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基于网络药理学与分子对接探讨天名精抗甲型流感病毒机制
引用本文:沈 瑶,吴智煌,冯 敏.基于网络药理学与分子对接探讨天名精抗甲型流感病毒机制[J].应用海洋学学报,2023,39(12):142.
作者姓名:沈 瑶  吴智煌  冯 敏
作者单位:湖南中医药大学,湖南 长沙,410208
摘    要:目的:基于网络药理学方法对天名精(CAL)抗甲型流感病毒(IAV)潜在化学成分、靶点及作用机制进行分析研究,为后续开发CAL提供参考依据。方法:从中国知网(CNKI)等数据库收集自1988年1月1日至2023年2月25日分离鉴定的CAL化学成分,在SwissTargetPrediction平台预测成分靶点。在GeneCards和OMIM平台收集IAV靶点,导入jvenn取交集基因。利用Cytoscape 3.8.2软件构建CAL-活性成分-IAV网络,在STRING平台分析蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)关系。结合运用DAVIED数据库和微生信平台进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。使用Autodock与Pymol软件将关键药物成分与核心靶点进行分子对接。结果:筛选获得主要潜在活性成分27种,潜在靶点468个,CAL与IAV交集靶点175个。GO功能分析获得97个细胞组分、664个生物过程和150个分子功能;KEGG通路富集分析获得CAL抗IAV信号通路共168条,包括高糖基化终产物-高糖基化终产物受体(AGE-RAGE)、癌症和IAV等通路。分子对接结果显示在前五种核心成分里面,熊果酸与丝裂原活化蛋白激酶(MAPK1)、淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶(LCK)、磷酸肌醇3-激酶调节亚基1(PIK3R1)、磷脂酰肌醇4,5-二磷酸3-激酶催化亚基α(PIK3CA)、非受体型酪氨酸蛋白激酶2(JAK2)、丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)有更高结合亲和力。结论:CAL作用于IAV可能涉及多成分、多靶点、多通路共同参与,通过网络药理学分析为CAL抗IAV进一步研究提供思路和方法,为新型抗甲流药物研发提供依据。

关 键 词:甲型流感病毒  天名精  网络药理学  分子对接

Mechanism of Carpesium abrotanoides L.exerting a therapeutic effect on influenza A virus: A study based on network pharmacology and molecular docking
SHEN Yao,WU Zhihuang,FENG Min.Mechanism of Carpesium abrotanoides L.exerting a therapeutic effect on influenza A virus: A study based on network pharmacology and molecular docking[J].Journal of Applied of Oceanography,2023,39(12):142.
Authors:SHEN Yao  WU Zhihuang  FENG Min
Abstract:
Keywords:
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