| 基于紫贻贝Mytilus galloprovincialis表达序列的核受体家族分析 |
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| 引用本文： | 李娟,李崇德.基于紫贻贝Mytilus galloprovincialis表达序列的核受体家族分析[J].海洋通报,2014,33(2):174-179. |
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| 作者姓名： | 李娟 李崇德 |
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| 作者单位： | 国家海洋局北海环境监测中心，山东青岛266033；中国科学院海洋研究所，山东青岛266071;国家海洋局北海海洋工程勘察研究院，山东青岛266033 |
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| 基金项目： | 中国博士后科学基金(2012M511553);海洋公益性行业科研专项(201005016-6) |
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| 摘 要： | 通过对紫贻贝(Mytilus galloprovincialis)公共数据库表达序列的整合分析,共获得29条核受体序列。通过DNA结合结构域(DBD)和配体结合结构域(LBD)的多序列比对,并采用贝叶斯推断法进行系统进化分析,推测其中19个核受体属于NR1亚家族,5个属于NR2亚家族,2个属于NR3亚家族,1个属于NR5亚家族。结果表明紫贻贝中存在HR96、E75、ROR、HNF4、RXR、TLL、SVP、ESR、ERR同源的核受体,并且具有新型的2DBD核受体。
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| 关 键 词： | 紫贻贝 核受体(核激素受体) 多序列比对 贝叶斯推断法 |
| 收稿时间： | 5/9/2013 12:00:00 AM |
| 修稿时间： | 2013/7/28 0:00:00 |
Analysis of nuclear receptor family from Mytilus galloprovincialis based on public data |
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