鲤JAK2基因分子克隆及组织表达分析

采用同源克隆策略和RACE-PCR技术,克隆得到可能的鲤(Cyprinus carpio)两面神激酶2(JAK2)基因的c DNA全长序列,包括3 378 bp的开放阅读框,732 bp的5'-非编码区,529 bp的3'-非编码区,总长度达4 639bp。开放阅读框可编码1 125个氨基酸,推测分子质量和理论等电点分别为129.33 ku和6.99。同源性分析显示,克隆的鲤鱼基因与斑马鱼(Danio rerio)JAK2同源性最高,其氨基酸序列同一性和相似度分别达89%和95%。结构域预测表明,所编码氨基酸序列包含FERM、SH2及两个酪氨酸激酶结构域,这4个结构域也保守地存在于其他脊椎动物的JAK分子中。高级结构预测显示,鲤JAK2主要包括α-螺旋(α-helix)、β-折叠(β-sheet)和连接环(loop)等3类结构元件。脊椎动物JAK分子系统进化树显示,JAK1、JAK2、JAK3和TYK2等4类JAK分子分别聚类,鲤JAK2处于JAK2支系中,与所有其他的鱼类JAK2聚为一大支,并与两栖类和哺乳类组成的另一大支构成姊妹群,表明它们具有共同的祖先基因,为直系同源关系。实时荧光定量PCR检测结果表明,鲤JAK2在皮肤中表达量最高,其次是肠、血液和脑,而在肌肉、鳃、头肾、心、肝、脾中表达量较低;鲤JAK3在脾中表达量最高,在其他组织中表达量均很低,甚至未检出。     

卵形鲳鲹PPARα基因cDNA序列的克隆、组织表达及生物信息学分析

采用RACE-PCR克隆卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator activated receptors-α,PPARα)基因的c DNA序列全长,并应用生物信息学方法分析其编码蛋白质的理化性质和结构特征。结果表明:卵形鲳鲹PPARα基因(Gen Bank登录号KP893147)c DNA全长1 930 bp,开放阅读框(ORF)为1 425 bp,共编码474个氨基酸,其编码的蛋白质为不稳定蛋白,无信号肽和跨膜结构,二级结构由α螺旋、β转角、伸展片段和无规则卷曲组成,且α螺旋占较大比例;预测显示,该蛋白有PPARs基因家族典型的DNA结合区(DBD)和配体结合区(LBD);序列对比表明,卵形鲳鲹PPARα基因与尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)、花鲈(Lateolabrax japonicas)、大黄鱼(Larimichthys crocea)、金头鲷(Sparus aurata)、军曹鱼(Rachycentron canadum)等有较高的同源性(81%~89%);蛋白系统进化树分析显示,在人(Homo sapiens)、鼠(Mus musculus)、鸭(Gallus gallus)、花鲈、大黄鱼、军曹鱼等动物中,卵形鲳鲹的PPARα蛋白与军曹鱼的进化关系最为密切(94%),与人(68%)、鼠(68%)、鸭(67%)等的同源性较低。荧光定量分析显示,卵形鲳鲹PPARαm RNA在脑、肾脏、肠、脾脏等组织表达水平较高,其次是皮肤、肌肉,在心脏、肝脏中表达量较低。     

排水管网多尺度几何语义建模

针对排水管网管理业务的不同需求,研究排水管网的多尺度几何语义表达方法,本文提出了包含“源—网—厂—汇”的排水管网多尺度几何语义模型。通过对排水管网组成要素及其相互间的关系进行系统地分析,并参考CityGML规范,提出了排水管网多细节层次模型;根据不同排水管网要素的特点,采用符号化及BIM等建模方式分别构建了不同细节层次的排水管网要素模型,支持排水管网多尺度可视化分析。并以某区域的排水管网数据为例,对本文提出的建模方法进行验证。     

多粒度时空对象的校史信息可视化研究

针对现有校史信息可视化存在的形式单一、表达内容缺乏等问题,该文基于多粒度时空对象的思想对校史信息可视化进行了探索.分析了校史信息可视化数据的特点,构建了基于多粒度时空对象的校史信息及其可视化表达方法的分类体系.最后在该分类体系的指导下,以某大学为例,进行了校史信息可视化的技术实现.研究结果表明,基于多粒度时空对象的校史信息可视化更有利于校史的全面、真实和动态展示.     

