| 副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)诱导拟穴青蟹(Scylla paramamosain)血淋巴cDNA 文库构建及表达序列标签初步分析 |
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| 引用本文： | 蔡小辉,彭银辉,赵 鹏,宋忠魁,张 琴,黄国强. 副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)诱导拟穴青蟹(Scylla paramamosain)血淋巴cDNA 文库构建及表达序列标签初步分析[J]. 海洋与湖沼, 2013, 44(3): 684-690 |
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| 作者姓名： | 蔡小辉 彭银辉 赵 鹏 宋忠魁 张 琴 黄国强 |
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| 作者单位： | 广西海洋研究所 广西海洋生物技术重点实验室 北海 536000 |
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| 基金项目： | 广西自然科学基金资助项目, 2010GXNSFA013079 号, 2012GXNSFAA053065 号; 广西科技攻关资助项目, 1114012-11 号; 南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室开放课题, 2011003 号; 国家海洋公益资助项目, 201205028-4 号。 |
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| 摘 要： | 利用SMART技术构建副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)诱导的拟穴青蟹(Scylla paramamosain)血淋巴cDNA文库。结果表明,该文库的滴度为1.04×107CFU/mL,文库总容量达1.144×107CFU,克隆子插入片段大小为500—2000bp,重组率达98%。将随机挑选的300个阳性克隆测序,经过质量控制和拼接,共得到141个单基因组簇(UniGenes),75个UniGenes与NCBI非冗余蛋白质数据库中登录的蛋白质序列存在显著相似性,其中20个与免疫防御相关,如kazal-like丝氨酸蛋白酶抑制剂类蛋白、kazal-type蛋白酶抑制剂arasin-like蛋白、抗内毒素因子、抗微生肽、金属硫蛋白、铁蛋白、类70kD热休克蛋白等,达总测序数的6.67%。研究结果证实,构建cDNA文库是获得拟穴青蟹免疫相关基因的可靠途径。
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| 关 键 词： | 拟穴青蟹 副溶血弧菌 cDNA文库 表达序列标签 |
| 收稿时间： | 2012-05-26 |
| 修稿时间： | 2012-07-30 |
CONSTRUCTION OF HAEMOLYMPH cDNA LIBRARY OF SCYLLA PARAMAMOSAIN INDUCED BY VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS AND ANALYSIS OF EXPRESSED SEQUENCE TAGs |
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| CAI Xiao-Hui,PENG Yin-Hui,ZHAO Peng,SONG Zhong-Kui,ZHANG Qin and HUANG Guo-Qiang. CONSTRUCTION OF HAEMOLYMPH cDNA LIBRARY OF SCYLLA PARAMAMOSAIN INDUCED BY VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS AND ANALYSIS OF EXPRESSED SEQUENCE TAGs[J]. Oceanologia Et Limnologia Sinica, 2013, 44(3): 684-690 |
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| Authors: | CAI Xiao-Hui PENG Yin-Hui ZHAO Peng SONG Zhong-Kui ZHANG Qin HUANG Guo-Qiang |
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| Affiliation: | Guangxi Institute of Oceanology, Key Laboratory of MarineBiotechnology of Guangxi;Guangxi Institute of Oceanology, Key Laboratory of MarineBiotechnology of Guangxi;Guangxi Institute of Oceanology, Key Laboratory of MarineBiotechnology of Guangxi;Guangxi Institute of Oceanology, Key Laboratory of MarineBiotechnology of Guangxi;Guangxi Institute of Oceanology, Key Laboratory of MarineBiotechnology of Guangxi;Guangxi Institute of Oceanology, Key Laboratory of MarineBiotechnology of Guangxi |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Scylla paramamosain Vibrio parahaemolyticus cDNA library Expressed sequence tags |
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