| 黑潮源区沉积物微生物多样性初步研究 |
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| 引用本文： | 魏玉利,王鹏,赵美训,张传伦. 黑潮源区沉积物微生物多样性初步研究[J]. 地球科学进展, 2010, 25(2): 212-219. DOI: 10.11867/j.issn.1001-8166.2010.02.0212 |
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| 作者姓名： | 魏玉利 王鹏 赵美训 张传伦 |
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| 作者单位： | 1. 同济大学海洋地质国家重点实验室,上海,200092
2. 同济大学海洋地质国家重点实验室,上海,200092;Department of Marine Sciences,University of Georgia,Athens,GA 30602,USA |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金重点项目“南海冷泉区甲烷通量及其对海底环境与生态系统影响的生物地球化学研究”(编号:40730844);;国家“十一五”大洋专项基金项目“深部生物圈微生物活动在沉积物和间隙水中的地球化学记录研究”(编号:DYXM-115-02-2-17);;国家高技术研究发展计划重点课题“大洋钻探站位调查关键技术研究”(编号:2008AA093001)资助 |
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| 摘 要： | 从黑潮源区采集上层沉积物,进行DNA提取,以细菌和古菌的16S rDNA通用引物PCR扩增黑潮源区沉积物中细菌和古菌群落的16S rDNA,并构建细菌和古菌的16S rDNA文库,经限制性片段长度多态性分析(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP),DNA序列测定和系统发育分析,对黑潮源区表层沉积物的细菌和古菌多样性进行了研究。研究结果表明:黑潮源区细菌包括了变形杆菌(Proteobacteria)、酸杆菌(Acidbacterium)、浮霉菌(Planctanycene)、疣微菌(Verrucomicro-bia)和Candidate division OP8和拟杆菌(Bacteroidetes)共6个类群,其中变形杆菌是优势类群。古菌包括了泉古菌(Crenarchaeota)和广古菌(Euryarchaeota),其中泉古菌占优势;泉古菌包括MCG、C3、MBGA和MGI 4个类群,而广古菌包括SAGMEG、MBGE和MEG 3个类群,其中MBGE是优势类群。
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| 关 键 词： | 黑潮源区 16S rDNA 古菌 细菌 生物多样性 |
A Preliminary Study of Microbial Diversity of the Top Sediment from the MD06-3047 |
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| WEI Yuli,WANG Peng,ZHAO Meixun,ZHANG Chuanlun. A Preliminary Study of Microbial Diversity of the Top Sediment from the MD06-3047[J]. Advances in Earth Sciences, 2010, 25(2): 212-219. DOI: 10.11867/j.issn.1001-8166.2010.02.0212 |
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| Authors: | WEI Yuli WANG Peng ZHAO Meixun ZHANG Chuanlun |
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| Affiliation: | 1.State Key Laboratory of Marine Geology, Tongji University, Shanghai 200092, China;2.Department of Marine Sciences, University of Georgia, Athens, GA 30602, USA |
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| Abstract: | Total DNA was extracted from the top sediment layer(0-10 cm) of MD06-3047 in the Kuroshio and was used as template for polymerase chain reaction(PCR) amplification employing specific primers for bacterial and archaeal 16S rRNA genes.The 16S rDNA libraries were then constructed.Microbial diversity was analyzed by using restriction fragment length polymorphism(RFLP),DNA sequencing and phylogenetic analysis.The results show that there are six phyla in the Bacteria domain: Proteobacteria,Acidbacterium,Planctany... |
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| Keywords: | Kuroshio 16S rDNA Archaea Bacteria Microbial diversity. |
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