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可口革囊星虫(Phascolosoma esculenta)铁结合
引用本文:刘 艳,侯付景,周 君,王中华,李太武,苏秀榕. 可口革囊星虫(Phascolosoma esculenta)铁结合[J]. 海洋与湖沼, 2013, 44(4): 973-979
作者姓名:刘 艳  侯付景  周 君  王中华  李太武  苏秀榕
作者单位:宁波大学海洋学院 宁波职业技术学院应用化工系;宁波绿之健药业有限公司;宁波大学海洋学院 宁波职业技术学院应用化工系;宁波大学海洋学院 宁波职业技术学院应用化工系;宁波城市职业技术学院;宁波大学海洋学院 宁波职业技术学院应用化工系
基金项目:国家自然科学基金资助项目,“星虫铁结合蛋白基因的真核表达及富铅功能的解析”,41176123号;国家自然科学基金资助项目,“星虫富集汞、铅、砷有毒重金属的分子生物学机理解读”,40776075号;海洋公益性行业专项经费资助项目,“海洋污染生物效应快速监测与评价技术应用示范”,201005106-2号。
摘    要:以克隆获得的可口革囊星虫(Phasolosma esculenta)、枝吻纽虫(Dendrorhynchus zhejiangensis)、泥蚶(Tegillarca granosa)、缢蛏(Sinonovacula constricta)、仿刺参(Apostichopus japonicus)和白肛海地瓜(Acaudina leucoprocta)6种无脊椎动物的铁结合蛋白基因为基础, 通过NCBI检索下载相应的氨基酸序列, 采用SingalP程序查找信号肽, 用TMHMM程序搜寻预测跨膜区, 采用Clustal W程序多序列比对, 构建进化树。对其编码蛋白的信号肽、跨膜区以及磷酸化位点等进行分析。结果表明, 6种动物的铁结合蛋白都没有信号肽, 也无跨膜区, 不可能是膜上的受体或定位于膜上, 均为胞外蛋白。泥蚶的ferritin有4个磷酸化位点, 仿刺参ferritin有10个, 枝吻纽虫有8个, 白肛海地瓜有9个, 可口革囊星虫和缢蛏的ferritin未搜寻到磷酸化位点。6种铁结合蛋白的疏水性有一定的差异, 最大值在1.0—1.6之间, 最小值在?3.3—?2.8之间。可口革囊星虫和仿刺参的铁结合区域特征序列完全相同, 与文昌鱼、缢蛏、泥蚶、牡蛎、盘鲍有2个氨基酸差异, 与人、小家鼠和叉尾有1个氨基酸差异。

关 键 词:铁结合蛋白   分子进化   系统发育   可口革囊星虫
收稿时间:2012-11-28
修稿时间:2013-02-22

MOLECULAR EVOLUTION AND PHYLOGENETIC ANALYSIS OF FERRITIN OF PHASCOLOSOMA ESCULENTA
LIU Yan,HOU Fu-Jing,ZHOU Jun,WANG Zhong-Hu,LI Tai-Wu and SU Xiu-Rong. MOLECULAR EVOLUTION AND PHYLOGENETIC ANALYSIS OF FERRITIN OF PHASCOLOSOMA ESCULENTA[J]. Oceanologia Et Limnologia Sinica, 2013, 44(4): 973-979
Authors:LIU Yan  HOU Fu-Jing  ZHOU Jun  WANG Zhong-Hu  LI Tai-Wu  SU Xiu-Rong
Affiliation:School of Marine Sciences, Ningbo University;Ningbo Green-Health Pharmaceutical Co., Ltd.;Department of Applied Chemical Engineering, Ningbo Polytechnic;Department of Applied Chemical Engineering, Ningbo Polytechnic;Ningbo City College of Vocational Technology;Department of Applied Chemical Engineering, Ningbo Polytechnic
Abstract:
Keywords:ferritin   molecular evolution   phylogenetic analysis  
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