蜂巢石斑鱼随机扩增多态性DNA的初步研究

采用RAPD技术分析了湛江沿海野生蜂巢石斑鱼的遗传多样性 ,从 6个系列 1 2 0个引物筛选出1 6个引物 ,对 1 0尾蜂巢石斑鱼进行RAPD分析 ,1 6个引物共检测到 1 5 4个位点 ,其中 ,多态位点比例 (P)为 6 5 5 8% ,平均个体间遗传相似系数 (S)为 0 7887,平均个体间遗传距离 (D)为 0 2 1 1 3,遗传多样性指数 (H)为 0 1 776。研究结果表明 ,湛江沿海的野生蜂巢石斑鱼的遗传多样性较高。     

Extraction of plasmid-like DNA and high-quality total DNA from Porphyra yezoensis

I~ODWrIONExtraction of DNA from Porphyra po~nsis is very difficult due tO its high content ofpolysaccharides. TO avoid the interference Of POlysaccharides, HOng et al. (1992) used LiCI tosoften Porphyra thalli cells to release DNA directly without lysing the thalli, hoWever, the procedure is problematic in the isolation of high-quality DNA. Kitade et al. (1996) established a complicated procedure which includes the grindiflg of material in liquid nitrogen, lysing of material inextra…     

固定标本的DNA提取及PCR扩增

报道福尔马林、酒精固定的日本绒螯蟹标本的 DNA提取及 PCR扩增 ,并与冷冻、煮沸标本进行了比较。结果表明 ,福尔马林固定标本与酒精固定标本一样可以提取 DNA,加入的蛋白酶 K量越多 ,DNA的回收率越高。以提取的 DNA为模板 ,进行了线粒体 DNA12 S r RNA和 D- loop基因片段的 PCR扩增 ,经琼脂糖凝胶电泳 PCR扩增产物后均得到了与期待的碱基长度相一致的清晰谱带。     

鲨鱼软骨多糖的理化性质及其与DNA分子相互作用的研究

以鲨鱼软骨为原料 ,用改进的提取工艺 ,制得纯度较高的鲨鱼软骨多糖(SCAMP)。对其进行理化性质分析 ,表明SCAMP含有29.90%N 乙酰半乳糖胺、27.00 %葡萄糖醛酸、13.50%硫酸根及0.20 %蛋白质。红外光谱测试表明SCAMP的糖残基可能是α -糖苷键 ,推测其主要成分是硫酸软骨素类多糖。用荧光探针法证实SCAMP与DNA分子能相互作用 ,并呈量效关系 ,为进一步探索SCAMP抗癌作用机理提供了一项实验依据。     

斜带髭鲷养殖群体遗传多样性RAPD分析

采用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术对广东饶平海水网箱养殖的斜带髭鲷（Hapalogenys nitens Richardson）人工苗养殖群体DNA多样性进行检测。首先从40个引物（S461～S480,S501～S520）中快速筛选出32个引物,它们均能扩增出清晰稳定的DNA片段。再将该32个引物对46尾斜带髭鲷进行RAPD分析,共检测到177个位点,其中多态位点55个（分别由18个引物获得）,占31．07％。由此得出该群体的平均多态性为31．07％,平均遗传差异度为0．089,表明该养殖群体遗传多样性水平较高。     

两种鲨鱼鳃部真菌菌群的PCR-DGGE分析

以提取自东海海域两种鲨鱼(尖吻鲭鲨和噬人鲨)鳃耙组织的总DNA为模板,对其真菌菌群rDNA的基因内转录间隔区ITS1序列进行了PCR扩增,扩增产物经变性梯度凝胶电泳(DGGE)分离,电泳图谱中的7条主要条带经过二次PCR扩增后进行了克隆测序。NCBI-BLAST比对及分子系统发育分析结果表明,尖吻鲭鲨鳃部真菌菌群的优势种来自四个分类单元,其中一个来自青霉属,三个来自曲霉属;噬人鲨鳃部真菌的优势种来自四个分类单元,其中一种来自青霉属、两个来自梗孢酵母属、一个来自枝顶孢属;青霉属为两种鲨鱼鳃部共同的优势菌;另外DGGE指纹图谱显示还有种类较丰富的劣势菌存在。数据库检索显示多数真菌分类单元具有较好的产生生物活性天然产物的潜力。该PCR-DGGE分析揭示鲨鱼鳃部栖生有较丰富的真菌类群,它们的代谢产物及其与宿主之间的相互作用还有待深入研究。     

醚菊酯对日本囊对虾肝胰腺细胞DNA损伤效应的研究

为检测中国近海海洋环境中菊酯类农药等污染物对日本囊对虾(Marsupenaeus japonicas)的基因毒性及其危害程度,作者首次使用醚菊酯对日本囊对虾进行毒理实验,将日本囊对虾分为6组进行不同剂量的处理,采用彗星实验分析技术对处理培育25 d的日本囊对虾DNA损伤情况进行检测,并通过Comet Score 1.5分析软件对实验图谱进行拖尾率、尾长、彗尾DNA相对含量、尾距、Olive距等DNA损伤指标的统计分析,在对各指标分别建立一元回归方程的基础上,又通过SPSS软件进行判定分析,筛选影响作用更大的检测指标,建立了多参数的多元回归方程。实验结果发现,与空白对照组相比,日本囊对虾各实验处理组肝胰腺细胞DNA均有不同程度的损伤且各检测指标均有显著性差异(P0.01),各检测指标与处理浓度表现出良好的剂量效应关系,随着处理浓度递增,各检测指标都呈规律性的增长趋势。回归分析和相关系数表明:各检测指标与处理浓度具有高度的相关性,多项式回归方程(P0.05)和多元回归方程(P0.005)均有显著性的统计学意义,通过多元回归方程可以有效地推断醚菊酯处理浓度和处理时间。     

基于线粒体DNA部分片段探讨条石鲷与斑石鲷的亲缘关系

比较分析了条石鲷和斑石鲷线粒体基因组COI、Cyt b基因以及D-loop片段总长度为1 948 bp的核苷酸序列,探讨了条石鲷和斑石鲷的遗传分化程度.两种间共检测到314个多态位点,蛋白质编码基因上的核苷酸替代主要是发生在密码子第3位点上的同义替换.核苷酸组成分析结果表明:三个目的片段的鸟嘌呤(G)含量普遍较低,在两...