P53蛋白质的末端二极结构预测及核心区点突变模拟研究

根据刘次全研究员等发现的蛋白质与其编码mRNA二级结构之间可能存在着二级结构单元数目间的对应关系 ,首次尝试参照P53蛋白质N/C末端的编码mRNA二级结构预测P53蛋白质N/C末端相应的二级结构。预测结果显示 ,在P53蛋白质N端 1 -93残基肽段可能存在四个α螺旋结构 (1 4-2 6 ,38-4 6 ,51 -56 ,6 8-70aa)。在P53蛋白质C端单体聚合区以后的区域可能存在另外两个α螺旋 (36 8-373,381 -388aa)。在P53蛋白质N/C端末知二级结构的预测区域内没有发现β层片结构。这些预测结果与法国蛋白质生物和化学研究所 (IBCP)多重序列联配蛋白质二级结构预测方法对照 (其准确率为 73.2 0 %左右 ) ,结果基本一致。在此工作基础上 ,将P53蛋白质N/C端预测的二级结构在SGI-INDIGO2 工作站上分别构建出三维构象模型。与分子生物学研究的资料对照 ,这两个模型较好的解释了P53蛋白质N/C末端特定的生物功能在三维结构上的相应特点。此外 ,在SGI -INDIGO2 工作站上 ,首次选择和利用P53蛋白质突变研究近十年积累的大量资料 ,以及P53蛋白质核心区三维晶体结构数据资料 ,对Arg1 75,Arg 2 49,和Arg 2 48三个P53蛋白质高频率突变点的十种不同的残基替换做了分子动力学研究。结果发现 ,P53蛋白质核心区在经历 1 2 ps的分子动力学过程后 ,其三

The Terminal Secondary Structure Predictions of P53 Protein and Hotspots Mutation Dynamics of the Core Domain