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【目的】探究珠母贝（Pinctada margaritifera）线粒体全基因组密码子的使用偏好性,明确密码子偏好性的影响因素,为提高珠母贝外源基因表达效率及种质资源保护与遗传育种的研究提供理论依据。【方法】选取珠母贝线粒体基因组中大于300 bp的10条非重复编码序列,利用CodonW 1.4.2、Excel、SPSS 22.0等软件分析序列的密码子偏好性参数,以同义密码子相对使用度差值（△RSCU）> 0.08以及在高表达基因库中RSCU值>1.00为标准筛选最优密码子。【结果】珠母贝线粒体基因组密码子第1位GC(GC1)比例为35.2%～51.8%,平均值为45.6%;第2位GC(GC2)比例为35.8%～46.8%,平均值为40.0%;第3位GC(GC3)比例为37.7%～51.8%,平均值为44.1%;总GC比例为41.1%～47.5%,平均值为34.9%。密码子的适应指数（CAI）为0.119～0.181,平均值为0.151。密码子的偏好性指数（CBI）为-0.184～-0.04,平均值为-0.1048。最优密码子使用频率（FOP）为0.259～0.359,平均... 相似文献
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