RNA二级结构的一种新的图形表示及其应用

生物序列的比对是计算生物学中的1个基本问题.最近有些生物学家给出了RNA二级结构序列的一些3-D和4-D图形表示方法,它们能给出RNA序列的比较直观的表述.文中提出RNA二级结构序列的1种新的图形表示方法.首先依据RNA中碱基分类,将RNA二级结构序列分为8个子序列,并分别对8个子序列建立特征曲线,得到相应的数字指标,构造特征向量,用以进行比对.最后用该方法对9个不同病毒的同一段RNA二级结构序列进行比对以验证其可靠性.     

春秋季山东南部近岸浮游细菌生态分布

分别于2007年4月(春季)和10月(秋季),对山东南部近岸海域进行了现场调查,研究了该海区浮游细菌丰度、生物量分布特征,探讨了它们与温度、溶解氧(DO)、总氮(N)、总磷(P)、硝酸盐(NO-3)、铵盐(NH+2)及活性磷酸盐(PO4-P)的相关性.结果表明:浮游细菌生物量具有一定的时间、空间分布特征,春季浮游细菌丰度及生物量要高于秋季,2个季节近岸细菌数量高于远岸区域;浮游细菌丰度及生物量与温度、DO、总P、NO-3、NH+2及PO4-P均呈显著相关关系(P<0.01),表明上述因子可能是该海域浮游细菌数量分布的主要限制因子.     

Pristine or altered: low-Mg calcite shells survived from massive dolomitization? A case study from Miocene carbonates

Low-Mg calcite shells have been widely used to reconstruct the chemistry of ancient seawater. There is always a question: are the shells chemically pristine? This paper presents the isotope and elemental geochemistry of low-Mg calcite bivalve shells in late Miocene platform carbonates, SE Spain. The platform carbonates were extensively dolomitized, and limestone is restricted to older stratal units, and to units mainly in topographically higher and more landward strata. Low-Mg calcite oyster shells were completely dissolved out in the basinward dolomite, but are well preserved in the limestone. These shells appear to retain the original growth microstructures, based on hand samples. Under the microscope, however, dissolution and recrystallization, as well as pristine growth lines are all present. Sr isotopes in these shells range from that of normal Miocene seawater to radiogenic values. δ¹⁸O and δ¹³C values, and Mg, Sr, and Na concentrations in these shells are rather variable. The high end members are consistent with the typical values of modern/late Miocene normal-seawater low-Mg calcite shells, whereas the low end members are close to those of diagenetic calcite cements, which have low δ¹⁸O, δ¹³C, Sr and Na values, and radiogenic Sr. The Nijar shells were altered physically and chemically to different degrees by diagenesis, although these shells are consistent with some “criteria” of unalteration. The isotopic and trace-element data collected in altered and pristine (or less altered) portions coexisting in the same shells are clearly differentiable. Quantitative simulation of covariations of geochemical pairs indicates that solid mixing of unaltered and altered portions by sampling is consistent with the variations in isotopic and elemental data recorded in the Nijar shells. The geological significance of this study is that ancient fabric-retentive calcite shells may have been altered geochemically although they may appear pristine. Calcite shells that underwent intensive diagenesis should be examined rigorously under the microscope, coupled with investigations of multiple geochemical proxies to assess chemical alteration. Only the data of unaltered shells can be used to reconstruct the chemistry of ancient seawater.     

基于GIS技术的耕地坡度分级方法

分析传统耕地坡度分级方法的缺陷,提出利用GIS技术的耕地坡度分级新方法。以枝江市董市镇为例实证,研究制定定量融合指标和工作流程,不仅有效地控制了耕地图斑的数量,而且确保利用耕地坡度分级数据统计汇总的各耕地坡度级面积数据与真实值基本一致,提高了汇总面积数据的精度。     

浅谈如何应用Pinnacle概算Javad GPS外业数据

简述了如何使用Pinnacle软件处理Javad公司生产的GPS接收机接收GPS数据的步骤及在生产实践中总结的一些作业经验.     

海洋毒素大田软海绵酸完全抗原的制备与分析

为了建立大田软海绵酸(Okadaic acid,0A)的免疫学检测方法,利用活泼酯法将OA分子中的羧基与栽体蛋白上的氨基偶联,人工制备OA的免疫抗原(OA-IgG)和检测抗原(OA-BSA),经电泳、动物实验及ELISA法进行了鉴定,完全抗原的偶联成功,为利用杂交瘤技术制备OA的单克隆抗体和海产品OA免疫学检测方法奠定了良好的基础.     

