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Based on DNA extraction and optimization of random amplified reaction (RAPD) to the gametophytes and sporophytes of Kelp “901” strain, genetic study on variation was conducted to its parents and offsprings of F6, F7,Fs, and F9 generation. RAPD results have shown that among 30 selected primers for gametophytes, 297 loci ranging from 200 to 3 000 bp were obtained in the average of 9,9 loci for each primer, This indicated a high polymorphic rate with RAPD detection. UPGMA (unweighted pair-group method arithmetic average) analysis showed that each male and female gametophyte of a generation could be clustered into one pair separately. The genetic distances of the Kelp 901 generation were 0.321 2-0.476 7, and the maximum was between F7 and Fs (0.476 7). Identity analysis showed that F6 generation was more close to the female parent (0.659 3), and F7 generation was more close to the male parent (0.5788). To the sporophytes study in 24 selected primers for RAPD amplification, 191 loci ranging from 230-2 800 bp were obtained, in the average to each primer of 8.0 loci. The heterozygosity to six populations were male parent (0.223 9),female parent (0.107 2), F6 (0.216 4), F7 (0.228 6), F8 (0.229 6) and F9 (0.317 2). The nearest genetic distance was 0.083 5 (Fs, F9). Total heterozygosity (HT) ofF6, F7, F8 and F9 generations was 0.318 6, the average heterozygosity (Hs) for F6,F7, F8 and F9 generations was 0.248 0, and deduced coefficient of population differentiation (Gst) was 22.2%. Six sequence characterized amplified regions (SCAR) were preliminary screened through RAPD analysis. It needed to be verified in detail as they are significant for molecular marker assistance in breeding and selecting Laminaria. 相似文献
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RAPD分析中最适样本量和位点数的研究 总被引:2,自引:0,他引:2
用25个引物,对40个样本扩增,研究了勒氏笛鲷随机扩增多态性DNA(RAPD)分析中的最适样本量和位点数。结果显示:在样本量达到20且位点数达到70个以上时,遗传距离趋于一个稳定的数值,即在RAPD分析中,样本数应达到20且位点数应达到70才能保证结果的可靠性。 相似文献
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生物体可看作是一种特殊的信息处理系统 ,论文的第二章从这种观点出发讨论了生物细胞内最大的信息源基因组DNA序列的信息编码问题。首先探讨了基因组蛋白质编码区的信息编码问题 ;简要回顾转录水平的基因表达调控后 ,讨论了基因组基因表达调控区的信息编码问题。第三章介绍了我们利用internet上可获取的开放的生物信息学资源 ,对基因组DNA调控区的一种可能的编码方式所进行的理论研究。这种可能的编码方式我们称之为双链DNA上的碱基空间模式BSP (BaseSpatialPattern)。首先 ,我们发现了由三联体BSP介导的一种 4与 2 0的关系 ,称为 4 -BSP -2 0关系。并推测 4 -BSP -2 0关系也许是某些DNA—蛋白质相互作用中的一种识别密码 ;第二 ,研究真核细胞转录调控中的DNA—蛋白质相互作用的实验数据表明 :某些DNA结合蛋白质对双螺旋核酸的专一性识别可能与BSP有关。并找到了 7组由其他生物学家公开发表的实验数据支持这一猜测 ;第三 ,研究了BSP的形式化描述问题 ,找到了一种基于等价类的BSP描述方法 ,并开发了相应的计算机处理算法。该描述方法简明且便于用计算机进行处理 ,更重要的是它提供了一种研究途径 ,可把BSP和 4 -BSP -2 0关系推广到单链DNA (ssDNA)和ssDNA -蛋白质相互作用的研究中 ,从而可进一步推广到RN 相似文献
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65.
DNA分子标记在水生动物遗传学上的研究进展 总被引:2,自引:0,他引:2
遗传变异是生物的重要特征之一,它决定着生物的存在和发展,因而成为人类一直极力要揭开其奥秘并进行能动性改造的方面之一。随着分子生物学理论和技术的发展,以及与水生生物遗传学的相互渗透,近十几年来,分子标记、基因克隆和基因转移技术取得了惊人的进展,一些新基因目前已稳定地转人多种水生生物中。目前分子标记辅助选择育种和基因转移已成为培育新品种的有效手段。与主要的农作物相比,水生生物大多数性状均表现为数量遗传、个体基因组高度杂合、进行传统的遗传育种非常耗资、费时和费力。分子生物学技术的介入,特别是DNA分子标记技术的发展和应用,对水生动物遗传学研究起到了巨大的推动作用。DNA分子标记大多是以DNA片段的电泳谱带形式表现的。依据其遗传特性,可分为显性和共显性标记两种。依据其在基因组中的出现频率,又可分为低拷贝序列标记和重复序列标记。依其多态性检出所用的分子生物学技术,可分为以Southern杂交技术为基础的分子标记, 相似文献
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67.
于2021年1月,利用环境DNA宏条形码(eDNA)技术,对广州海珠国家湿地公园海珠湖的水体和沉积物进行无脊椎动物多样性和群落结构调查,并比较了eDNA和传统形态学鉴定对浮游动物的检出能力。结果表明:eDNA检出海珠湖无脊椎动物9门16纲34目71科93属137个可操作分类单元(OTUs);其中,水采样品中共检出9门50属68个OTUs,网采样品中共检出6门27属35个OTUs,沉积物休眠卵样品中共检出9门70属103个OTUs。水采和网采样品中,主要的无脊椎动物均为轮虫动物门和节肢动物门;沉积物中主要的无脊椎动物为环节动物门和节肢动物门。沉积物休眠卵OTU丰富度最高,水采样品的OTU丰富度高于网采样品。比较浮游动物的形态鉴定和eDNA鉴定,发现后者在属水平上能鉴定出更多的种类;形态学鉴定的桡足类(100%)和多数轮虫(58.82%)可被eDNA注释出,而eDNA注释出的多数桡足类(71.43%)和轮虫(58.82%)在形态学鉴定中未发现;eDNA未注释出枝角类。结果表明,eDNA在无脊椎动物调查中具有较高的应用潜力,与传统形态学鉴定组合应用能更全面地了解无脊椎动物的种类和水生生物多样... 相似文献
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2021年3月在大连进行潮间带生物调查时采集到2个裸鳃类标本,经鉴定发现为欧氏针盘海牛Diaulula odonoghuei (Steinberg, 1963),为中国新记录属和新记录种。在研究中对其进行了活体拍照,利用光学显微镜和扫描电子显微镜对其外部形态和内部解剖特征进行了观察。此外,测定了这两个标本的COI、16S rRNA和H3基因序列,将测得的基因片段与GenBank数据库中的针盘海牛属Diaulula的同源序列进行对比分析,构建了针盘海牛属的系统发育树。欧氏针盘海牛在我国沿海的发现,进一步丰富了中国海软体动物的物种多样性研究。 相似文献
69.
70.
介绍了一种制备海洋浮游生物PCR模板DNA的方法——碱煮法。取少量海水样品(40μL).直接经0.25mol/L艺机NaOH和99℃温育处理裂解细胞,从而得到环境样品总DNA。实验证明,该方法制备的模板DNA可用于细菌核糖体RNA、浮游植物叶绿体rbcL和浮游动物线粒体COI等基因的PCR扩增。但是,在使用通用引物扩增细菌基因时,假阳性很难避免。该法制备的模板DNA适用于扩增非细菌基因或者特异引物界定的细菌基因。该方法较传统制备方法快速、简便,样品需要量减少,适用于浮游生物分子遗传多样性研究。 相似文献