在多处插入/缺失;在依据序列构建的系统树上,WX、WC、WH三个类群聚在一起,S和G聚为另一支,两支相距甚远.本研究结果表明,fAFLP标记分析、PCR-RFLP分析和ITS序列分析结果一致,W群体和G、S群体的差异较大,已超出种内群体间的遗传变异,S和G尽管存在遗传分化,但仍应同属Meretrix meretrix-个物种.

关 键 词:文蛤  遗传结构  亲缘关系
收稿时间:2008-09-17
修稿时间:2008-11-25

ANALYSIS OF MERETRIX CLAMS FROM GUANGXI BASED ON fAFLP MARKERS AND ITS SEQUENCES
LIN Zhi-Hu,HUANG Xiao-Ting,DONG Ying-Hui,BAO Zhen-Min and HU Jing-Jie. ANALYSIS OF MERETRIX CLAMS FROM GUANGXI BASED ON fAFLP MARKERS AND ITS SEQUENCES[J]. Oceanologia Et Limnologia Sinica, 2009, 40(1): 33-41
Authors:LIN Zhi-Hu  HUANG Xiao-Ting  DONG Ying-Hui  BAO Zhen-Min  HU Jing-Jie
Affiliation:1.Zhejiang Wanli University;Ningbo;315100;2.Zhejiang Mariculture Research Institute;Wenzhou;325005;3.Ocean University of China;Qingdao;266003
Abstract:The taxonomy of genus Meretrix has been in argument over several discrepancies among scientists in the world for a long while.Two groups of Meretrix clam(G & W) existed much variance on shell shape,color and pattern were collected from Beihai,Guangxi Province.One kind of Meretrix clam(G) is similar in shell color and pattern to Meretrix meretrix widely distributed in China costal region,another(W) is white color and convex in shell width.Genetic relation-ship between G and W was addressed by the fAFLP and P...
Keywords:fAFLP  ITS  PCR-RFLP
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