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基于Cyt b基因序列的南海北部蓝圆鲹群体遗传多样性研究
引用本文:牛素芳,吴仁协,张丽艳,张浩冉,梁 锐,李忠炉. 基于Cyt b基因序列的南海北部蓝圆鲹群体遗传多样性研究[J]. 应用海洋学学报, 2018, 37(2): 263-273
作者姓名:牛素芳  吴仁协  张丽艳  张浩冉  梁 锐  李忠炉
作者单位:广东海洋大学水产学院;福建海洋研究所
基金项目:广东省自然科学基金-博士启动资助项目(2016A030310329);广东海洋大学优秀青年骨干教师培养计划资助项目(HDYQ2017002);广东海洋大学科研启动费资助项目(R17040);福建省属公益类科研院所基本科研专项资助项目(2017R1006-5);广东省自然科学基金资助项目(2016A030313752)
摘    要:为了解南海北部蓝圆鲹(Decapterus maruadsi)的群体遗传变异特征,本研究利用线粒体DNA Cyt b基因部分序列对9个群体共203个个体进行群体遗传多样性和遗传结构分析.结果显示:在722 bp长的Cyt b部分序列中,共检测出52个多态位点,定义25个单倍型;群体的单倍型多样性(h)为0.577±0.036,核苷酸多样性(π)为0.001 55±0.001 12,整体遗传多样性呈中等偏低水平,其中雷州半岛和海南岛以东5个群体的遗传多样性水平明显高于以西的4个北部湾群体.单倍型系统发育树和网络图均未表现出与地理位置相对应的谱系结构,单倍型网络图呈以主体单倍型为中心的星状结构.群体间的Fst值为-0.077~0.018,且统计检验均不显著(p0.05).分子方差分析(AMOVA)表明,遗传变异全部来源于群体内个体间.Tajima's D值和Fu's Fs值均为显著负值,核苷酸不配对分布呈明显的单峰分布.南海北部蓝圆鲹群体约在29 000a前可能发生过扩张事件,导致遗传多样性呈现高h、低π模式;9个群体间的遗传分化并不显著,符合是一个随机交配种群的假设,但9个群体的遗传多样性水平却表现出明显的地理趋势,提示将南海北部蓝圆鲹作为单一种群进行渔业管理需持谨慎态度.

关 键 词:海洋生物学;蓝圆鲹;南海北部;遗传多样性;Cyt b基因序列

Genetic diversity analysis of Decapterus maruadsi from northern South China Sea based on mitochondrial DNA Cyt b sequence
NIU Su-fang,WU Ren-xie,ZHANG Li-yan,ZHANG Hao-ran,LIANG Rui and LI Zhong-lu. Genetic diversity analysis of Decapterus maruadsi from northern South China Sea based on mitochondrial DNA Cyt b sequence[J]. Journal of Applied of Oceanography, 2018, 37(2): 263-273
Authors:NIU Su-fang  WU Ren-xie  ZHANG Li-yan  ZHANG Hao-ran  LIANG Rui  LI Zhong-lu
Abstract:
Keywords:marine biology   Decapterus maruadsi   northern South China Sea   genetic diversity   Cyt b gene sequence
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