海南八门湾红树林柱状沉积物中有机生物标志物的分布和降解

对海南岛红树林柱样中有机生物标志物等生物地球化学参数进行了初步研究.结果显示红树林中有机碳(OC)与总氮(TN)比值范围为5.35-7.47,碳稳定同位素(δ13C)值范围为-25‰--22.9‰.脂肪酸与正构烷烃浓度分布范围分别为7.8-21.8μg·g-1(干重)和3.2-25μg·g-1(干重).在表层沉积物中,红树林植物、细菌与浮游生物的脂肪酸生物标志物各占总脂肪酸的25.4%、12.9%和7.5%,结合较低的OC/TN比值和较高的δ13C值,表征了当地微生物和外源浮游植物的有机质贡献.各类脂肪酸在柱样中表现出不同的降解特征:多不饱和脂肪酸(PUFAs)优先被降解,而长链脂肪酸(LCFAs)则较为稳定,没有明显的降解.碳优势指数(CPI)和平均碳链长度(ACL)显示,埋藏深度越深,有机物的生物化学改造程度越大.     

南极海洋低温萘降解菌的筛选、鉴定及其降解特性研究

对从南极地区采集的嗜冷菌NJ41和NJ289的对萘降解特性进行初步研究.确定其最适的培养条件,并在最适培养条件下测定菌株的生长曲线和萘降解曲线.经分子鉴定,NJ41属于动球菌属(Planococcus sp.)、NJ289属于假交替单胞菌属(Pseudoalteromonas sp.).实验表明:这2株嗜冷菌均可在以萘等芳香烃为唯一碳源的无机盐培养基中生长,并能够在低温环境(0～10℃)中高效地降解芳香烃;10℃,120 r/min,10 d时,NJ41对于萘的降解能力最高达48.8%,NJ289可达43.5%;温度对降解能力有很大的影响,NJ41和NJ289均在10℃时,具有最高的降解能力,温度升高降解能力下降,NJ41在超过25℃时则基本不具有降解能力,而NJ289在超过20℃时就不具备降解能力.     

鮰爱德华菌黄颡鱼分离株外膜蛋白的抗原性分析

以黄颡鱼"红头病"致病菌——鮰爱德华菌(Edwardsiella ictaluri)A86作为实验菌株,通过十二烷基肌氨酸钠(Sarkosyl)抽提并结合超速离心的方法提取主要外膜蛋白(OMPs),SDS-PAGE图谱分析结果显示,OMPs主要有6条条带,相对分子质量分别为45 000、42 000、41 000、36 000、30 000和22 000。用A86 OMPs免疫新西兰大白兔,获得多克隆抗体22 mL,抗体效价为1∶20 480,抗体按照1∶2 560稀释时具有较高的特异性,仅与迟缓爱德华菌(E.tarda)、海豚链球菌(Streptococcus iniae)和创伤弧菌(Vibrio vulnificus)存在微弱的交叉反应,与鮰爱德华菌参考株及不同地区的分离株呈现特异性结合。多克隆抗体与OMPs的免疫印迹结果显示,主要有2条明显的免疫反应发色带,相对分子质量分别为36 000和30 000,且36 000蛋白染色最为明显。多克隆抗体与包括菌株A86在内的分离自南北方不同地区的10株鮰爱德华菌全菌免疫印迹试验发现,所有受检菌株反应结果相同,主要有4条明显的反应条带,相对分子质量分别为106 000、54 000、36 000和30 000,其中36 000和30 000两条蛋白带染色最深。因此,认为从黄颡鱼体内分离的鮰爱德华菌OMPs中36 000和30 000蛋白具有很好的免疫原性,36 000蛋白尤甚。     

马钱子发酵品中生物碱化学成分研究

目的 研究马钱子经朱红栓菌固体发酵产物(发酵品)的生物碱成分.方法 采用溶剂提取、硅胶柱色谱等方法对马钱子发酵品的生物碱成分进行分离纯化,根据化合物的理化常数和波谱数据鉴定其结构.结果 从马钱子发酵品中共分离得到10个生物碱成分,分别鉴定为士的宁(1)、马钱子碱(2)、伪士的宁(3)、16-甲氧基士的宁(4)、番木鳖次碱(5)、士的宁氮氧化物(6)、马钱子碱氮氧化物(7)、士的宁氯甲氯化物(8)、马钱子碱氯甲氯化物(9)和喜树次碱(10).结论 马钱子发酵品的大部分化学成分仍然是吲哚类生物碱,其中仅有10是单萜吡啶生物碱,为首次从该种植物中分离得到;化合物4是首次从该植物的种子中分离得到;化合物8和9可能为氯仿提取过程中产生的人工加合物.迄今未见朱红栓菌中含有上述生物碱的报道.与生品相比,马钱子发酵品中生物碱成分发生了一定的变化,其中化合物4、6、7和10可能为发酵品新增成分,这些生物碱成分的鉴定为马钱子发酵“去毒存效”原理提供了理论依据.     

