| 川纹笛鲷消化道优势菌群PCR-DGGE指纹图谱比较分析 |
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| 引用本文： | 周志刚,石鹏君,姚 斌,何夙旭,苏永全. 川纹笛鲷消化道优势菌群PCR-DGGE指纹图谱比较分析[J]. 海洋科学, 2008, 32(11): 9-12 |
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| 作者姓名： | 周志刚 石鹏君 姚 斌 何夙旭 苏永全 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院,饲料研究所,北京,100081;汕头大学,海洋生物研究所,广东,汕头,515063;中国农业科学院,饲料研究所,北京,100081;厦门大学,海洋与环境学院,福建,厦门,361005 |
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| 基金项目： | 国际科技合作重点项目(2004DF100229); 中国博士后科学基金项目(2005037625); 淡水生态与生物技术国家重点实验室开放课题(2005FB05); 广东省自然科学基金项目(05300945) |
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| 摘 要： | 采用免培养的16S rDNA梯度凝胶电泳技术（DGGE）对集约化海水网箱养殖川纹笛鲷（Lutjanus sebae）的消化道胃壁、胃内容物、肠壁、肠内容物优势菌群结构进行了比较分析。研究结果显示，川纹笛鲷消化道存在着丰富多样的细菌群落，对DGGE指纹图谱聚类分析表明菌群组成相似度高于55％，其中胃内容物及胃壁细菌组成相似度最高（90％），这可能与摄食饵料在消化道推移有关；而胃壁与肠壁相似度相对最差，可能反应了由于生理环境不同引起的宿主差异性。通过建立川纹笛鲷消化道16S rDNA-DGGE指纹图谱及比较分析，为澄清川纹笛鲷消化道微生物区系奠定了基础。
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| 关 键 词： | 川纹笛鲷(Lutjanus sebae) 16S rDNA 梯度凝胶电泳 指纹图谱 |
| 收稿时间： | 2005-12-06 |
| 修稿时间： | 2008-09-12 |
Comparison of the PCR-DGGE fingerprints in the gastrointestinal predominant bacterial community in Lutjanus sebae |
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| ZHOU Zhi-gang,SHI Peng-Jun,YAO Bin,HE Su-xu,SU Yong-quan. Comparison of the PCR-DGGE fingerprints in the gastrointestinal predominant bacterial community in Lutjanus sebae[J]. Marine Sciences, 2008, 32(11): 9-12 |
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| Authors: | ZHOU Zhi-gang SHI Peng-Jun YAO Bin HE Su-xu SU Yong-quan |
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| Abstract: | The comparison of the predominant bacterial community structure in the gastro-intestine in Lutjanus sebae based on 16S rDNA PCR-DGGE fingerprint using a culture-independent method was conducted in present research.The results showed that abundant bacterium existed in the gastro-intestine of Lutjanus sebae,the similarity was above 55% in the community structures in the gastro-intestine with the highest similarity of 90% in the bacteria ingredients between the stomach wall and the sto-mach content,which might... |
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| Keywords: | Lutjanus sebae 16S rDNA DGGE fingerprint |
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