从迟缓爱德华氏菌fosmid文库克隆编码寡肽透过酶的opp基因簇

从迟缓爱德华氏菌（Edwarclsiellatarda）LSE40 fosmid文库克隆到编码寡肽透过酶的opp基因簇。该基因簇全长6741bp,含有5个ORF,依次编码OppA—B-C-D-F5个蛋白;位于oppA翻译起始住点上游385bp处有一个推测的转录起始位点,在该转录起点的-35和-10区分别有TAGACA和TATATT两个特征性启动子序列;位于oppA和oppB的间隔区和oppF之后的非编码区各有一个茎环结构,推测分别为oppA和opp基因簇的转录终止子。氨基酸序列分析表明该基因簇编码的各个蛋白与同属细菌鲶鱼爱德华氏菌（E．ictaluri）对应的各个蛋白高度相似,相似性在96％～98％;与其他革兰氏阴性菌相似性在56％～89％;与革兰氏阳性菌的相似性在27％～53％。以细菌OppA的保守结构域SBP_bac_5构建系统发生树,结果显示E．tardaLSE40与同属细菌E．ictaluri的亲缘关系最近,与肠杆菌科细菌的亲缘关系较近,与革兰氏阳性细菌的亲缘关系较远,表明oppA的SBP_bac_5结构域可作为细菌分类鉴定的依据。opp基因簇的获取为深入了解E．tarda适应环境和宿主的生存机制奠定了基础。     

求解地下水非稳定流方程的混合拉氏变换局部坐标有限分析法

本文给出了一种在不规则四边形网格上求解地下水非稳定流方程的混合拉氏变换局部坐标有限分析格式。由于将时间ｔ直接包含在有限分析数值计算格式中，克服了传统数值法求解非稳定过程按时段迭代的缺陷，实现了非稳定过程计算的一步完成，提高了计算效率，这对多时段地下水资源管理和长期预报非常有用。经实例验证，本方法有很高的精度，与解析解吻合甚好。     

“四深”微生物的地质作用：从气候环境变化到生态灾难

“四深”微生物是指深海、深地、深空和深时环境的微生物,特别是细菌、古菌、真菌、病毒等。人们对“四深”微生物的了解非常有限,是亟待突破的地球生物学前沿领域。“四深”微生物的研究对理解地球生命起源、界定生物圈的边界条件、促进地球科学与生命科学以及行星科学之间的交叉融合具有不可替代性的贡献。随着我国深海、深空、深地等重大工程计划的推进,一系列与“四深”微生物有关的前沿科学问题不断提出,包括地质微生物与气候环境的相互作用、地质微生物的生物安全与生态安全、地质微生物参与的隐匿地质过程等。特别是,“四深”环境活性氧自由基对微生物的影响、地质病毒对生物演化和地质过程的影响等前沿领域都亟待突破。活性氧自由基能对生物分子、细胞、组织和器官,乃至整个生物圈的演化以及微生物地质作用都产生重要影响。病毒引发了现代和近代诸多全球性疫情爆发,地质病毒则可能对生物的背景灭绝和大灭绝以及一些地质过程产生影响。     

南极普利兹湾夏季不同层次海冰及冰下海水古菌丰度和多样性

为了解南极普里兹湾夏季不同层次海冰及冰下海水中古菌丰度及群落组成,利用荧光原位杂交(filter in situ hybridization, FISH)技术对海冰及海水样品中古菌进行定量研究,通过构建16S rRNA基因文库对不同层次海冰及冰下海水中古菌进行多样性分析,并结合环境因子进行相关性分析。荧光原位杂交结果表明,古菌的平均丰度随着海冰层次的下降呈下降趋势,初步推断可能受海冰中铵离子影响所致;16S rRNA基因文库分析结果表明,仅在海冰底部样品中检测到古菌,且全部16S rRNA基因序列为泉古菌（Crenarchaeota）,与来源于北极海水、海冰中古菌16S rRNA基因序列相似性最高,属于泉古菌海洋类群I（Marine Group I Crenarchaeota）;冰下海水古菌多样性较高,主要归属于泉古菌Marine Group I和广古菌（Euryarchaeote）Marine Group II 、III。     

欧洲鳗病原菌控菌药物的研究

应用药敏纸片法测定２４种抗菌药物对欧洲鳗致病菌：非０１群霍乱弧菌、温和气单胞菌、鲁氏不动杆菌、迟钝爱德华氏菌和嗜水气单胞菌的敏感性。其中,诺氟沙星、四环素、头孢三嗪、庆大霉素、头孢噻肟抑菌能力较强。最低抑菌浓度（ＭＩＣ）和最低杀菌浓度（ＭＢＣ）测定结果表明孢三嗪对病原菌能力强。最低抑菌浓度（ＭＩＣ）和最低杀菌浓度（ＭＢＣ）测定结果表明,头孢三嗪对病原菌杀灭能力强,复方新诺明、硫酸庆大霉素对病原菌抑     

