草鱼呼肠孤病毒096vp7基因生物信息学分析及其酵母表达载体的构建

草鱼呼肠孤病毒（Grass carp reovirus, GCRV）是草鱼出血病的病原.从患病草鱼体内分离到一株草鱼呼肠孤病毒GCRV 096,经反转录PCR,克隆得GCRV 096 长度为855 bp 的vp7 基因,并分析该基因编码蛋白的特性.结果表明,同一基因型分离株VP7 蛋白间的差异不大,但不同基因型分离株VP7 蛋白间存在很大的差异.对GCRV 096 VP7 蛋白生物信息学分析表明,信号肽位点位于20 氨基酸处,且VP7 含有4个潜在的抗原决定簇.构建GCRV 096 vp7 基因的酵母表达载体pGBKT7-S10,并成功转化至酵母中.     

牙鲆(Paralichthys olivaceus)β诺达病毒衣壳蛋白重组表达及复性条件优化

β诺达病毒利用其缺乏校正功能的聚合酶进行基因组复制,易导致突变,因而具有广泛的宿主感染性,而且可引发致死率极高的病毒性神经坏死症,需要有针对性地研究检测及防御方法。本研究以感染牙鲆(Paralichthys olivaceus)的β诺达病毒为对象,利用引物设计,将His标签编码序列连接到完整病毒衣壳蛋白C端,构建原核表达载体;采用SDS-PAGE及质谱对表达产物进行分离和鉴定;重组衣壳蛋白经镍离子亲和柱纯化后进行复性条件的正交优化。结果表明4个肽段经质谱鉴定与预期一致;纯化产物产量可达36mg/L;4°C条件下,复性缓冲液中尿素和PBS的最适浓度为0.8mol/L和0.05mol/L。本研究建立的制备方案可为研制相关疫苗以及开发针对该病毒的快速检测产品等提供有价值的参考。     

一种新的海洋微藻病毒丝氨酸蛋白酶基因的克隆表达及其活性分析

从海洋球石藻Emiliania huxleyi病毒EhV99B1的基因组中克隆了丝氨酸蛋白酶(Sp)基因(GenBank登录号:KC161207),对该基因的开放阅读框(ORF)进行系统的生物信息学分析,并在大肠杆菌中融合表达,通过亲和层析法获得了纯化的重组Sp。结果表明:EhV99B1-Sp基因的ORF为1 110bp,编码368个氨基酸,蛋白相对分子质量为39.5kDa;该基因片段与GenBank中EhV86-Sp的同源性很高,核苷酸及其对应的氨基酸序列同源性分别为95%和97%,而与其他物种Sp序列的同源性仅为28%~32%,说明其可能是丝氨酸蛋白酶家族中的一个新成员;预测的二级结构特征显示EhV99B1-Sp的蛋白结构域中具有典型的LTAGHC(组氨酸活性位点区域)和AICNGDSGGPLF(丝氨酸活性位点区域)两个丝氨酸蛋白酶催化活性位点的氨基酸基序,是一个两次跨膜蛋白;将该基因在大肠杆菌中进行低温诱导表达,得到分子量为60kDa的重组蛋白,经鲤鱼肌肉丝氨酸蛋白酶(MBSP)抗体检测证实为Sp,且重组蛋白在大肠杆菌细胞中具有明显的生物学活性。本研究结果为进一步探讨EhV99B1-Sp在病毒与宿主相互作用过程中的调节作用及其功能与应用奠定基础。     

导航电子地图多模式表达模型的研究

随着卫星定位的发展、道路交通水平的提高以及无线网络技术的进步,导航电子地图凭借其在位置服务功能上的良好表现日益成为人们工作和生活必不可少的工具。但是目前市场上的导航电子地图显示模式少,针对性不强,无法满足用户多样化的需求。文中通过对导航电子地图表达现状的分析,研究基于不同环境、不同用途、不同用户等条件下的多模式导航电子地图表达方法,并对常用模式下一些模板的样图进行设计。     

三角网求交的共形几何代数算法

针对传统三角网求交计算方法逻辑结构复杂,维度上不统一等不足,本文基于几何代数理论,从对象表达、关系运算相统一的角度,构建了基于meet算子的自适应三角网求交算法。利用共形几何代数中与Grassmann分级结构一致的对象外积表达,建立了三角网的几何代数表达;基于meet算子构建空间三角网求交算法,探讨了该算法对几何对象及维度的自适应性;最后基于南极冰盖模拟数据对上述算法进行案例验证。结果显示,本文算法可以很好的支撑三角网的求交运算,在简化了算法结构的同时提升了算法的多维适用性,可为基于几何代数的多维融合空间分析算法构建提供借鉴。     

浅析浙江省地方标准《三维数字地图技术规范》

三维数字地图是传统二维数字地图的延伸,已成为基础地理信息的重要组成部分。简述浙江省地方标准《三维数字地图技术规范》的内容,分析该标准与现行相关行业标准的关系,以及在模型分类和编码、地图分幅和编号、比例尺、数学基础、精度和表达等方面的创新点,并提出实施中的建议。     

灾害保障图可视化表达规律探究

探讨了灾害保障图的研究现状,基于"区域灾害系统"理论,给出了灾害保障图较为翔实的定义和分类,并着重从表达内容、表示方法、表现形式和符号设计方面对其可视化表达规律进行了探究。     

GIS数据与制图数据一体化方法研究与实现

以海南1∶10 000 DLG数据为例,描述了基于ArcGIS制图表达机制、制图数据与GIS数据通过模板方式生产实现一体化存储的工作方法,为海南1∶10 000 DLG数据更新提供参考,能够实现地理信息获取实时化、处理自动化、传输网络化和服务社会化。     

基于XML的网络专题地图集设计与实现

专题地图集是关于某一区域自然资源、社会经济、发展规划等方面的专题信息的地图图幅集合.将专题地图集在网络环境下进行发布,使专题地图信息服务于大众具有很强的现实意义.针对网络环境下的专题地图集存在结构组织不统一、地图表达不够美观、专题数据更新滞后等问题,引入网络动态专题地图集的概念,设计使用xml(Extended mar...