| 乌鳢(Channa argus)胃蛋白酶原基因克隆及其生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 杜翠红,黄圆圆,蔡秋凤,郑志松,曹敏杰.乌鳢(Channa argus)胃蛋白酶原基因克隆及其生物信息学分析[J].海洋与湖沼,2010,41(5):733-738. |
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| 作者姓名： | 杜翠红 黄圆圆 蔡秋凤 郑志松 曹敏杰 |
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| 作者单位： | 福建省高校水产科学技术与食品安全重点实验室,集美大学生物工程学院,厦门,361021 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目, 30871947 号, 20872049 号; 福建省自然科学基金项目, 2008J0067 号, 2010J01212 号; 集美大学中青年创新团队基金项目, 2006A002 号 |
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| 摘 要： | 采用RT-PCR和3′RACE技术,首次从乌鳢胃组织中克隆了一种胃蛋白酶原基因。测序结果表明,该基因开放阅读框全长1086bp编码361个氨基酸,递交GeneBank数据库,获得登录号为GQ303143。系统进化关系分析表明,该乌鳢胃蛋白酶原氨基酸序列与鳜鱼类的胃蛋白酶原A2亲缘关系最近,从而推测本研究克隆的乌鳢胃蛋白酶原属于胃蛋白酶原A2类。采用生物信息学的方法和工具预测了该乌鳢胃蛋白酶原的理化参数及其高级结构,结果表明,该乌鳢胃蛋白酶原的相对分子量为38.8kDa,理论等电点为4.56。采用同源建模法建立了乌鳢胃蛋白酶原的三维结构模型,预测了其活性位点及6个必需半胱氨酸残基的位置。该研究结果为进一步研究乌鳢胃蛋白酶的结构和功能关系奠定了基础。
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| 关 键 词： | 乌鳢 胃蛋白酶原 基因克隆 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2009/7/18 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2009/9/30 0:00:00 |
CLONING AND BIOINFORMATIC ANALYSIS OF THE PEPSINOGEN GENE FROM CHANNA ARGUS |
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| DU Cui-Hong,HUANG Yuan-Yuan,CAI Qiu-Feng,ZHENG Zhi-Song and CAO Min-Jie.CLONING AND BIOINFORMATIC ANALYSIS OF THE PEPSINOGEN GENE FROM CHANNA ARGUS[J].Oceanologia Et Limnologia Sinica,2010,41(5):733-738. |
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| Authors: | DU Cui-Hong HUANG Yuan-Yuan CAI Qiu-Feng ZHENG Zhi-Song and CAO Min-Jie |
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| Institution: | College of Biological Engineering, the Key Laboratory of Science and Technology for Aquaculture and Food Safety, Jimei University;College of Biological Engineering, the Key Laboratory of Science and Technology for Aquaculture and Food Safety, Jimei University;College of Biological Engineering, the Key Laboratory of Science and Technology for Aquaculture and Food Safety, Jimei University;College of Biological Engineering, the Key Laboratory of Science and Technology for Aquaculture and Food Safety, Jimei University;College of Biological Engineering, the Key Laboratory of Science and Technology for Aquaculture and Food Safety, Jimei University |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Channa argus Pepsinogen Gene clone Bioinformatic |
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