海洋软土基础工程钢结构的腐蚀风险评价

海洋软土基础工程的腐蚀性检测指标和评价按照《公路工程地质勘察规范》或《岩土工程勘察规范》。然而,无论对于钢管桩,还是混凝土管桩接头,规范都没有考虑溶解氧、生物厌氧菌等腐蚀因素。为了提高海洋工程管桩基础的耐久性设计水平,文章针对典型的海洋软土土质特征,通过观察缺氧环境下钢材腐蚀电位变化规律,分析了海洋沉积淤泥质土中钢结构的腐蚀风险,提出了海洋环境下基础工程钢结构（钢管桩及混凝土管桩接头）微生物腐蚀和电化学腐蚀机理。文章认为硫酸盐还原菌腐蚀评价在三沙海洋工程建设的地质勘察中不可或缺,该检测项目应该列入国家标准。     

安徽繁昌癞痢山东裂隙早更新世异仓鼠

文章详细记述了产自安徽繁昌癞痢山东裂隙堆积的异仓鼠化石.化石产地位于长江下游南岸的繁昌,与著名的人字洞古人类活动遗址相距仅数米,2020年我们首次对该裂隙堆积进行了系统发掘,已采集到数百件哺乳动物化石标本,其中异仓鼠属(Allocricetus)化石居多.异仓鼠属在我国最早的地史记录为上新世早期,最晚则延续到中更新世的...     

三种南极鱼种分布的研究

根据英国南极考察中心（ＢＡＳ）在南极半岛水域（１９８８／１９８９）调查资料分析了三种南极鱼种（南极多线鱼（Ｐｌｅｕｒａｇｒａｍｍａａｎｔａｒｃｔｉｃｕｍ），南极电灯笼鱼（Ｅｌｅｃｔｒｏｎａａｎｔａｒｔｉｃａ），博氏原灯笼鱼（Ｐｒｏｔｏｍｐｅｔｏｐｈｕｍｂｏｌｉｎｉ）的分布．南极多线鱼分布于受韦岛（Ｗｅｄｄｌｅ）海水影响的水域（丰度值：０．０５４至１．７７５４尾／１０００ｍ３），指出绝大多数幼鱼（２６．０至５４．０ｍｍ，ＳＬ）发现在上层水域．南极电灯笼鱼和博氏原灯笼鱼分布于东南太平洋水域和贝令施森（Ｂｅｌｌｉｎｇｓｈａｕｓｅｎ）水域（丰度值：０．０５１２至０．９９３５和０．０３９４至０．３９０９尾／１０００ｍ３）．此两种灯笼鱼种的分布水深一般大于５００ｍ。     

石浦海域齿鲸类一新纪录种记述

首次记述了2002年9月9日在浙江省象山县石浦镇海滩上搁浅死亡的1头朗氏中喙鲸Mesoplodon pacificus Longman 1926,并对其外形和骨骼进行初步描述.体背部灰蓝色,体侧有白色斑点,腹部白色.下颌前端具1对向前倾的圆锥形牙齿.前颌骨后端显著向上隆起,并包裹在鼻骨的两侧,与额骨一起成为脑颅的最高点.上颌骨中部侧面明显向外隆起.7枚颈椎全部愈合.朗氏中喙鲸在我国大陆沿海属首次被发现.     

哈维氏弧菌GST核酸疫苗制备及其对斜带石斑鱼的免疫保护作用

通过同源引物从致病性哈维氏弧菌(Vibrio harveyi)ZJ0603基因组中克隆GST的开放阅读框(ORF),构建真核表达质粒pcDNA-GST。大量抽提重组质粒后,于背鳍基部肌肉注射重组质粒免疫斜带石斑鱼(Epinephelus coioides),分析重组质粒的免疫效果。通过核酸水平检测重组质粒在鱼体肝、肌肉、头肾和脾脏组织的分布;用ELISA法检测鱼体血清的抗体水平,用Western-blot检测目的蛋白的表达情况。结果表明:该序列全长615 bp;免疫7 d后,鱼体中均有质粒分布;斜带石斑鱼血清中产生抗GST的高效抗体(1∶4 096);相应的目的蛋白也在鱼体中成功表达。攻毒后,疫苗免疫保护率达80%,表明GST可作为防治哈维氏弧菌病有效候选抗原。