卵形鲳鲹肉碱棕榈酰基转移酶Ⅰ全长cDNA序列的克隆及生物信息学分析

采用RACE-PCR克隆卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)肉碱棕榈酰基转移酶Ⅰ(carnitine palmitoyltransferaseⅠ,CPTⅠ)c DNA序列全长,并对其编码氨基酸进行生物信息学分析。结果表明,卵形鲳鲹CPTⅠ基因(Gen Bank登录号KP987456)c DNA序列全长2 841 bp,其开放阅读框(ORF)为2 363 bp,编码787个氨基酸,3'非编码区(URT)335 bp,5'非编码区142 bp;生物信息预测显示CPTⅠ基因编码的蛋白无信号肽序列,脂溶指数高达85.63,亲水性平均值(GRAVY)为-0.213,具有2个跨膜区螺旋,在第312和367氨基酸残基处存在N-糖基化位点,在19个丝氨酸(Ser)、9个苏氨酸(Thr)和14个酪氨酸(Tyr)残基上可能发生磷酸化;二级结构中α螺旋(Alpha helix)占比例最大,为40.66%;该蛋白亚细胞定位预测其主要分布于细胞质和线粒体中;分子系统进化分析显示,卵形鲳鲹CPTⅠ蛋白与花鲈(Lateolabrax japonicas)的同源性最高,达94%,与大黄鱼(Larimichthys crocea)、金鲷(Sparus aurata)的次之,均为93%,与人(Homo sapiens)、鼠(Mus musculus)等的同源性较低(65%)。     

内蒙古河套灌区湿地芦苇根际可培养细菌多样性

以内蒙古河套灌区湿地植物芦苇(Phragmites australis)根际土壤为材料,采用分离培养法对天然湿地和退化湿地的芦苇根际细菌多样性进行了研究。16SrRNA基因系统发育分析的结果显示,分离自天然湿地芦苇根际的45株细菌分属于γ-变形菌纲(44.44%)、厚壁菌门(Firmicutes)(42.22%)和放线菌门(Actinobacteria)(13.33%)3大类群,其中,γ-变形菌纲为最优势类群,芽孢杆菌属(Bacillus)(42.2%)为最优势菌属;分离自退化湿地芦苇根际的44株细菌分属γ-变形菌纲(13.63%)、β-变形菌纲(6.82%)、厚壁菌门(47.73%)及放线菌门(Actino-bacteria)(31.82%)4大类群,其中厚壁菌门为最优势类群,芽孢杆菌属(40.9%)为最优势菌属。研究结果表明,天然湿地和退化湿地芦苇根际细菌都具有较丰富的多样性,但天然湿地与退化湿地芦苇根际细菌群落结构存在一定差异。     

基于线粒体COI基因序列探讨鸭嘴舌形贝地理分布

从河北秦皇岛采集的用无水乙醇保存的鸭嘴舌形贝(Lingula anatina)样品中提取了DNA,经PCR扩增后进行克隆,得到了2条长度为682 bp的线粒体细胞色素C氧化酶第I亚基(COI)基因片段。调用GenBank中日本有明海和中国香港的鸭嘴舌形贝同源序列,用邻接法和贝叶斯法构建了系统发育树,结果表明:秦皇岛地区的鸭嘴舌形贝与日本有明海的鸭嘴舌形贝形成姊妹群,具有较近的亲缘关系,与香港的鸭嘴舌形贝亲缘关系较远。初步分析认为西太平洋地区鸭嘴舌形贝现有的地理分布并不是由浮游幼虫的扩散引起的,不同地区鸭嘴舌形贝的差异可能跟地理隔离有关。     

科技看点

太空Space月球尘埃微细锋利或损害人体能定居月球自然是好事,但月球对我们这群到访者可能并没有那么友好,科学家发现月球上遍布的尘埃对人类可能是有害的。到目前为止,人类加起来最多也只在月面上停留2～3天,一般是呆在飞船内或者穿着舱外航天服。但是如果要想进行长期驻留,恐怕不会那么容易,因为那些超微细,拥有尖锐棱角     

荧光狗

Ruppy是一只比格犬，它是世界上第一只转基因狗。它和其他四只比格犬的体内都有一种荧光蛋白，在紫外线的照射下，它们周身会发出红光。荧光狗由韩国首尔国立大学的一个研究小组制造。研究者把海葵的荧光蛋白基因插入病毒载体，然后将病毒载体转染至狗的成纤维细胞的细胞核中，再把此细胞核转移至另一只狗的卵细胞中（事先已去除细胞核）。经过数小时的体外细胞分裂后，研究者把克隆胚胎移植到代孕母狗的体内。     

基因大盗——海兔

看看这只海洋小精灵，它警惕地竖起两只“耳朱”——在这一瞬间，它是不是活像一只蹲在地上竖着一对耳朵的小花兔呢？其实这就是罗马文献中描述的神奇海洋精灵——海兔。日本人称它为“雨虎”。事实上，它和我们常见的兔子亲缘关系很远，它是一种软体动物而不是哺乳动物。它头顶的两个可爱的突起也不是“耳朵”，而是触角。这两对触角分工十分明确，