| 基于线粒体COI 序列的洪泽湖河蚬(Corbicula fluminea)遗传多样性和种群结构分析 |
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| 引用本文： | 李大命,张彤晴,唐晟凯,钟立强,刘小维. 基于线粒体COI 序列的洪泽湖河蚬(Corbicula fluminea)遗传多样性和种群结构分析[J]. 海洋与湖沼, 2015, 46(6): 1339-1346 |
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| 作者姓名： | 李大命 张彤晴 唐晟凯 钟立强 刘小维 |
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| 作者单位： | 江苏省淡水水产研究所 江苏省内陆水域渔业资源与环境重点实验室 南京 210017,江苏省淡水水产研究所 江苏省内陆水域渔业资源与环境重点实验室 南京 210017,江苏省淡水水产研究所 江苏省内陆水域渔业资源与环境重点实验室 南京 210017,江苏省淡水水产研究所 江苏省内陆水域渔业资源与环境重点实验室 南京 210017,江苏省淡水水产研究所 江苏省内陆水域渔业资源与环境重点实验室 南京 210017 |
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| 基金项目： | 江苏省333 工程科研项目, BRA2014319 号; 江苏省三新工程项目, Y2015-18 号; 江苏省青年科学基金项目, BK2012488 号。 |
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| 摘 要： | 为研究洪泽湖河蚬种群遗传多样性及其遗传结构, 采用线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ基因(COI) 作为分子标记, 采用PCR 扩增洪泽湖4 个河蚬群体(顾勒河GLH、临淮LH、蒋坝JB 和高良涧GLJ) 的COI 基因片段并进行了序列测定和分析。结果表明, 614bp 长度的核苷酸片段中, 碱基A+T 的平 均含量为65.0%, 明显高于G+C 的含量(35.0%).共检测到73 个多态位点, 多态位点比例为11.9%, 77 个个体中共获22 个单倍型(GenBank 登录号: KM659000-KM659021), 其中包括3 个共享单倍型, 4 个群体的平均单倍型多样性指数h 为0.889, 平均核苷酸多样性指数π 为0.04499, 平均核苷酸差异 数K 为27.622, 其中蒋坝群体的遗传多样性最高, 顾勒河群体的遗传多样性最低。22 个单倍型间的 Kimura 2-paramter 遗传距离为0.002-0.100, 平均遗传距离为0.0514.NJ 法构建的分子系统树显示 22 个单倍型聚为2 个分支。4 个群体间的遗传距离达0.03729-0.04969, 基于群体间遗传距离构建的 NJ 系统树中, 高良涧群体和顾勒河群体聚为一支, 蒋坝群体和临淮群体聚集为一支。AMOVA 分析 表明, 洪泽湖河蚬四群体间总遗传分化系数Fst 为0.06325(P>0.05), 93.67%遗传变异存在于群体内部, 6.33%变异存在于群体间。中性检验结果和歧点分布图显示, 洪泽湖河蚬种群大小保持稳定, 未经历 明显的种群扩张。
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| 关 键 词： | 遗传多样性 COI 基因 河蚬 洪泽湖 |
| 收稿时间： | 2014-12-18 |
| 修稿时间： | 2015-04-03 |
ANALYSIS OF GENETIC DIVERISTY AND POPULATION STRUCTURE OF CORBICULA FLUMINEA IN HONGZE LAKE IN MITOCHONDRIAL COI GENE SEQUENCE |
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| LI Da-Ming,ZHANG Tong-Qing,TANG Sheng-Kai,ZHONG Li-Qiang and LIU Xiao-Wei. ANALYSIS OF GENETIC DIVERISTY AND POPULATION STRUCTURE OF CORBICULA FLUMINEA IN HONGZE LAKE IN MITOCHONDRIAL COI GENE SEQUENCE[J]. Oceanologia Et Limnologia Sinica, 2015, 46(6): 1339-1346 |
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| Authors: | LI Da-Ming ZHANG Tong-Qing TANG Sheng-Kai ZHONG Li-Qiang LIU Xiao-Wei |
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| Affiliation: | Freshwater Fisheries Research Institute of Jiangsu Province, Key Laboratory of Fisheries Resources in Inland Water, Nanjing 210017, China,Freshwater Fisheries Research Institute of Jiangsu Province, Key Laboratory of Fisheries Resources in Inland Water, Nanjing 210017, China,Freshwater Fisheries Research Institute of Jiangsu Province, Key Laboratory of Fisheries Resources in Inland Water, Nanjing 210017, China,Freshwater Fisheries Research Institute of Jiangsu Province, Key Laboratory of Fisheries Resources in Inland Water, Nanjing 210017, China and Freshwater Fisheries Research Institute of Jiangsu Province, Key Laboratory of Fisheries Resources in Inland Water, Nanjing 210017, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | genetic diversity COI gene Corbicula fluminea Hongze Lake |
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