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五种/株原甲藻核糖体小亚基(18S rRNA)基因克隆及序列分析
引用本文:王波,米铁柱,吕颂辉,孙军,李秀芹,甄毓,李荣秀,于志刚. 五种/株原甲藻核糖体小亚基(18S rRNA)基因克隆及序列分析[J]. 海洋与湖沼, 2006, 37(5): 450-456
作者姓名:王波  米铁柱  吕颂辉  孙军  李秀芹  甄毓  李荣秀  于志刚
作者单位:中国海洋大学,青岛,266003;暨南大学水生生物研究所,广州,510632;中国科学院海洋研究所,青岛,266071;上海交通大学,上海,200030
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划)项目,2001AA635090号,国家重点基础研究发展规划(973)项目,2001CB409704号,山东省优秀中青年科学家科研奖励基金,01BS08号
摘    要:采用分子克隆及序列比对的方法,对五种/株赤潮原甲藻18SrRNA基因全长序列进行扩增、克隆和序列测定,并从GenBank上下载13个原甲藻18SrRNA基因接近全长的序列,用NJ法和ME法构建了原甲藻属的系统树。结果表明,五种/株原甲藻18SrRNA基因扩增序列长度为1782—1783bp,其中来自南海(中国海域)和来自美国海域的两株微小原甲藻(Prorocentrumminimum)的序列完全一致;东海的赤潮原甲藻(Prorocentrumsp·)与具齿原甲藻(P·dentatum)的序列也完全一致,与微小原甲藻只有5个碱基的差异;而海洋原甲藻(P·micans)与微小原甲藻和具齿原甲藻的序列差异较大,分别为27个和28个碱基。通过NJ法和ME法构建的系统树基本一致。由系统树可以看到:原甲藻属大致分为两支,本实验的微藻全部分布在同一支上。18SrRNA基因序列还将有助于有害赤潮藻快速鉴定的特异性分子探针的研制。

关 键 词:原甲藻属  18SrRNA基因  系统分析
收稿时间:2005-08-16
修稿时间:2005-12-04

CLONING AND SEQUENCES ANALYSIS OF 18S rRNA GENE OF FIVE PROROCENTRUM SPECIES/STRAINS
WANG Bo,MI Tie-Zhu,Lv Song-Hui,SUN Jun,LI Xiu-Qin,ZHEN Yu,LI Rong-Xiu and YU Zhi-Gang. CLONING AND SEQUENCES ANALYSIS OF 18S rRNA GENE OF FIVE PROROCENTRUM SPECIES/STRAINS[J]. Oceanologia Et Limnologia Sinica, 2006, 37(5): 450-456
Authors:WANG Bo  MI Tie-Zhu  Lv Song-Hui  SUN Jun  LI Xiu-Qin  ZHEN Yu  LI Rong-Xiu  YU Zhi-Gang
Affiliation:WANG Bo,MI Tie-Zhu,L(U) Song-Hui,SUN Jun,LI Xiu-Qin,ZHEN Yu,LI Rong-Xiu,YU Zhi-Gang
Abstract:
Keywords:Prorocentrum   18S rRNA gene   Phylogenetic analysis
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