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11.
中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)基因组微卫星特征分析   总被引:15,自引:1,他引:15  
对中国对虾基因组随机测序,获得了总长度约为641000个碱基的基因组DNA序列,从中找到1362个重复序列。其中,两碱基重复类型的重复数目最多(985个),占重复序列总数目的72.32%;其次是三碱基(149个)和四碱基(102个),分别占重复序列总数目的10.94%和7.49%。另外,六碱基重复34个,单碱基重复50个,五碱基重复5个,分别占重复序列总数目的2.50%、3.67%、0.37%。在单碱基重复类型中,重复拷贝类别为A的重复数目最多;两碱基重复类型中,AT重复数目最多,其次是AC和AG;三碱基重复类型中以AAT重复拷贝类别最多.其次是AAG和ATC;四碱基重复类型中,AGAT重复数目最多;五碱基重复类型只发现了AGAGA、GAGGC、TCTYC和TTTCT四种重复拷贝类别;六碱基重复中以ATTATC重复数目最多。其中一些序列已经提交GeneBank注册,注册号为AY545898-AY545913。中国对虾基因组二碱基重复类型中以不完全(Imperfect)形式的微卫星序列为主,其中GC重复拷贝类别的重复数目很少。利用8对微卫星引物对60个个体遗传多样性分析,共获得了60个等位基因,因此认为微卫星技术在中国对虾基因组研究中具有较好的应用前景。  相似文献   
12.
中国海五种群三疣梭子蟹的形态差异分析   总被引:3,自引:0,他引:3  
运用三种多元分析方法,即聚类分析、主成分分析和判别分析,通过测量三疣梭子蟹23个形态学性状参数,对中国海大连海区、东营海区、连云港海区、舟山海区和湛江海区5个种群三疣梭子蟹的形态差异进行了比较研究。聚类分析结果表明,连云港种群和东营种群形态最为相似(形态距离0.07),大连种群与东营种群、大连种群(dl)与舟山种群(zs)的趋异程度逐渐增加,形态距离分别为0.08和0.09,而湛江种群的趋异程度最大,与其余4种群的形态距离达0.15以上。主成分分析构建了3个主成分,其贡献率:主成分1为27.39%,主成分2为15.23%,主成分3为10.27%,累积贡献率为52.89%。在第1主成分中,比例性状ICM/CL、BCW/CL、PWC/CL和SW/CL的影响比较大。判别分析结果表明,5个海区种群之间的形态差异极显著(P0.01),通过建立5个地理种群的判别函数,结果判别准确率P1为63.64%~94.44%,P2为67.74%~92.86%,综合判别率为82.24%,因此,该判别方程具有较高的判别效果。  相似文献   
13.
为寻找三疣梭子蟹体色相关的分子标记,本文用RAPD方法对紫色和茶绿色两种三疣梭子蟹基因组DNA进行体色相关遗传标记的筛选及其遗传多样性分析。从80个随机引物中共筛选了30个重复性好多态性高的引物,RAPD分析结果表明:紫色梭子蟹个体组成的群体多态性位点比例为61.29%,Nei氏基因多样性指数为0.3756,Shannon信息指数为0.5545;茶绿色梭子蟹个体组成的群体多态性位点比例为62.44%,Nei氏基因多样性指数为0.3451,Shannon信息指数为0.5099。紫色和茶绿色三疣梭子蟹之间Nei氏无偏差遗传相似性指数为0.9682,遗传距离为0.0323。这些结果表明,紫色和茶绿色三疣梭子蟹群体的遗传多样性程度接近,具有相似的遗传多样性基础。另外,有2个随机引物(SBSA09和SBSG16)扩增得到群体特异性片段各1条。  相似文献   
14.
为了探讨光色对水生生物生长和免疫的影响,本实验研究了5种光照环境对脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)生长、消化和非特异性免疫相关酶活力的影响。结果显示:(1)全光谱组的增重率(WGR)(63.76%±0.34%)、特定生长率(SGR)(1.63%±0.03%)和存活率(SR)(61.11%±1.92%)均显著高于其他4种光色(P<0.05);(2)绿光组的糜蛋白酶活力(4.02 U/mgprot±0.38 U/mgprot)最高;全光谱组的α-淀粉酶(α-AMS)活力(213.95 U/mgprot±16.30 U/mgprot)最高,与绿光组和黑暗组之间差异不显著(P>0.05);黄光组的脂肪酶(LPS)活力(19.21 U/gprot±2.53 U/gprot)最高,与黑暗组、绿光组和蓝光组之间差异不显著(P>0.05);(3)绿光组的总超氧化物歧化酶(T-SOD)活力(33.26U/mgprot±7.08U/mgprot)和总抗氧化能力(T-AOC)活力(2.31单位/mgprot±0.23单位/mgprot)均最高,与全光谱组之间差异不...  相似文献   
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