| 大菱鲆(Scophthalmus maximus)热休克蛋白SmHsp47相互作用蛋白His-pull down和质谱鉴定 |
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| 引用本文： | 朱春月,孙志宾,马爱军,刘志峰,杨敬昆,赵亭亭. 大菱鲆(Scophthalmus maximus)热休克蛋白SmHsp47相互作用蛋白His-pull down和质谱鉴定[J]. 海洋与湖沼, 2021, 52(4): 971-982 |
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| 作者姓名： | 朱春月 孙志宾 马爱军 刘志峰 杨敬昆 赵亭亭 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学水产与生命学院 上海 201306;中国水产科学研究院黄海水产研究所 农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室 山东省海洋渔业生物技术与遗传育种重点实验室 青岛市海水鱼类种子工程与生物技术重点实验室 青岛 266071;青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋生物学与生物技术功能实验室 青岛 266237 |
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| 基金项目： | 财政部和农业农村部：国家现代农业产业技术体系资助，CARS-47-G01号；山东省农业良种工程项目，2019LZGC013号；青岛海洋科学与技术国家实验室“鳌山人才”培养计划项目，2017ASTCP-OS04号；中国水产科学研究院基本科研业务费项目，2020TD25号；中国水产科学研究院黄海水产研究所基本科研业务费项目，20603022021009号；烟台市科技计划项目，2018ZDCX021号。 |
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| 摘 要： | 首次克隆了大菱鲆(Scophthalmusmaximus)热休克蛋白Sm Hsp47基因。该基因c DNA序列全长为1 927 bp,其中开放阅读框长度为1 218 bp,编码一条长度为405个氨基酸的多肽链。结果表明,大菱鲆Sm Hsp47基因在肝脏、皮肤、鳃和肠等4个组织中都有表达,表达量最高的组织是肝脏,表达量最低组织是鳃; 25°C处理6 h后Sm Hsp47在皮肤中的表达量增加150多倍。利用大肠杆菌原核表达系统表达了Sm Hsp47的his标签融合蛋白,然后利用His-pull down技术捕获了Sm Hsp47的相互作用蛋白质,通过质谱分析鉴定出31种候选蛋白,其中大部分蛋白为参与翻译后修饰,蛋白转换及分子伴侣;此外还包括参与脂转运与代谢、能量产生与转换、细胞骨架、防御机制等过程的蛋白质。从31种候选蛋白中进一步筛选出3种分值较高的蛋白:未知蛋白(uncharacterizedprotein,A0A6A4TFV0)、胎球蛋白B(FetuinB,A0A2U9C388)和胶原结合蛋白(collagen-bindingprotein,A0A2U9B608),可为后续的研究提供方向。
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| 关 键 词： | 大菱鲆(Scophthalmus maximus) SmHsp47 蛋白相互作用 His-pull down |
| 收稿时间： | 2020-12-12 |
| 修稿时间： | 2021-02-19 |
IDENTIFICATION OF PROTEINS INTERACTION WITH SCOPHTHALMUS MAXIMUS HEAT SHOCK PROTEIN SmHsp47 BY HIS-PULL DOWN COMBINED WITH MASS SPECTROMETRY |
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| ZHU Chun-Yue,SUN Zhi-Bin,MA Ai-Jun,LIU Zhi-Feng,YANG Jing-Kun,ZHAO Ting-Ting. IDENTIFICATION OF PROTEINS INTERACTION WITH SCOPHTHALMUS MAXIMUS HEAT SHOCK PROTEIN SmHsp47 BY HIS-PULL DOWN COMBINED WITH MASS SPECTROMETRY[J]. Oceanologia Et Limnologia Sinica, 2021, 52(4): 971-982 |
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| Authors: | ZHU Chun-Yue SUN Zhi-Bin MA Ai-Jun LIU Zhi-Feng YANG Jing-Kun ZHAO Ting-Ting |
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| Affiliation: | College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306;Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Key Laboratory of Sustainable Development of Marine Fisheries, Ministry of Agriculture and Rural Affairs;Shandong Key Laboratory of Marine Fisheries Biotechnology and Genetic Breeding;Qingdao Key Laboratory for Marine Fish Breeding and Biotechnology, Qingdao 266071;Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Key Laboratory of Sustainable Development of Marine Fisheries, Ministry of Agriculture and Rural Affairs;Shandong Key Laboratory of Marine Fisheries Biotechnology and Genetic Breeding;Qingdao Key Laboratory for Marine Fish Breeding and Biotechnology, Qingdao 266071, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Scophthalmus maximus SmHsp47 protein interaction His-pull down technology |
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