| 半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)双链RNA依赖的蛋白激酶R(PKR)基因克隆和实时定量表达分析 |
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| 引用本文： | 沙珍霞,王启龙,李 敏,公光业,梁 卓,陈松林. 半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)双链RNA依赖的蛋白激酶R(PKR)基因克隆和实时定量表达分析[J]. 海洋与湖沼, 2013, 44(4): 1024-1032 |
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| 作者姓名： | 沙珍霞 王启龙 李 敏 公光业 梁 卓 陈松林 |
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| 作者单位： | 中国水产科学研究院黄海水产研究所 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室;中国水产科学研究院黄海水产研究所 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 滕州市水产服务中心;中国水产科学研究院黄海水产研究所 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室;中国水产科学研究院黄海水产研究所 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 上海海洋大学水产与生命学院;中国水产科学研究院黄海水产研究所 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室;中国水产科学研究院黄海水产研究所 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863)“海水养殖生物重要功能基因的发掘与研究”课题, 2012AA10A401号; 青岛市科技计划基础研究项目“半滑舌鳎抗病相关基因的鉴定与应用潜力研究”, 10-3-4-11-3-jch号; 国家重点基础研究项目(973)“重要养殖鱼类功能基因组学和分子设计育种研究”, 2010CB126303号。 |
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| 摘 要： | 采用RACE方法克隆了半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)PKR基因(CsPKR), 获得了CsPKR全长cDNA序列为2907bp, 其中包含1959bp的开放阅读框, 100bp的5′非编码区和848bp的3′非编码区。保守结构域分析显示推导的CsPKR氨基酸在N端存在两个特异的dsRBD(dsRNA binding domain dsRBD)结构域, 在C端具有多个保守的激酶活性位点, 包括ATP结合位点和底物配体结合位点, 以及活性环结构A-loop。系统进化树分析显示鱼类、两栖类、鸟类及哺乳类的PKR具有共同的进化起源, CsPKR与牙鲆PKR的亲缘关系最为密切。荧光定量PCR结果显示, CsPKR基因在健康鱼多个组织中广泛表达, 在脑中的表达最高, 头肾中表达最低。经鳗弧菌和淋巴囊肿病毒分别感染后, CsPKR基因在免疫相关组织中呈现上调表达趋势, 其中感染鳗弧菌12h后在血液中表达量较对照组上升了9.28倍, 在感染淋巴囊肿病毒24h后, 在肝脏中的表达达到最大, 为对照组的9.97倍。以上结果暗示CsPKR基因在半滑舌鳎响应细菌和病毒免疫应答中起重要作用。
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| 关 键 词： | 半滑舌鳎 PKR基因 克隆 病原 基因表达分析 |
| 收稿时间： | 2011-12-19 |
| 修稿时间： | 2012-07-15 |
MOLECULAR CLONING AND EXPRESSION OF PKR GENE IN HALF SMOOTH TONGUE SOLE CYNOGLOSSUS SEMILAEVIS |
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| SHA Zhen-Xi,WANG Qi-Long,LI Min,GONG Guang-Ye,LIANG Zhuo and CHEN Song-Lin. MOLECULAR CLONING AND EXPRESSION OF PKR GENE IN HALF SMOOTH TONGUE SOLE CYNOGLOSSUS SEMILAEVIS[J]. Oceanologia Et Limnologia Sinica, 2013, 44(4): 1024-1032 |
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| Authors: | SHA Zhen-Xi WANG Qi-Long LI Min GONG Guang-Ye LIANG Zhuo CHEN Song-Lin |
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| Affiliation: | Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Key Laboratory For Sustainable Utilization of Marine Fisheries Resources, Ministry of Agriculture;Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Key Laboratory For Sustainable Utilization of Marine Fisheries Resources, Ministry of Agriculture Tengzhou Fisheries Center;Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Key Laboratory For Sustainable Utilization of Marine Fisheries Resources, Ministry of Agriculture;Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Key Laboratory For Sustainable Utilization of Marine Fisheries Resources, Ministry of Agriculture Shanghai Ocean University, College of Fisheries and Life Science;Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Key Laboratory For Sustainable Utilization of Marine Fisheries Resources, Ministry of Agriculture;Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Key Laboratory For Sustainable Utilization of Marine Fisheries Resources, Ministry of Agriculture |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Cynoglossus semilaevis PKR gene molecular cloning pathogens infection gene expression analysis |
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