不同品系节旋藻cpcB基因上游序列的克隆与分析

采用体外克隆技术获得来自节旋藻6个品系的cpcB基因的257 bp的上游序列和217 bp的编码区序列,并和来自FACHB341的cpcB基因序列对应部分进行比较分析。结果表明,所获得的上游序列和编码区序列都有高度的保守性,而编码区所推导的氨基酸序列的保守性更高。启动子软件预测,在每一上游序列中都存在5条启动子序列,其中,FACHB439的启动子种类和结构与其他品系存在一定的差异。同时,FACHB439的翻译起始区mRNA二级结构与其他品系也有所不同。因此推测,在大多数品系节旋藻中藻蓝蛋白基因存在相同的表达调控机制,而品系FACHB439则可能存在一定程度的差异。     

凡纳滨对虾G蛋白Gαq基因的克隆和功能鉴定

为了寻找并克隆凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)G蛋白α亚基,为研究对虾的生理调控提供理论基础,通过简并PCR和RACE反应获得目的基因的全长cDNA序列;用Blast, DNAstar和Genedoc软件对所得序列进行分析,确定所得序列为凡纳滨对虾G蛋白Gαq基因,命名为pvGαq.将该基因的编码序列克隆到表达载体,通过免疫共沉淀实验和胞内Ca2 , IP3浓度的测定鉴定该Gαq亚基的功能,发现该亚基的序列和功能与其他Gαq家族成员具有高度保守性.用Western blotting分析发现pvGαq在对虾身体各部位存在普遍分布,尤其在脑神经、眼柄、腮和颚片中有大量表达,在嗅觉器官触角也有适量分布.说明了pvGαq在对虾生命活动中的重要性,为研究对虾的生理调控奠定了理论基础.     

海豚链球菌C5a肽酶功能活性区域表达及其对斑点叉尾(Ictalurus punctatus)的免疫保护作用

本研究对海豚链球菌DGX07株C5a肽酶基因序列进行了克隆和生物信息学分析, 表达了其功能活性区域, 并以斑点叉尾(Ictalurus punctatus)作为受试动物, 对该蛋白进行了免疫保护作用研究。结果显示, scpⅠ基因编码的氨基酸序列具有2个Peptidase_S8_S53超家族的保守结构域, 1个PA超家族的保守结构域和1个Fn3-like超家族的保守结构域, 推导其活性位点共有7个, 位于前501个氨基酸; 根据二级结构预测、疏水性分析、表面可及性、柔性分析和抗原表位分析, 推断该氨基酸序列的B细胞表位区域主要集中在第67—1098个氨基酸之间。因此, 本研究选取去掉信号肽的N段的前635个氨基酸(180—2085bp)进行表达。使用表达的重组蛋白pSCPⅠ免疫斑点叉尾, 抗体效价结果显示: 免疫后第四周抗体效价最高, 第五周后抗体效价开始下降, 相对免疫保护率为43.75%。以上结果表明重组pSCPⅠ蛋白具有较好的免疫保护作用, 能够作为海豚链球菌亚单位疫苗的候选之一。     

基于先进计算的智能入侵检测系统研究

计算机技术的发展改变了人类的生活,但是病毒入侵的风险性和机会也相应急剧增加。设计安全措施来防范未经授权访问地震信息系统的资源和数据,是当前地震系统主机或者地震信息网络安全领域的一个十分重要而迫切的问题。网络安全问题也是开展地震研究必须解决好的重要课题。入侵检测技术是近20年出现的一种主动保护自己免受攻击的网络安全技术,它在不影响网络性能的情况下对网络进行检测,从而提供对内部攻击、外部攻击和误用     

对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒(福建株)基因组的克隆

对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV)是世界各地养殖和野生对虾的重要病原之一.目前,GenBank已收录了分离自夏威夷、加利福尼亚、泰国、中国台湾等地的IHHNV全长或部分基因组序列.虽然中国大陆在养殖对虾中也普遍检测到了IHHNV,但未见其基因组序列报道.本文首先利用DNA末端加尾和嵌套PCR克隆了IHHNV基因组两末端序列,并根据测定的末端序列设计引物,PCR扩增出中国福建株IHHNV基因组序列.     

