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碱蓬PEPCase基因的克隆与分析
引用本文:陈明娜,杨庆利,禹山林,秦 松. 碱蓬PEPCase基因的克隆与分析[J]. 海洋科学, 2009, 33(6): 67-72
作者姓名:陈明娜  杨庆利  禹山林  秦 松
作者单位:山东省花生研究所,山东,青岛,266100;中国科学院,海洋研究所,山东,青岛,266071
摘    要:采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术首次获得碱蓬(Suaeda glauca)中含PEPCase基因完整编码区的cDNA序列,长度为3 038 bp.获得的序列采用生物信息学方法和系统进化方法进行分析.结果表明,获得的cDNA序列包含2 898 bp的完整开放阅读框,编码的966个氨基酸序列含有两个PEPCase活性位点以及6种其他的活性位点;预测蛋白质的相对分子质量为109 785.3,等电点为5.51,属于不稳定的亲水性蛋白;含量相对较多的氨基酸是Leu、Glu、Arg、Asp、Ser,不含Pyl和Sec;不包含跨膜结构和信号肽序列,推断为非分泌性蛋白;二级结构以α螺旋为主,三级结构为紧密球状结构;分析结果还表明获得的碱蓬PEPCase基因应该属于C3型.通过对碱蓬PEPCase基因的克隆及序列分析从而为后期碱蓬PEPCase蛋白表达的研究及获得高油量的转基因碱蓬植株奠定了基础.

关 键 词:碱蓬(Suaeda glauca)  磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因(PEPCase基因)  RACE  基因克隆  序列分析
收稿时间:2008-10-30
修稿时间:2008-12-30

Cloning and analysis of phosphoenolpyruvate carboxylase gene from Suaeda glauca
CHEN Ming-n,YANG Qing-li,YU Shan-lin and QIN Song. Cloning and analysis of phosphoenolpyruvate carboxylase gene from Suaeda glauca[J]. Marine Sciences, 2009, 33(6): 67-72
Authors:CHEN Ming-n  YANG Qing-li  YU Shan-lin  QIN Song
Abstract:
Keywords:RACE
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