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淋巴囊肿病毒mcp基因变异特征及其基因型分析
引用本文:闫秀英,吴灶和,简纪常,鲁义善,孙修勤. 淋巴囊肿病毒mcp基因变异特征及其基因型分析[J]. 中国海洋大学学报(自然科学版), 2011, 41(4): 39-45
作者姓名:闫秀英  吴灶和  简纪常  鲁义善  孙修勤
作者单位:1. 广东海洋大学广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室,广东湛江,524025
2. 国家海洋局第一海洋研究所海洋生态研究中心,山东青岛,266061
基金项目:国家科技支撑计划项目(2007BAD29B05); 广东省科技计划重大专项(2008A020100014)资助
摘    要:淋巴囊肿病毒是引起多种海、淡水鱼淋巴囊肿病的病原,且不同淋巴囊肿病毒分离株间存在一定的差异。本文对25株淋巴囊肿病毒分离株mcp基因的变异特征进行分析,结果表明:分离自同一宿主的淋巴囊肿病毒mcp基因序列并非完全一致,有些同宿主分离株间存在着较少的变异,其MCP蛋白序列间的变异位点多位于不规则结构域、属于非蛋白相互作用位点;分属不同基因型淋巴囊肿病毒分离株MCP蛋白序列间的变异位点也多位于不规则结构域,变异位点为蛋白相互作用位点的比率仅占21.98%。金头鲷淋巴囊肿病毒分离株LCDV-sa是一种新的淋巴囊肿病毒基因型,此25株淋巴囊肿病毒可分为7个基因型。对淋巴囊肿病毒变异的研究,可加深对其感染机制的认识,有助于了解其传播途径,可为淋巴囊肿病的防控提供重要的理论依据。

关 键 词:淋巴囊肿病毒  mcp基因  变异  基因型

Sequence Variation in mcp Gene of Lymphocystis Disease Virus and the Genotype Analysis
YAN Xiu-Ying,WU Zao-He,JIAN Ji-Chang,LU Yi-Shan,SUN Xiu-Qin. Sequence Variation in mcp Gene of Lymphocystis Disease Virus and the Genotype Analysis[J]. Periodical of Ocean University of China, 2011, 41(4): 39-45
Authors:YAN Xiu-Ying  WU Zao-He  JIAN Ji-Chang  LU Yi-Shan  SUN Xiu-Qin
Affiliation:YAN Xiu-Ying1,WU Zao-He1,JIAN Ji-Chang1,LU Yi-Shan1,SUN Xiu-Qin2(1.Guangdong Key Laboratory of Pathogenic Biology and Epidemiology for Aquatic Economic Animals,Guangdong Ocean University,Zhanjiang 524025,China,2.First Institute of Oceanography SOA,Qingdao 266061,China)
Abstract:Lymphocystis disease virus(LCDV) can cause lymphocystis disease in more than 140 fish species in seawater and freshwater,and there is some variations among different strains.We analyzed the mcp gene sequence in 25 LCDV isolations,results showed not all of the mcp gene sequence in LCDV isolated from the same host is consistent.There are a few variant sites between different nucleotide acids among the mcp gene sequences of some LCDV isolated from the same host,these sites usually locate on the random coil,onl...
Keywords:lymphocystis disease virus  mcp gene  variation  genotype  
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