| 基于皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)EST数据库的串联重复序列特征分析 |
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| 引用本文： | 袁泽轶,张琳琳,张国范.基于皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)EST数据库的串联重复序列特征分析[J].海洋通报,2010,29(1). |
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| 作者姓名： | 袁泽轶 张琳琳 张国范 |
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| 作者单位： | 1. 中国科学院海洋研究所,山东,青岛,266071;中国科学院研究生院,北京,100039
2. 中国科学院海洋研究所,山东,青岛,266071 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划资助(973计划项目,2010CB126401);;国家公益性行业(农业)科研专项资助(nyhyzx07-047) |
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| 摘 要： | 皱纹盘鲍大规模EST的分析研究较少,为了研究其基因组转录本的基本特征并为皱纹盘鲍中开发EST-SSR功能性标记奠定基础,我们利用生物信息学手段对NCBI公共数据库中的5784条皱纹盘鲍EST序列进行EST-SSR特征分析。分析结果表明:(1)皱纹盘鲍EST中串联重复序列类型丰富;(2)皱纹盘鲍EST Gene Ontology注释序列SSR类型单一;(3)皱纹盘鲍EST-SSR分布广泛富,是EST-SSR标记开发的优良资源。
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| 关 键 词： | 皱纹盘鲍 EST 串联重复序列 SSR |
Bioinformatic date mining of EST- tandem repeats of the Haliotis discus hannai |
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| YUAN Ze-yi,ZHANG Lin-lin,ZHANG Guo-fan.Bioinformatic date mining of EST- tandem repeats of the Haliotis discus hannai[J].Marine Science Bulletin,2010,29(1). |
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| Authors: | YUAN Ze-yi ZHANG Lin-lin ZHANG Guo-fan |
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| Institution: | 1.Institute of Oceanology;Chinese Academy of Sciences;Qingdao 266071;China;2.Graduate University;Beijing 100039;China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Haliotis discus hannai EST tandem repeat SSR |
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