| 中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)基因组微卫星特征分析 |
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| 引用本文： | 高 焕,刘 萍,孟宪红,王伟继,孔 杰. 中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)基因组微卫星特征分析[J]. 海洋与湖沼, 2004, 35(5): 424-431 |
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| 作者姓名： | 高 焕 刘 萍 孟宪红 王伟继 孔 杰 |
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| 作者单位： | 1. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,青岛,266071;中国科学院海洋研究所,青岛,266071;中国科学院研究生院,北京,100039
2. 中国水产科学研究院黄海水产研究所,青岛,266071 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展规划 (973)资助项目 ,G19990 12 0 0 7号，国家高技术研究发展计划 (86 3)资助项目 ,2 0 0 3AA6 0 30 2 1号 |
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| 摘 要： | 对中国对虾基因组随机测序，获得了总长度约为641000个碱基的基因组DNA序列，从中找到1362个重复序列。其中，两碱基重复类型的重复数目最多(985个)，占重复序列总数目的72．32％；其次是三碱基(149个)和四碱基(102个)，分别占重复序列总数目的10．94％和7．49％。另外，六碱基重复34个，单碱基重复50个，五碱基重复5个，分别占重复序列总数目的2．50％、3．67％、0．37％。在单碱基重复类型中，重复拷贝类别为A的重复数目最多；两碱基重复类型中，AT重复数目最多，其次是AC和AG；三碱基重复类型中以AAT重复拷贝类别最多．其次是AAG和ATC；四碱基重复类型中，AGAT重复数目最多；五碱基重复类型只发现了AGAGA、GAGGC、TCTYC和TTTCT四种重复拷贝类别；六碱基重复中以ATTATC重复数目最多。其中一些序列已经提交GeneBank注册，注册号为AY545898-AY545913。中国对虾基因组二碱基重复类型中以不完全(Imperfect)形式的微卫星序列为主，其中GC重复拷贝类别的重复数目很少。利用8对微卫星引物对60个个体遗传多样性分析，共获得了60个等位基因，因此认为微卫星技术在中国对虾基因组研究中具有较好的应用前景。
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| 关 键 词： | 微卫星 中国对虾 基因组 |
| 收稿时间： | 2004-02-16 |
| 修稿时间： | 2004-02-16 |
ANALYSIS OF MICROSATELLITE SEQUENCES IN CHINESE SHRIMP FENNEROPENAEUS CHINENSIS GENOME |
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| GAO Huan,LIU Ping,MENG Xian-Hong,WANG Wei-Ji and KONG Jie. ANALYSIS OF MICROSATELLITE SEQUENCES IN CHINESE SHRIMP FENNEROPENAEUS CHINENSIS GENOME[J]. Oceanologia Et Limnologia Sinica, 2004, 35(5): 424-431 |
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| Authors: | GAO Huan LIU Ping MENG Xian-Hong WANG Wei-Ji KONG Jie |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Microsatellites Fenneropenaeus chinensis Genome |
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