利用同源重组质粒pUTK转化蓝藻Synechococcus sp.PCC7942及胸腺素α1的表达

采用本实验室构建的丝状蓝藻Calothrixsp.PCC7601基因整合平台系统供体质粒pUTK转化单胞蓝藻Synechococcussp.PCC7942,通过抗性筛选获得了具卡那霉素抗性的转化藻株。经Southern杂交证实 pUTK部分序列已整合到Synechococcussp.7942染色体DNA上 ;红光诱导后通过蛋白质SDS PAGE电泳 ,Westernblot证实 pUTK的胸腺素α1 基因得以有效表达,表达量达到总蛋白的4.8 %。结果表明,基因整合平台系统供体质粒 pUTK不仅可转化丝状蓝藻Calothrixsp.PCC7601,还可转化单胞蓝藻Synechococcussp.PCC7942。     

沼泽红假单胞菌(Rhodopseudomonas palustris)核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/氧化酶基因克隆及其在大肠杆菌中的表达

核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/氧化酶(RubisCO)(EC4.1.139)是光合细菌通过卡尔文循环固定二氧化碳的关键酶。本文采用PCR方法,从沼泽红假单胞菌株No.9中克隆到RubisCO基因(cbbM)序列(该序列已提交GenBank,登录号:GU061327)。采用同源建模法,建立了该RubisCO蛋白的三维结构模型,预测其活性位点。将cbbM基因亚克隆到表达载体pTV118N上,构建表达质粒pTV-CBBM,转化大肠杆菌BL21(DE3),获得表达菌株BL21(DE3)/pTV-CBBM,该菌株经IPTG诱导表达后,进行SDS-PAGE检测。采用气相色谱法测定破菌上清中的RubisCO酶活。结果表明:①cbbM基因编码461个氨基酸,与沼泽红假单胞菌株DCP3和DH1的RubisCO蛋白序列相似性分别为98%和99%;②推测沼泽红假单胞菌No.9中RubisCO蛋白的活性中心由Asn112、Lys192、Asp194、Glu195、His288、Arg289、His322、Gly424、Ser369、Gly370和Gly394等氨基酸残基组成;③重组蛋白分子量约为50kDa左右,与预测相符;④破菌上清中的RubisCO酶比活高于原始菌株中的酶活,说明目的基因在大肠杆菌中得到了有效表达。     

多鳞(Sillago sihama)高密度遗传连锁图谱构建及生长性状QTL定位分析

为构建多鳞(Sillago sihama)遗传连锁图谱并鉴定生长等重要经济性状数量性状位点(QTL),实验通过基因分型测序(GBS)技术对163个多鳞个体(2个亲本和161个全同胞家系F1代)进行测序及标记分型,并通过复合区间定位法对该物种的体重、体高、体厚、眼径、体长和背鳍前长6个生长性状进行QTL定位分析。结果显示,多鳞首张高密度遗传连锁图谱全长2 154.803 c M,标记间平均遗传距离0.455 c M,共有4 735个SNP标记分配到24个连锁群。QTL定位分析结果发现在6个生长性状中共检测到20个生长显著相关QTL位点,分布在8个连锁群上,单个QTL的LOD值范围为3.02～4.23,可解释的表型变异范围为0.14%～8.42%。其中,在连锁群LG08聚集了8个生长性状显著相关的QTL。通过对候选QTL区间内的基因进行功能注释,共筛选到了19个潜在生长调控相关基因,包含igf1、igf2、sstr5、sst1a、tgfbr2、gas1、igfals、gfg6、gfg20、bmp7、kdm5c、tti1以及rbm10等。实验获得的遗传标记及相关候选基因是多鳞生长相关性状标记...     

高效藤壶赖氨酰氧化酶的体外重组表达体系构建

藤壶(Balanus)是重要的海洋污损生物。研究报道在藤壶胶形成过程中,赖氨酰氧化酶(Lysyl oxidase,LOX)起了至关重要的作用。但迄今未见藤壶来源的LOX的重组表达和性质研究的报道,这已成为理解藤壶胶形成机制的瓶颈。为解决此问题,本研究聚焦海洋污损生物藤壶来源的LOX,通过系统筛选原核表达载体和LOX结构域,首次实现了藤壶来源的赖氨酰氧化酶(BalLOX)的高效可溶性表达,表达产率为0.28 g/L,是文献报道的哺乳动物来源LOX的373倍。研究结果表明重组表达的BalLOX具有较高的生物酶活性。该研究为后续深入理解藤壶胶形成机制及LOX在藤壶粘附中的角色和功能奠定了重要基础。     

