| 摘 要： | 大黄鱼（Larimichthys crocea）幽门盲囊呈半封闭结构，保留了部分早期孵化阶段的微生物特征，是用于野生和养殖群体溯源的理想部位。本研究采用高通量测序技术，对三沙湾大黄鱼野生和养殖群体的幽门盲囊微生物的α多样性、核心菌群相对丰度、网络关系等进行分析，构建随机森林模型进行群体溯源分析。结果显示，养殖群体的幽门盲囊微生物有着更多特有操作分类单元（Operational Taxonomic Unit, OTU），其α多样性显著高于野生群体。幽门盲囊微生物的优势菌群有变形菌门（Proteobacteria）、厚壁菌门（Firmicutes）、拟杆菌门（Bacteroidota）、放线菌门（Actinobacteria）及酸杆菌门（Acidobacteria），且各菌群在野生和养殖群体中的相对丰度差异显著。微生物网络分析结果显示，野生和养殖群体的幽门盲囊微生物群落结构差异明显，野生群体拥有更高的负边缘/正边缘比率和模块性以及更少的节点数和连接数。基于此，我们构建了随机森林分类群体溯源预测模型，其准确率（Accuracy, ACC）达92.31%,Kappa系数为0.845 2,ROC...
|
