长松藻ITS序列特征及其系统进化分析

采用PCR扩增的方法获得了第一个松藻目物种长松藻(Codium cylindricum)的ITS序列,长松藻ITS全长515bp,其中ITS1的长度为74bp,5.8S序列长163bp,ITS2的长度为278bp.与已知的绿藻门其它5个目8个属物种的ITS序列的系统发育分析结果表明,绿藻门物种分为三大支,其中团藻目藻类为一支,松藻目和刚毛藻目藻类为一支,石莼目、顶管藻目和丝藻目藻类构成一大支;长松藻与刚毛藻目的刚毛藻属和硬毛藻属物种同为多核藻体,在系统发生上表现出更近的亲缘关系;不同绿藻目海藻的聚类关系表明,其能够准确地反映出其在单核与多核、单细胞与多细胞等生物结构特性方面的差异与水平.     

Identification of Cytochrome P450 (CYP) genes in Zhikong scallop (Chlamys farreri)

Cytochrome P450 (CYP) superfamily is one of the membership largest and function most diverse protein superfamily recogniozed among living beings. Members of this superfamily were further assigned to different families and subfamilies based on their amino acid similarities. According to their phylogenetic relationships, the CYP genes which likely diverged from common ancestor gene and may share common functions were grouped into one clan. Widely distributing scallops are a group of the most conspicuous bivalve; however the studies on their CYP is acarce. In this study, we searched the genome and expressed sequence tags of Zhikong scallop (Chlamys farreri) for CYP genes. In total, 88 non-redundant CYP were identified, which were homed in 13 CYPs gene families. Phylogenetic analysis divided these genes into 4 CYP clans. As in deuterostomes, Clan 2 was the largest, which contained 33 genes belonging to CYP1, CYP2, CYP17 and CYP356 families. Clan 3 contgained 19 genes belonging to CYP3, CYP5 and CYP30 families. Clan 4 contained 23 genes, all belonging to CYP4 family. The mitochondrial CYP clan contained 9 genes belonging to CYP10 and CYP24 families. In comparison, protostomes (C. farreri, D. pluex, D. melanogaster) contained more CYP genes than deuterostomes (S. purpuratus and vertebrates) in Clan 2 but less genes in Clan 3 and Clan 4. Our findings will aid to deciphering CYP function and evolution in scallops and bivalves.     

基于RS数据的黄河三角洲湿地信息提取及湿地动态变化研究

本文采用分层分类和决策树分类方法,对黄河三角洲1986、1996、2009年3个时期Land-sat-TM数据进行了处理,提取了黄河三角洲湿地信息,分析了三角洲湿地20年间的动态变化。结果表明,湿地变化整体呈先增多后减少的趋势,其中人工湿地比重不断增加,面积增加最多的是盐田湿地,减少最多的是滩涂湿地,土地盐碱化加重;采用分层提取湿地信息的方法精度达到90%,结果优于监督分类和非监督分类。     

柄海鞘共附生细菌的分离培养与系统发育多样性研究

通过纯培养和16SrRNA基因序列的相似性比对,并构建系统发育树对威海海域柄海鞘共附生细菌的多样性进行了研究。用2216E培养基从柄海鞘样品中分离到78株细菌,通过形态学特征和TCBS培养基选择性筛选后,选取30株具有代表性的菌株进行了16SrRNA基因测序和基于16SrRNA基因序列的系统发育多样性分析。结果表明,30株菌株分别属于细菌域的4个系统发育类群(Actinobacteria,Bacteroidetes,Firmicutes,Gro-teobacteria)的11个科,11个属。根据16SrRNA基因序列,大多数菌株与其系统发育关系最密切的模式菌株之间存在一定的遗传差异(16SrRNA基因序列相似性为91.82%～98.93%)。其中菌株HQW7,HQYD1,HQWD4,HQE1和HQE2与相关模式菌株的16SrRNA基因最高相似度仅分别为91.82%,92.51%,92.99%,93.52%,93.87%,这5株菌可能代表新的分类单元。威海海域柄海鞘共附生细菌存在着较为丰富的物种多样性和系统发育多样性,并可能存在新的物种。     