花鲈皮肤溃疡病抗性和敏感群体的RAPD分析

采用随机扩增多态性DNA技术,对花鲈(Lateolabrax japonicus)皮肤溃疡病抗性和敏感两个群体的遗传多样性进行了研究.从100个10 bp随机引物中筛选出25个随机引物,在两个群体中共扩增了326个位点,抗性群体多态住点比率为44.24%,遗传变异度为0.123 7,Shannon多样性值为0.1149,分别比敏感群体高3.87%,5.82%和2.68%,表明花鲈抗病群体比敏感群体具有更丰富的遗传多样性.25条随机引物中,7条引物在两群体中的扩增结果存在差异,其中S11,S15,S4,S414,S416,S9在抗性群体的扩增结果比敏感群体多1个多态住点,S52多2个多态位点.在这8个特异多态位点中,S52-1,S4-1,S414-6,S9-2在敏感群体中全部出现,呈单态性;S15-5,S11-6,S416-6,S52-5只在抗性群体中出现,出现频率分别为38.5%,30.8%,23.1%和23.1%.说明这8个位点在两群体中存在较大的差异.研究表明,花鲈皮肤溃疡病在遗传上是比较复杂的,并不是简单地与某个遗传标记有关,可能与多个遗传因素相关.     

蛋白质营养对高密度养殖凡纳滨对虾生长与免疫力的影响

在高密度养殖条件下,进行单因素随机设计动物试验.用5种饲料(蛋白质水平31%、35%、39%、43%、47%,以A～E组表示)分别投喂平均体质量6.2 g+0.2 g、平均养殖密度3.1 kg/m3的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei),探寻蛋白质营养对虾生长、免疫、水质、抗胁迫的影响特征.结果表明:(1)中高蛋白质水平具有显著促进对虾生长的效果,随着蛋白水平的提高,特定生长率先增加后降低,饲料系数正好相反,D组两指标最佳,分另q为110.98%和2.54;C、D、E组差异不显著.(2)中高蛋白质水平有利于提高对虾多数免疫指标的活力,血淋巴中血细胞浓度、T-AOC活力、POD活力、总蛋白含量、白蛋白、血蓝蛋白含量,随着蛋白质水平提高先增加后降低,前5指标含量均以D组最高,比A组显著提高16.8%～33.9%;而血蓝蛋白含量C组最高,比A组提高15.0%.(3)高蛋白质水平有利于提高对虾SOD活力,也显著增强抗低盐胁迫的能力,但同时极显著加大了水环境中氨氮和亚硝氮的污染.(4)在我国北方集约化高密度养殖条件下,凡纳滨对虾中后期生长阶段适宜的饲料蛋白质营养水平为39%～43%.     

水下光学无线通信的海水信道特性研究

提出了将具有比声学高达几倍的数据通信速率,良好的安全性和隐蔽性的光学无线通信技术应用于海军、海洋科学研究和水下工程等领域,实现高速率的水下无线通信技术实现海量数据的信息交换.基于生物光学特性的水下光学信道模型,建立了水下光学通信系统性能分析方法.并对基于发光二极管(LED)的水下光学无线通信系统进行了仿真,其结果表明所建立的方法可以进行各种海域水质环境的模拟,便于时水下光学无线通信系统性能进行预测评估,为水下光学无线通信系统的设计方案的评估提供了依据.     

壳聚糖硫酸酯金属配合物的抗氧化活性

以吩嗪硫酸甲酯-NADH为超氧阴离子自由基(O_2~(·-))产生、检测体系和EDTANa_2-Fe(Ⅱ)-H_2O_2为羟自由基(~·OH)产生、检测体系,对壳聚糖硫酸酯铜、锌配合物和不同分子质量壳聚糖进行了抗O_2~(·-)和~·OH自由基的活性研究.结果表明,壳聚糖硫酸酯金属配合物对于O_2~(·-)自由基的清除能力明显高于壳聚糖,在质量浓度为0.025 g/L时,壳聚糖硫酸酯铜配合物对O_2~(·-)自由基的清除能力达到94.18%,壳聚糖硫酸酯锌配合物达到93.19%;壳聚糖硫酸酯铜、锌配合物对~·OH自由基的清除能力(67.39%、60.46%)低于相同分子质量的壳聚糖(88.06%),而高于高分子质量壳聚糖761 ku(18.71%);壳聚糖分子质量大小对O_2~(·-)和~·OH自由基的清除能力有较大影响,质量浓度为1.6 g/L壳聚糖分子质量为20 ku时,对O_2~(·-)清除率达54.69%,而分子质量在761 ku时,对O_2~(·-)清除率仅为35.50%;各样品对O_2~(·-)和~·OH自由基的清除能力均随着质量浓度的增加而上升,壳聚糖硫酸酯铜、锌配合物在相当低的浓度下(0.025 g/L)就可以达到明显清除O_2~(·-)自由基的效果(≥90%).