长臂缨鲆核糖体RNA基因序列多态性特征分析

为了解鲽形目Pleuronectiformes鲆科Bothidae长臂缨鲆Crossorhombus kobensis (Jordan & Starks, 1906) 核糖体RNA基因的序列多态性特征, 本研究共获得该鱼类包括18S、5.8S、ITS1和ITS2全长及28S部分序列的128条克隆序列。经序列比对、聚类分析以及重组检测, 结果显示5.8S (158bp) 无长度变异, 而其他4个基因片段则表现出较高的长度多态性, 并可分为不同序列类型: 18S (1856~1893 bp) 有4种序列类型A、B、C和R; 28S (967~974bp) 和ITS1 (407~ 505bp) 均有3种类型A、B和R; ITS2 (423~447 bp)存在2种类型A和B。此外5个基因片段在碱基组成中均表现出GC偏倚, 并且ITS2 (71.14%)>ITS1 (65.37%)>28S (62.22%)>5.8S (57.67%)>18S (54.95%)。对具有不同序列类型的18S、28S和ITS进行真、假基因推断时, 通常的判别特征不足以提供有力依据, 因此增加了与4种鲆科近缘鱼类长冠羊舌鲆Arnoglossus macrolophus、青缨鲆Crossorhombus azureus、大鳞短额鲆Engyprosopon grandisquama以及冠毛鲆Lophonectes gallus相应基因片段的比对。各基因片段的插入/缺失以及特异性碱基差异位点比对结果显示: 18S和28S的短序列类型A与4种鲆科鱼类序列一致, 而其他序列类型则不同; ITS1序列类型A与4种鲆科鱼类在类型B的缺失位点均无缺失, 因此推测18S、28S和ITS1的A类型为真基因, 而其他类型为假基因。ITS2的A和B类型在差异位点上与4个鲆科鱼类不存在一致性, 没有足够的依据对两个类型做出真、假基因的推断。长臂缨鲆核糖体RNA基因中, 5.8S序列最为保守遵循协同进化的方式, 而其他4个基因片段为非协同进化的方式。     

积极推动研究所结构性调整 做好知识创新工程试点工作——对新疆生、地两所联合重组的思考

中国科学院原新疆生物土壤沙漠研究所和新疆地理研究所分别成立于1961年和1965年,两所在新疆社会经济发展和生态环境建设中做出了相应的贡献,在新疆相应学科领域都发挥了带头作用.     

浅议核地勘队伍体制改革的若干问题

本文结合地勘队伍服务社会化、成果商品化、管理企业化的要求,针对核地勘队伍管理体制中存在的问题,对战略重组、结构调整等体制改革问题进行了初浅探讨。提出了建立超事业部制与矩阵制相结合、合同制与代理制相结合的管理模式,并概述了核地质系统实施可持续发展人才战略的必要性和重要性。     

EST-derived microsatellites in Pseudosciaena crocea and their applicability to related species

Simple sequence repeat (SSR) markers were obtained for the large yellow croaker Pseudosciaena crocea using 1 205 expressed sequences tags (ESTs) from the NCBI database. Primers for 48 ESTSSR loci were designed and screened with 30 P.crocea specimens captured from Guanjingyang sea area in Fujian Province of China. Sixteen of the loci were polymorphic, which were amplified with 3 to 11 alleles per locus and the mean of 6.13. The observed and expected heterozygosity per locus ranged from 0.091 to 0.844 (mean 0.544) and from 0.118 to 0.892 (mean 0.644), respectively. Polymorphic information content (PIC) ranged from 0.115 to 0.866 (mean 0.593). The results for cross-species amplification of the 16 large yellow croaker EST-SSRs on P. polyactis, C. niveatus, C. lucidus, A. argentatus and J. belengeri revealed that 14, 12, 11, 7 and 6 loci were successfully amplified with 1 to 10 alleles with an average of 4.5 per locus, respectively, which are suitable for population genetics studies of these species and useful for phylogenetic relationship analysis among these species. Overall, this study provides a set of type I markers for population genetics studies and genome mapping for large yellow croaker and its closely related species.     

杜国银评点山西煤改 “国进民退”不是目的

山西是我国的煤炭大省,占全国煤炭生产总量的1/4以上.煤炭资源整合,成为进入21世纪以来山西政府工作报告中年年出现的字眼.     

Inheritance of 15 microsatellites in the Pacific oyster Crassostrea gigas： segregation and null allele identification for linkage analysis

Microsatellites were screened in a backcross family of the Pacific oyster, Crassostrea gigas. Fifteen microsatellite loci were distinguishable and polymorphic with 6 types of allele-combinations. Null alleles were detected in 46.7% of loci, accounting for 11.7% of the total alleles. Four loci did not segregate in Mendelian Ratios. Three linkage groups were identified among 7 of the 15 segregating loci. Fluorescence-based automated capillary electrophoresis (ABI 310 Genetic Analyzer) that used to detect the microsatellite loci, has been proved a fast, precise, and reliable method in microsatellite genotyping.