基于分类回归树算法的东南太平洋智利竹筴鱼渔场预报

为了提高智利竹筴鱼渔场预报水平和满足渔业捕捞生产的需要,利用2002—2008年的东南太平洋公海海域捕捞的中国大型拖网渔船共计15艘的生产统计资料,以及海洋环境数据(包括海表温度、叶绿素a浓度、表温距平、叶绿素a浓度距平、海表温度梯度强度和海面高度异常等数据),基于CART的算法,构建了智利竹筴鱼渔场决策树预报模型。用含1 114条记录的数据集对模型进行训练,并采用ROC方法对该模型诊断中心渔场的准确性进行了分析。最后将该模型应用于2009年各月份的智利竹筴鱼中心渔场预报,并与实际渔场位置进行了对比,结果显示预报渔场与实际生产位置基本一致,表明利用CART决策树方法建立智利竹筴鱼渔场预报模型是可行的。     

Diversity and bioactivity of actinomycetes from marine sediments of the Yellow Sea

Among the 116 actinomycetes collected from marine sediments of the Yellow Sea,56 grew slowly and appeared after 2?3 weeks of incubation.Among the 56 strains,only 3 required seawater(SW) for growth,and 21 grew well in the medium prepared with SW rather than distilled water(DW),while the remaining 32 grew well either with SW or with DW.Six representatives with different morphological characteristics,including 1 SW-requiring strain and 5 well-growing with SW strains,were selected for phy-logenetic analysis based on 16S rRNA gene.Two strains belong to Micrococcaceae and Nocardiopsaceae respectively.The other 4 strains belong to the family of Streptomycetaceae.In the analyzed 6 strains,one was related to Nocardiopsis spp.and the other three were related to Streptomyces spp.,representing new taxa.Bioactivity testing of fermentation products from 3 SW-requiring strains and 21 well-growing with SW strains revealed that 17 strains possessed remarkable activities against gram-positive pathogen or/and tumor cells,suggesting that they were prolific resources for natural drug discovery.     

石油勘探开发数据元管理技术

ISO对数据元管理方面只规定注册管理,缺少数据元质量控制技术、分类管理、数据元搜索技术,难以满足实际应用需要.给出基于语义的石油勘探开发数据元管理架构;以基于油田领域本体的数据元语义形式化定义为基础,提出数据元质量控制模型、数据元分类模式、数据元搜索服务等管理技术.该技术已经应用于中国石化石油勘探开发数据元管理中.     

利用树轮宽度资料重建天山中段南坡巴仑台地区过去645年来的降水变化

在分析树木生长对气候要素响应的基础上,利用采自天山中段南坡夫斯坦沟的雪岭云杉树轮宽度年表,重建了巴仑台地区1360~2004A.D.当年7月至次年6月的降水量序列,方差解释量达53%(调整自由度后为52%)。交叉检验结果表明重建方程稳定可信。过去645a以来,巴仑台地区的降水量变化存在12个偏少阶段和12个偏多阶段。巴仑台地区降水量重建序列存在10.7~11、6.7和2.1a的显著准周期及16.5~17.2和2.4~6.6a的较显著准周期,并且在1496A.D.前后发生了降水量由少向多的突变。     

层状盐岩中储备库油气渗漏风险的故障树分析

油气渗漏是盐岩地下储备库事故的重要类型之一,具有突发性强、损失难以估计的特点。针对国内层状盐岩中储备库运营过程中的油气渗漏风险进行分析,揭示了油气渗漏事故的发生机制并建立了相应的故障树模型。通过对该模型的分析,找出了事故发生的各基本致因事件和故障模式,并得出适用于典型层状盐岩储备库油气渗漏事故的发生概率公式。分析结果表明,国内层状盐岩中储备库发生油气渗漏事故的可能故障模式有28种,且发生条件易于满足而难于防范,因此事故发生的可能性较大;按照各基本事件结构重要度的计算结果,盐岩强度低、盐岩蠕变过量、附近有断层、地震、造腔参数控制不当、非均匀地应力、人为操作失误等是层状盐岩中储备库油气渗漏事故的主要致因事件,并据此提出有效措施防止事故发生;通过专家调查法和故障树法的综合分析得出,金坛盐矿5口老腔储库在近10年的运营期内发生油气渗漏事故的概率为0.703%,属于偶发性事故。     

基于位移强度概念分析大坝变形规律

为改变以单个监测点为研究对象分析大坝变形规律的方法,提出位移强度概念,并以此作为分类标准,借鉴决策树算法,根据大坝所有监测点的坐标建立模型,计算并分析大坝在某一方向上的整体变形规律。