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目的:利用网络药理学-分子对接技术探索经方大黄牡丹汤治疗大肠癌的作用机制。方法:通过TCMSP、TCMID数据库获得大黄牡丹汤药物成分,通过PubChem、Swisstarget prediction数据库获得药物成分对应靶点,分析GSE113513芯片获得差异基因,随即获取大黄牡丹汤与大肠癌的共同靶点。利用R、Cytoscape、Autodock软件进行PPI、GO、KEGG、分子对接等分析。结果:获得大黄牡丹汤靶点561个,大肠癌差异基因1227个,共同靶点71个。共同靶点的通路富集分析显示主要与PPAR、p53等信号通路相关,Reactome机制分析显示大黄牡丹汤治疗大肠癌主要通过影响信号转导、免疫系统、疾病等产生作用,分子对接结果显示大肠癌核心靶点与大黄牡丹汤主要成分亲和力较好,能够有效自由结合。结论:经方大黄牡丹汤可通过多层次、多途径、多靶点发挥对大肠癌的治疗作用。 相似文献
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采集广西北部湾钦州附近月亮湾、钦州港和茅尾海海域海洋腐木,采用稀释法分离纯化得到32株产孢真菌,对真菌的菌落、孢子和菌丝形态进行研究,32株真菌可被分为5种真菌类型,其中第I、II和III种类型的真菌仅分离于月亮湾,第IV和V种类型在3个样品采集地均有分离.通过ITS基因测序表明,32株真菌为5个不同的种,其分别属于子囊菌门(Ascomycota)和接合菌门(Zygomycota),可以确定种属的包括伞状霉属(Umbelopsis)和青霉菌属(Penicillium),其中分离的青霉菌属在数量上具有优势,占分离菌株总数的75%,属于优势种属.采用4种指示菌大肠杆菌(E.coli)、蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)、烟草节杆菌(Arthrobacter nicotianae)、副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)检测抑菌活性,发现两株伞状霉属真菌Umbelopsis sp.B10和Umbelopsis sp.B9菌丝体提取物对四种指示菌均具有较强的抑制作用,另外两株青霉属真菌Penicillium sp.A5和Penicillium sp.B7的菌丝浸出物分别对革兰氏阳性细菌和革兰氏阴性副溶血弧菌具有较强的抑制活性.本研究为首次报道广西北部湾海洋腐木真菌及其抗菌活性. 相似文献
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从第四纪化石和沉积物中获得的古代生物分子为第四纪研究者提供了丰富和独特的有关古代生物、遗传和古环境信息的定量和高分辨率的数据.过去10多年的研究证实来自第四纪材料中的各种古代生物分子的分离、鉴定和应用的能力在不断增加.文章总结了古代生物分子在第四纪研究中的最新进展,主要包括以下几个方面的内容:1)不同类型的古代生物分子在地质体中的保存和降解;2)古DNA和古蛋白序列中的生物遗传学信息;3)单体分子同位素与第四纪古环境和古气候研究;4)建于古代生物分子水平上的第四纪年代学.作者预见对第四纪地层中的原位和分散保存的古代生物分子的研究将在广度上以多分子综合研究而深度上与单体分子同位素技术相结合,为第四纪科学家们提供大量解决地质学和演化生物学问题的高精度数据.随着地球化学和分子生物学技术的不断改进以及人们对古代生物分子的降解过程和机制的进一步理解,对古代生物分子的研究无疑将进一步促进和推动第四纪科学研究的发展. 相似文献
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目的:利用GEO数据库和网络药理学分析猫爪草治疗原发性肝癌(HCC)的作用机制。方法:借助HERB数据库、SwissADME及SwissTargetPrediction筛选猫爪草的有效成分与作用靶点。从GEO数据库中筛选正常肝脏组织患者与肝癌患者的差异表达基因,整合GeneCards、DisGeNET、GEO数据库得到HCC疾病靶点、疾病和成分的交集基因,利用Cytoscape 3.9.0构建成分-疾病网络及拓扑分析,在David数据库进行基因本体(GO)功能、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:获得猫爪草活性成分36种,潜在靶点544个,差异表达基因1 950个。核心靶点包括血管内皮生长因子A、信号转导与转录激活因子3、胱天蛋白酶3、非受体酪氨酸激酶、缺氧诱导因子-1α、表皮生长因子受体等。GO功能富集分析发现生物过程涉及对异物刺激的反应、丝裂原活化蛋白激酶级联的积极调节、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号通路等方面;细胞组成主要集中在细胞质、细胞核和细胞外泌体等;分子功能主要集中在蛋白质结合、酶活性、脱氧核糖核酸结合等。KEGG通路主要涉及癌症、磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B、催乳素、缺氧诱导因子-1、乙型肝炎等。结论:猫爪草治疗肝癌具有多成分、多靶点、多途径等特点,为今后的进一步研究提供了理论依据。 相似文献
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近年来,酸性染料在岩矿光度分析中的应用,无论是所用染科的数目,或测定元索的数目,还是发表论文的篇数,都在增长,并还将持续增长。在岩矿光度分析中,该类染料最著名的有铬天青S和苯基萤光酮等。由于它们的分子中-OH基能离解出H^ 离子,故称之为酸性染料。其离解形式多种多样,故其颜色也 相似文献
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We investigate the effect of bulk motion on the detection of molecular outflows in the sources S 146, GGD27, and IRAS 22566 5830. The traditional techniques do allow for bulk motions or systematic VLSR shifts of the core emissions, which may cause contamination of the high velocity gas emissions, and outflows may either fail to be detected or have their properties miscalculated. We used a program to follow the systematic shift of VLSR and better results have been obtained. 相似文献
70.
目前对超临界地质流体的形成条件、成分、结构和物理化学性质的认识还不是特别清晰,分子模拟作为一种方兴未艾的理论研究手段,正在被广泛应用于地球科学领域。本文简述了目前采用分子模拟研究硅酸盐熔体、含水硅酸盐熔体、富水流体以及超临界地质流体所取得的主要成果,侧重讨论分子模拟方法在其中的应用,为超临界地质流体的计算模拟研究提供帮助,并展望了超临界地质流体分子模拟可能遇到的挑战和发展趋势。已有研究结果表明,不同分子模拟方法各有优缺点,相对于精度较低的经典分子动力学方法而言,采用一般泛函的第一性原理方法加上色散校正之后,可以满足目前对超临界地质流体研究的精度需要。另外,机器学习和第一性原理方法结合,以及建立相关热力学模型将是推进与超临界地质流体相关研究的有效途径。 相似文献