| 龙须菜5.8S rRNA和ITS区的克隆与系统学分析 |
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| 引用本文： | 李敏,隋正红,易恒,张学成,阎炳伦,朱明. 龙须菜5.8S rRNA和ITS区的克隆与系统学分析[J]. 中国海洋大学学报(自然科学版), 2009, 39(1) |
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| 作者姓名： | 李敏 隋正红 易恒 张学成 阎炳伦 朱明 |
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| 作者单位： | 中国海洋大学海洋生命学院,山东,青岛,266003;淮海工学院海洋学院,江苏,连云港,222005 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展规划项目课题，山东省教学改革研究课题，江苏省海洋生物技术重点建设实验室开放课题 |
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| 摘 要： | 研究青岛产龙须菜居群内的遗传多样性和系统学分类,通过对龙须菜居群内不同个体的5.8S rRNA-ITS区(包括ITS1-5.8S rRNA-ITS2)进行PCR扩增和序列分析,得到扩增DNA片段长度均为1 066 bp,包含完整的ITS1(250 bp)、5.8S(159 bp)和ITS2(657 bp);利用GenBank数据库对Cracilaria(江蓠属)和Gracilariopsis属共20个物种的rRNA-ITS相应序列进行了比较和系统进化分析.结果表明,龙须莱和江蓠科19个物种中rRNA的5.8S区的长度和序列非常保守,而ITS区的长度和序列则变异较大,20种江蓠科物种的遗传距离在0.013～0.596之间,龙须菜在5.8S rRNA-ITS区特性上相比江蓠属物种与Gracilariopsis属物种更为相似;采用UPGMA法构建了这20种江蓠科物种的系统发育树;分析结果表明青岛产龙须菜的居群内不存在遗传差异,且应属于Gracilariopsis属,并且在江蓠科中较早分化,而龙须菜处于Gracilariopsis属中比较古老的位置.
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| 关 键 词： | 龙须菜 江蓠科 5.8S rRNA-ITS 系统发育 |
Cloning and Sequence Analysis of 5.8S rRNA and ITS region between 18S and 28S rRNA of Gracilaria lemaneiformis(Rhodophyta) |
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| LI Min,SUI Zheng-Hong,YI Heng,ZHANG Xue-Cheng,YAN Bing-Lun,Zhu Ming. Cloning and Sequence Analysis of 5.8S rRNA and ITS region between 18S and 28S rRNA of Gracilaria lemaneiformis(Rhodophyta)[J]. Periodical of Ocean University of China, 2009, 39(1) |
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| Authors: | LI Min SUI Zheng-Hong YI Heng ZHANG Xue-Cheng YAN Bing-Lun Zhu Ming |
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| Affiliation: | 1.College of Marine Life Sciences;Ocean University of China;Qingdao 266003;China;2.Huaihai Institute of Technology;Lian Yungang 222005;China |
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| Abstract: | For the purpuose of investigating genetic diversity and relationship in Gracilaria lemaneiformis population of Qingdao.The 5.8S rRNA ITS region(including ITS1-5.8S rRNA-ITS2) of individuals between 18S and 28S rDNA of different strains within the population of Gracilaria lemaneiformis were amplified and analyzed.The whole sequence was 1?066 bp in length,including 250 bp of ITS1,159 bp of 5.8S and 657 bp of ITS2.Phylogenetic analysis was done by using the sequence of rDNA-ITS region from 20 different species... |
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| Keywords: | 5.8S rRNA-ITS |
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