Identification of Epinephelus malabaricus and Epinephelus coioides using DNA markers

1 IntroductionBothEpinephelus malabaricusandE. coioidesbelong to the genusEpinephelus(Perciformes: Ser-ranidae: Epinephelinae).They are warm water reeffishes that have similar distribution ranges as well assimilar morphological characteristics, which have…     

晚中生代─新生代南海周缘地块运动与南海演化

报道了由华南几个盆地的古地磁数据综合而得的反映该区白垩纪以来古纬度变化曲线，结合Ｓｃｈｍｉｄｔｋｅ等（１９９０）发表的加里曼丹１５０Ｍａ以来的古地磁数据，表明华南与加里曼丹在４０Ｍａ前具有大致相同的古纬度变化史，差异仅出现在距今３０Ｍａ前后和１０Ｍａ以来。若此趋势可靠，则可作出下列推断：（１）南海的扩张只能发生在距今３０Ｍａ附近或１０Ｍａ以后华南与加里曼丹反向运动时期；距今３０Ｍａ的扩张已被广为接受；（２）华南与加里曼丹之向可能存在的古南海只能在９１Ｍａ之前存在；（３）南海演化可能存在两期扩张。南海的拟合可通过沿３５００ｍ等深线的先道时针旋转、后北向平移两个步骤完成。这与Ｈａｙａｓｈｉｄａ等（１９９１）提出的日本海张开与扩张模式很相似，提示东亚边缘海的形成和演化可能具有同样的机制。华南距今５０Ｍａ以来的古纬度变化与Ｔａｐｐｏｎｎｉｅｒ（１９８２）的传播挤出构造模式所预期的基本吻合，表明距今５０Ｍａ以来华南古纬度变化的运动学机制可用Ｔａｐｐｏｎｎｉｅｒ模式作解释。     

四色荧光标记DNA自动测序中一例典型错读码的校正

ＤＮＡ测序是现代分子生物学研究中的重要技术。随着人类基因组计划的实施 ,ＤＮＡ测序技术虽然在原理上没有新突破 ,仍然依赖于Ｓａｎｇｅｒ的酶法 ,但在不断提高自动化程度、降低成本方面取得了很大的进展 ,测序效率目前已有很大提高。大规模测序一个碱基的成本从１９８６年的０．５美元降到目前的约７美分。目前各种ＤＮＡ自动测序技术都是在荧光标记技术的基础上发展起来的。采用荧光标记的自动测序仪已在各个领域被广泛应用。四色荧光标记自动测序采用４种具有不同发射波长的荧光染料标记由聚合链终止反应产生的一系列终止片段 ,经过聚…     

中华哲水蚤不同地理种群苹果酸脱氢酶(MDH)的比较

中华哲水蚤 (ＣａｌａｎｕｓｓｉｎｉｃｕｓＢｒｏｄｓｋｙ)是属于甲壳纲 (Ｃｒｕｓｔａｃｅａ)桡足亚纲 (Ｃｏｐｏｐｅｄａ)哲水蚤目（Ｃａｌａｎｏｉｄａ）哲水蚤属（ＣａｌａｎｕｓＬｅａｃｈ）的一类浮游动物 ,为暖温带种 ,广泛分布于我国渤、黄海和东海沿岸区 ,为这些水域的优势种［１］。有关中华哲水蚤的研究国内有过许多报道 :李少菁［２］、陈清潮［３］、林元烧等［４］曾分别对该种类生活习性、摄食、生殖及生活史进行过研究 ,林元烧、曹文清等［５］也曾对厦门港不同月份采集的中华哲水蚤染色体组型进行了分析。而不同地理种群…     

耳鲍(Haliotis asinina)核糖体小亚基(18S rRNA)编码基因的克隆与序列分析

采用分子生物学的方法,对南海不同海区的两个地理群体耳鲍(Haliotis asinina)18S rRNA基因全长进行了克隆和序列分析,并将耳鲍18S rRNA基因的序列与NCBI数据库中已收录鲍的18SrRNA基因进行了比较。结果发现,南海耳鲍核糖体18S rRNA基因与耳鲍H.asinina isolate H11核糖体18S rRNA基因序列的相同率高达98%;同一地理群体内耳鲍核糖体18S rRNA基因序列完全一致;不同地理群体间耳鲍核糖体18S rRNA基因在碱基组成上的相似率为99%,仅在某些位点处发生了碱基替换,即腺嘌呤(T)被鸟嘌呤(G)替换;同时,将这两个不同群体中耳鲍的18S rRNA基因与泰国耳鲍18S rRNA基因序列进行比较分析发现,它们之间也只是发生了碱基替换。     

专家系统开发工具(TUILI语言)与海洋生物学研究

专家系统(Expert System简称ES)是在人工智能(Artifical Intelligence简称AI)的研究过程中产生的。不管人们如何看待AI,但都很现实地承认:解决某一领域内的具体问题,ES是不可低估的手段,有时甚至可超过同行专家。EH.Shorfliffe等人完成的用于诊断和治疗感染性疾病MYCIM系统收到很好效果;斯坦福(Startford)国际研究所(SDI)研制的矿藏勘测专家系统PROSPECTOR,在华盛顿州找到了专家未曾找到的一处钼矿。     

高识别力的微卫星标记系统在鳜属(Siniperca)物种鉴定中的应用

根据自行分离的翘嘴鳜微卫星序列（GenBank登录号：DQ789247-DQ789306）设计并合成20对微卫星引物,对鳜属鱼类4个物种即翘嘴鳜、大眼鳜、斑鳜和暗鳜共80个个体进行了物种鉴定分析.结果表明,20对微卫星引物共检测到293个等位基因,大小在80-301bp之间.它们在4个物种中的多态性位点百分率分别为90%、75%、85%和85%,累积个体识别率和非父排除率均达到0.9999,属于高识别力的微卫星遗传标记系统,可以用来进行鳜属鱼类物种的鉴定分析.UPGMA聚类分析表明,翘嘴鳜与暗鳜之间亲缘关系最近,可归属于第Ⅰ类;大眼鳜为第Ⅱ类;斑鳜独自为第Ⅲ类.本研究可为鳜属鱼类的分类及进化关系、群体遗传结构分析等提供理论支持,为野生原种鳜类遗传多样性的监测和评估以及鳜类优良的种质资源得到合理保护和开发利用奠定基础.