链霉菌FR—008大线性质粒PHZ227末端的克隆

采用中性溶菌结合超速离心的方法,从链霉菌ＦＲ－００８中直接提取了完整的１３０ｋｂ的大一质粒ＰＨＺ２２７,经蛋白酶Ｋ和限制性内切酶处理后,进行强迫克隆,生内切酶酶解和杂交实验证实已克隆到大线性质粒ＰＨＺ２２７的末端。     

香根草生长适宜性与抑螺效果研究

香根草是世界上公认的水土保持植物,但作为抑螺植物材料尚属首次。研究了香根草在4种典型生境条件下的年生长格局及抑螺效果。结果表明:香根草具极强的分蘖能力,每丛分蘖数在9株以上,能在1年内成为优势草本群落;在水肥条件好时,分蘖数和高生长明显增加;在水肥受限时,高生长受限,但地下生物量明显增加;香根草叶24h、48h的LC50(半致死浓度)值显示,其灭螺效果低于夹竹桃叶,而高于枫杨叶。综合分析表明,香根草能成为山丘型血吸虫疫区最理想抑螺草本植物,可在同类地区推广。     

墨吉明对虾c型溶菌酶基因的克隆及表达

克隆并鉴定墨吉明对虾(Fenneropenaeus merguiensis)的一种c型溶菌酶基因(Fm-Lyz),其cDNA全长为770 bp,包括71 bp的5′非编码区(UTR)、222 bp的3′UTR和477 bp完整开放阅读框,编码158个氨基酸。SMART分析显示,Fm-Lyz氨基酸序列包含1个LYZ1结构域和1个含18个氨基酸的信号肽。同源性分析发现,Fm-Lyz与斑节对虾(Penaeus monodon)溶菌酶同源性最高;进化树结果显示,Fm-Lyz与不同对虾的c型溶菌酶聚为一类。实时荧光定量PCR结果显示,Fm-Lyz在所测组织中均有表达,其中在血细胞中表达量最高。副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)和溶壁微球菌(Micrococcus lysodeikticus)感染后,Fm-Lyz表达量比对照组明显上调(P0.05),最高表达量时间分别为感染后24、12 h,暗示Fm-Lyz参与了墨吉明对虾的抗菌免疫防御。     

草鱼种质退化相关SRAP分子标记的筛选

采用相关序列扩增多态性（sequence-reared amplified polymorphism，SRAP）技术分析野生草鱼和家养草鱼，并筛选与草鱼种质退化相关的分子遗传标记。共进行88对引物组合的检测，产生标记数目共计905个。依据标记在群体中出现的频率和变化规律，共筛选出21个可能与种质相关的特异性标记，对这些特异性标记进行测序并将测序结果进行BLAST分析，发现测得片段中有8个片段能在GeneBank中找到同源性较高的序列，而其他片段与数据库中序列的相似性较低。     

Phylogenetic diversity of dinoflagellates in polar regions

Because of the limitations of sampling and seasonal study in polar regions, knowledge of dinoflagellate diversity, distribution and ecology are limited. Dinoflagellates have been incidentally reported from polar regions during some seasons and some populations have been reported as components of microalgae. Surveys of molecular diversity link the genotype of dinoflagellates from polar regions with environmental adaptation. In this study, 37 positive clones of dinoflagellates collected from different sites were used for genotype analysis, providing new insights into the biodiversity and distribution of these species based on 18S rRNA sequencing. Diverse genotypes were recorded for the summer season in Kongsfjorden (high Arctic) whilst a single novel genotype of dinoflagellate was recorded from winter samples from the Antarctic Ocean. Data from ice cores suggests that this single dinoflagellate genotype was adapted to extreme cold and clone library screening found that it was occasionally the only microbial eukaryotic genotype found in winter ice cores. The findings of this study could improve our understanding of the diverse dinoflagellate genotypes occurring in these perennially cold microbial ecosystems.