Python和FME下的疫情数据可视化

信息化和大数据时代提供了海量的数据源,而FME平台和自然开发语言Python给数据挖掘增添了无限可能,使数据真正地为我所用.针对COVID-19数据,设计了从数据爬取到数据可视化,再到轻量级Web应用发布和集成展示的一整套算法与流程.     

基于WebGIS的非遗传承系统设计与实现

通过对非遗发展现状的分析,发现传统非遗平台与GIS相结合并未发挥出其应有的优势,当前非遗的传承与寻址缺少媒介环境.针对该问题,设计实现了基于WebGIS的非遗传承系统,通过非遗商品的在线查询、在线交易、在线交流等功能来推进非遗的传承和保护,为普通大众提供了解非遗的途径,为广大非遗爱好者提供交流的平台.与传统的非遗平台相比,实现的非遗传承系统具有更新颖的查询方式、更规范的平台管理、更友好的人机交互模式,是一场传统文化与新兴技术的良性碰撞.     

三维激光扫描在地铁隧道监测中的可视化分析

随着新技术的不断发展,将三维激光扫描技术应用于地铁变形监测将成为一种重要手段.它克服了传统的点式监测技术以点带面的缺陷,有无须接触被测物体、自动化程度高、测量速度快、测量精度高、成果应用范围广(可与BIM、GIS等结合)、信息丰富(空间信息、灰度信息和真彩色纹理信息)等优点.本文结合昆明地铁羊肠村站至司家营站这一区间变形监测的实际项目,进行了断面分析、面对比分析、轨距测量分析、椭圆度分析、错台检测分析、渗水分析、裂缝分析、掉块分析、净空侵界分析等,通过和传统的全站仪、水准仪等方式比较,验证了三维激光扫描新技术可满足地铁变形监测要求,同时研发了一套针对地铁三维激光扫描新技术的软件系统,实现了地铁成果数据的三维可视化,具有一定的参考价值.     

中国"海陆河"一体化地理信息服务平台关键技术研究和应用

随着我国海洋强国发展战略的不断推进,海洋与陆地、内河领域的资源整治融合、信息共享共建需求日益增加.本文围绕"大交通"海事地理信息应用服务需求,以地理信息资源整合为核心,以应用服务为主线,深入开展了海陆河要素语义关联数据整合与治理技术、海陆河一体化地理信息数据资源池建设技术、无缝衔接海陆河一体可视化表达技术,海图地图服务快速更新等关键技术研究,解决了数据不一致、地图服务更新机制缺乏、数据资源分散等问题,实现了基于网络环境的全国"海陆河"地理数据资源的互联互通和开放共享,提高了我国的水陆"大交通"一体化的服务能力,促进了我国海洋海事行业发展.     

城市地下空间设施普查及测量技术研究

城市地下空间测量是比较新的测量研究领域,本文在对地下空间测量相关技术标准进行大量研究的基础上,从地下空间设施普查内容、地下空间测量方法及地下空间设施成果表达三方面阐述了地下空间普查及测量的关键技术,并将其用于天津市滨海新区主城区的地下空间设施测量,对开展城市地下空间设施普查及测量有一定的借鉴作用.     

基于ImaGIS技术的城市管网平台设计与实现

城市地下管线是城市的重要基础设施,本文通过对地下管线探查技术的探讨与GIS技术及三维可视化的研究,设计和开发了基于ImaGIS技术的城市三维管网平台系统.通过该系统实现了地下管线从探查、建库、展示及分析全过程周期化管理,为城市管线普查提供基础,同时为政府决策提供有力保障的基础信息.