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环介导等温扩增联合横向流动试纸条快速检测扁浒苔(Ulva compressa)的研究
引用本文:陈先锋,周前进,王瑞娜,段维军,苗亮,陈炯. 环介导等温扩增联合横向流动试纸条快速检测扁浒苔(Ulva compressa)的研究[J]. 海洋与湖沼, 2015, 46(4): 819-827
作者姓名:陈先锋  周前进  王瑞娜  段维军  苗亮  陈炯
作者单位:宁波大学海洋学院 宁波 315211;宁波检验检疫科学技术研究院 宁波 315012,宁波大学海洋学院 宁波 315211,宁波大学海洋学院 宁波 315211,宁波检验检疫科学技术研究院 宁波 315012,宁波大学海洋学院 宁波 315211,宁波大学海洋学院 宁波 315211
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划),2012AA092001号;浙江省重大科技专项重点社会发展项目,2013C03045-1号。
摘    要:本研究将环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)与横向流动试纸条(lateral flow dipstick,LFD)的可视化检测方法结合,建立了扁浒苔(Ulva compressa)的LAMPLFD快速检测技术。该方法以扁浒苔的内转录间隔区(ITS1-5.8S-ITS2)序列为检测靶标,设计了3对特异性引物(其中,上游内引物由生物素标记)和1条异硫氰酸荧光素标记的探针。结果表明,LAMP最适反应温度为63°C,扩增时间为60 min,从核酸扩增到LFD结果判读需70 min。利用LAMP-LFD可特异性检出扁浒苔,对浒苔、曲浒苔、缘管浒苔和孔石莼等石莼属绿藻以及塔玛亚历山大藻、无纹环沟藻、东海原甲藻、锥状斯克里普藻和赤潮异弯藻等常见微藻的检测结果为阴性。该方法最低可检测到0.1 pg的扁浒苔基因组DNA,是以Uco ITS-F3和Uco ITS-B3为特异性引物的PCR方法的100倍。对实际样品的检测结果表明,LAMP-LFD方法检测扁浒苔与传统的形态学观察的结果一致。因此,该方法可快速、特异地检测出扁浒苔,而且操作简单,仪器设备依赖性低,有潜力成为扁浒苔现场检测的常规技术手段。

关 键 词:扁浒苔  环介导等温扩增  横向流动试纸条  内转录间隔区  检测
收稿时间:2015-02-06
修稿时间:2015-03-26

RAPID DETECTION OF ULVA COMPRESSA BY LOOP-MEDIATED ISOTHERMAL AMPLIFICATION COMBINED WITH LATERAL FLOW DIPSTICK
CHEN Xian-Feng,ZHOU Qian-Jin,WANG Rui-N,DUAN Wei-Jun,MIAO Liang and CHEN Jiong. RAPID DETECTION OF ULVA COMPRESSA BY LOOP-MEDIATED ISOTHERMAL AMPLIFICATION COMBINED WITH LATERAL FLOW DIPSTICK[J]. Oceanologia Et Limnologia Sinica, 2015, 46(4): 819-827
Authors:CHEN Xian-Feng  ZHOU Qian-Jin  WANG Rui-N  DUAN Wei-Jun  MIAO Liang  CHEN Jiong
Affiliation:School of Marine Science, NingboUniversity, Ningbo, 315211;Academy of Inspection and Quarantine, Ningbo, 315012,School of Marine Science, NingboUniversity, Ningbo, 315211,School of Marine Science, NingboUniversity, Ningbo, 315211,Academy of Inspection and Quarantine, Ningbo, 315012,School of Marine Science, NingboUniversity, Ningbo, 315211 and School of Marine Science, NingboUniversity, Ningbo, 315211
Abstract:
Keywords:Ulva compressa  loop-mediated isothermal amplification  lateral flow dipstick  ITS1-5.8S-ITS2  detection
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