| 马氏珠母贝SNP标记开发及家系遗传多态性分析 |
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| 作者姓名： | 李耀国 刘文广 林坚士 何毛贤 |
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| 作者单位： | 中国科学院南海海洋研究所 中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室 广东省应用海洋生物学重点实验室，广东 广州 510301 ； 中国科学院大学，北京 100049,中国科学院南海海洋研究所 中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室 广东省应用海洋生物学重点实验室，广东 广州 510301,中国科学院南海海洋研究所 中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室 广东省应用海洋生物学重点实验室，广东 广州 510301,中国科学院南海海洋研究所 中国科学院热带海洋生物资源与生态重点实验室 广东省应用海洋生物学重点实验室，广东 广州 510301 |
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| 摘 要： | 利用13个源自转录组序列的SNP标记对3个马氏珠母贝(Pinctada fucata)家系进行遗传多态性分析及聚类分析。结果显示,家系1#、3#、6#的平均期望杂合度(He)分别为0.307 8、0.318 9和0.382 7;平均观测杂合度(Ho)分别为0.342 2、0.341 0和0.394 2;平均多态信息含量(PIC)分别为0.243 5、0.247 9和0.297 7。结果表明,3个马氏珠母贝家系具低度或中度遗传多态性,为马氏珠母贝内SNP应用于遗传多态性分析等提供了基础。利用SNP标记对3个家系进行聚类分析,发现半同胞家系1#和3#在家系及个体聚类中均先聚在一起,然后再与亲缘关系较远的家系6#聚在一起。新开发的SNP标记能较准确地对家系及个体进行聚类,为SNP标记应用于马氏珠母贝遗传关系分析提供了研究基础。
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| 关 键 词： | 马氏珠母贝； SNP ；遗传多态性；聚类分析 |
| 收稿时间： | 2015-01-08 |
| 修稿时间： | 2015-04-07 |
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