Generation of Reactive Oxygen Species in Different Fractions of the Coelomocytes of Holothurian Eupentacta fraudatrix in Response to the Thermostable Toxin of Yersinia pseudotuberculosis in Vitro

Pure fraction (92% - 95%) of phagocytes (FP) and a mixture of amoebocytes (62%) and morula cells (38 % )-FPMC- of the holothurian Eupentacta fraudatrix ( Holothuroidea,Dendrochirota ) were obtained by using ficoll-verographine step gradient. Basal production of reactive oxygen species (ROS) in FP quantified by using reduction of nitroblue tetrazolium (NBT) was more than twice that in FPMC. Thermostable toxin of Yersinia pseudotuberculosis (TST) at differentconcentrations ( 0.2; 0.5; 2.5 μg/ml, but not 0.1 μg/ml) stimulated NBT reduction in FPMC after 24 h incubation. In FP, TST at concentrations of 0.1 and 0.2 μg/ml inhibited and at concentrations of 0.5 and 2.5 μg/ml stimulated NBT reduction after 24 h incubation. Maximal effect was observed in FP and FPMC at TST concentrations of 0.5 and 0.2 μg/ml, respectively. Addition of catalase (0.7 μg/ml) to the cells treated with TST (2.5 μg/ml) was followed by a decrease in NBT reduction compared to that under toxin treatment alone. TST stimulated superoxide dismutase activity in ccncentration-dependent manner (maximum at 0.5 μg/ml concentration in FP) after 24 htreatment, and this stimulation was prevented by a commercial catalase. Plant lectin concanavalin A stimulated NBT reduction more than 5-fold in FPMC compared to the control. With addition of TST, lectin stimulated ROS to lesser extent than that with lectin alone. When catalase, TST, and lectin were added into the FPMC simultaneously, ROS increase was similar to that under lectin treatment alone. On the whole, data obtained indicated that ROS generation in holothurian coelomocytes especially occurs in both stimulated and not stimulated phagocytes, and that changes in ROS production by these cells may be one of the mechanisms of antibacterial protection of holothurians.     

利用有益微生物改善养殖生态环境的研究

研究了噬菌蛭弧菌在实验室条件下对水产养殖中常见病菌的裂解能力及噬蛭弧菌的光合细菌对池塘生态环境的改善作用。结果表明，噬菌蛭菌对嗜水气单胞菌具有裂解作用，噬菌蛭弧菌和光合细菌结合使用对养殖环境具有明显的改善作用。25d实验组比对照组池塘中的细菌总数少2个数量级，70d后实验组比对照组池塘中的细菌总数少3个数量级，25d对照组COD为6．35mg/L，使用噬菌蛭 菌浓度为3，5，10mL/m^3及光合细菌皆为5mL/m^3实验组的COD分别为4．67，4．16，4．18mg/L；25d后对照组NH3－N为0．49mg/L，使用噬菌蛭弧菌浓度为3，5,10mL.m^3及光合细菌皆为5mL/m^3实验组的NH3－N分别为0．36，0．33，0．32mg/L，90d后对照组NH3－N为0．41mg/L，使用噬菌蛭弧菌浓度为3，5，10mL/m^3，及光合细菌皆为5mL/m^3实验组的NH3－N分别为0．27，0．22，0．21mg/L,55d后对照组硫化的为0．011mg/L，使用噬菌蛭弧菌浓度为3，5，10mL/m^3及光合细菌皆为5mL/m^3实验组的硫化物分别为0．010，0．008，0．008mg/L。     

利用有益微生物改善养殖生态环境的研究

研究了噬菌蛭弧菌在实验室条件下对水产养殖中常见病菌的裂解能力及噬菌蛭弧菌和光合细菌对池塘生态环境的改善作用。结果表明 ,噬菌蛭菌对嗜水气单胞菌具有裂解作用 ,噬菌蛭弧菌和光合细菌结合使用对养殖环境具有明显的改善作用。 2 5d后实验组比对照组池塘中的细菌总数少 2个数量级 ,70d后实验组比对照组池塘中的细菌总数少 3个数量级 ;2 5d后对照组COD为 6 35mg L ,使用噬菌蛭弧菌浓度为 3、5、1 0mL m3 及光合细菌皆为 5mL m3 实验组的COD分别为 4 6 7、4 1 6、4 1 8mg L ;2 5d后对照组NH3 N为 0 4 9mg L ,使用噬菌蛭弧菌浓度为 3、5、1 0mL m3 及光合细菌皆为 5mL m3 实验组的NH3 N分别为 0 36、0 33、0 32mg L ,90d后对照组NH3 N为 0 4 1mg L ,使用噬菌蛭弧菌浓度为 3、5、1 0mL m3 及光合细菌皆为 5mL m3 实验组的NH3 N分别为 0 2 7、0 2 2、0 2 1mg L ;5 5d后对照组硫化物为0 0 1 1mg L ,使用噬菌蛭弧菌浓度为 3、5、1 0mL m3 及光合细菌皆为 5mL m3 实验组的硫化物分别为0 0 1 0、0 0 0 8、0 0 0 8mg L。     

青藏高原土壤中一株原油降解菌的作用机制探究

分别采用原油和丙酮酸作为碳源培养Pedobacter steynii DX4细胞,采用Illumina高通量测序技术对两种碳源条件下细胞的转录组进行测序,测序数据拼接组装后共得到7 693个Unigene,其中有5 017个Unigene获得CDS注释。对Unigene进行筛选共获得1 195个差异表达基因,约占Unigene总数的15.5%,对差异表达基因进行功能分析发现,在原油为碳源的生长条件下,DX4细胞中Luciferase-like monooxygenase基因和卤代烷脱氢酶基因表达水平显著提高,这两个基因可能在DX4细胞中催化烷烃末端氧化反应。KEGG分析显示,以原油为碳源的DX4细胞中的脂肪酸降解途径中发现了8个UPDEGs、苯酸盐降解途径中发现了10个UPDEGs,揭示了细胞对原油中烷烃和芳香烃类物质的降解通路。此外,关于信号处理、物质转运、胞外多糖合成以及细胞趋向运动代谢途径的基因表达水平上调,表明DX4细胞可能依赖细胞趋向运动和合成生物表面活性物质来辅助原油降解。