| 双壳贝类CK1基因家族的鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 孙凤芝,吕珍立,刘福云,邢强,连姗姗,王师,包立随. 双壳贝类CK1基因家族的鉴定及表达分析[J]. 海洋与湖沼, 2023, 54(5): 1401-1412 |
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| 作者姓名： | 孙凤芝 吕珍立 刘福云 邢强 连姗姗 王师 包立随 |
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| 作者单位： | 中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室 山东青岛 266003;中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室 山东青岛 266003;崂山实验室海洋生物学与生物技术功能实验室 山东青岛 266237;中国海洋大学热带海洋生物种质资源开发与种业工程中心 海南三亚 572000;中国海洋大学海洋生物多样性与进化研究所 山东青岛 266003 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目,2022YFD2400301号;山东省重点研发计划项目,2021ZLGX03号。 |
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| 摘 要： | 酪蛋白激酶1 (CK1)是一种重要的蛋白激酶家族,其在DNA损伤应答和修复、细胞增殖和凋亡、胚胎发育和稳态等重要的生物学过程中都具有复杂多样的调控作用。为了理解CK1基因家族在双壳贝类中的特征、进化及生物学功能,实验采用比较基因组学及生物信息学的方法对双壳贝类CK1基因家族进行了鉴定分析,通过虾夷扇贝高温应激实验,研究了CK1基因家族在高温应激时的表达规律。结果显示,在虾夷扇贝、栉孔扇贝、长牡蛎与侏儒蛤中均存在CK1α,CK1αlike,CK1δ,CK1γ3,并发现CK1ε,CK1γ1,CK1γ2在双壳贝类中发生了丢失。时空表达分析发现,双壳贝类CK1基因均在胚胎发育早期集中表达,并以多细胞/囊胚期为界呈现出母源/合子特异性表达模式。CK1为关键基因的基因共表达模块显著富集在错配修复、核苷酸剪切修复等相关通路上,暗示了CK1基因在双壳贝类胚胎发育过程中参与调控DNA损伤修复过程,从而维持早期胚胎发育时的基因组稳定性。双壳贝类CK1基因在成体中呈现组织特异的表达模式,主要在鳃和雄性性腺中具有相对较高的表达量。虾夷扇贝受到高温应激后,其鳃中PyCK1α, PyCK1αlike和PyCK1δ...
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| 关 键 词： | 双壳贝类 CK1基因家族 基因鉴定 表达分析 高温应激 |
| 收稿时间： | 2022-12-20 |
| 修稿时间： | 2023-02-28 |
GENOME-WIDE IDENTIFICATION AND EXPRESSION PROFILING OF THE CK1 GENE FAMILY IN BIVALVES |
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| SUN Feng-Zhi,LYU Zhen-Li,LIU Fu-Yun,XING Qiang,LIAN Shan-Shan,WANG Shi,BAO Li-Sui. GENOME-WIDE IDENTIFICATION AND EXPRESSION PROFILING OF THE CK1 GENE FAMILY IN BIVALVES[J]. Oceanologia Et Limnologia Sinica, 2023, 54(5): 1401-1412 |
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| Authors: | SUN Feng-Zhi LYU Zhen-Li LIU Fu-Yun XING Qiang LIAN Shan-Shan WANG Shi BAO Li-Sui |
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| Affiliation: | Ministry of Education (MOE) Key Laboratory of Marine Genetics and Breeding, Ocean University of China, Qingdao 266003, China;Ministry of Education (MOE) Key Laboratory of Marine Genetics and Breeding, Ocean University of China, Qingdao 266003, China;Laboratory for Marine Biology and Biotechnology, Laoshan Laboratory, Qingdao 266237, China;Laboratory of Tropical Marine Germplasm Resources and Breeding Engineering, Ocean University of China, Sanya 572000, China; Institute of Evolution & Marine Biodiversity, Ocean University of China, Qingdao 266003, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | bivalve CK1 gene family gene identification expression analysis heat stress |
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