| 青岛崂山湾近海扇贝养殖区细菌多样性及环境因子分析 |
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| 引用本文： | 马景雪,张培玉,王宗兴,郑明刚,高 萍,曲凌云,王 波,郑风荣.青岛崂山湾近海扇贝养殖区细菌多样性及环境因子分析[J].海洋科学进展,2022,40(2):307-319. |
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| 作者姓名： | 马景雪 张培玉 王宗兴 郑明刚 高 萍 曲凌云 王 波 郑风荣 |
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| 作者单位： | 青岛大学 环境科学与工程学院,山东 青岛 266071;自然资源部 第一海洋研究所,山东 青岛 266061;自然资源部 海洋生态环境科学与工程实验室,山东 青岛 266061,青岛大学 环境科学与工程学院,山东 青岛 266071,自然资源部 第一海洋研究所,山东 青岛 266061;自然资源部 海洋生态环境科学与工程实验室,山东 青岛 266061 |
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| 基金项目： | 湛江市科技计划现代农业技术攻关项目———日本囊对虾速长新品系选育(2020A03004) |
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| 摘 要： | 为研究日本囊对虾(Marsupenaeusjaponicus)耐高亚硝酸盐的分子调控机制,利用新一代高通量Illumina测序技术,对日本囊对虾在高亚硝酸盐胁迫下的肝胰腺进行转录组测序,通过对高质量序列的拼接组装以及功能基因的注释和分类,发掘与耐高亚硝酸盐相关性状的候选基因。实验结果表明:①10个文库共获得920785608个净读本,数据量为6.48G~7.34G。②Q30>93.07%。利用 Trinity软件组装后获得 46308条单基因簇,N50为1833bp。③与对照组相比,高亚硝酸盐组分别识别出593、606、1089、497和988个差异表达基因。④对 DEGs进行功能注释,得到与免疫和代谢相关的通路和基因。⑤采用 qPCR 对随机选择的9个差异基因(DPD、ABCH、ProPOb、ACADL、CYP2J、PAT4、BHMT、CLEC 和PEPCK)在高亚硝酸盐胁迫下的表达情况进行检测,其表达量与转录组测序技术(RNASequencing,RNA-seq)趋势一致。本研究结果丰富了对虾cDNA 数据库的信息,为日本囊对虾在高亚硝酸盐胁迫下的分子机制研究奠定了基础。
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| 关 键 词： | 近海养殖 群落结构 高通量测序 环境因子 |
Analysis of Bacterial Diversity and Environmental Factors in Offshore Scallop Culture Area of Laoshan Bay, Qingdao |
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| MA Jing-xue,ZHANG Pei-yu,WANG Zong-xing,ZHENG Ming-gang,GAOPing,QULing-yun,WANG Bo,ZHENG Feng-rong.Analysis of Bacterial Diversity and Environmental Factors in Offshore Scallop Culture Area of Laoshan Bay, Qingdao[J].Advances in Marine Science,2022,40(2):307-319. |
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| Authors: | MA Jing-xue ZHANG Pei-yu WANG Zong-xing ZHENG Ming-gang GAOPing QULing-yun WANG Bo ZHENG Feng-rong |
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