BAC end sequencing of Pacific white shrimp <Emphasis Type="Italic">Litopenaeus vannamei</Emphasis>: a glimpse into the genome of Penaeid shrimp

Little is known about the genome of Pacific white shrimp (Litopenaeus vannamei). To address this, we conducted BAC (bacterial artificial chromosome) end sequencing of L. vannamei. We selected and sequenced 7 812 BAC clones from the BAC library LvHE from the two ends of the inserts by Sanger sequencing. After trimming and quality filtering, 11 279 BAC end sequences (BESs) including 4 609 paired- ends BESs were obtained. The total length of the BESs was 4 340 753 bp, representing 0.18% of the L. vannamei haploid genome. The lengths of the BESs ranged from 100 bp to 660 bp with an average length of 385 bp. Analysis of the BESs indicated that the L. vannamei genome is AT-rich and that the primary repeats patterns were simple sequence repeats (SSRs) and low complexity sequences. Dinucleotide and hexanucleotide repeats were the most common SSR types in the BESs. The most abundant transposable element was gypsy, which may contribute to the generation of the large genome size of L. vannamei. We successfully annotated 4 519 BESs by BLAST searching, including genes involved in immunity and sex determination. Our results provide an important resource for functional gene studies, map construction and integration, and complete genome assembly for this species.     

2000年夏季莱州湾生态环境要素的分布特征

论文依据 2 0 0 0年夏季 8月 2 9日至 9月 2日莱州湾的 1次综合性生态环境调查资料 ,给出了表、中、底 3层的平均温度、盐度、主要营养盐浓度及其比例和叶绿素 a浓度 ,分析了莱州湾的温盐结构、主要营养盐和叶绿素 a的分布特征。由于莱州湾的水深较浅 ,各要素的垂直分布都比较均匀。生态环境要素的水平分布表现为小清河口为高温、低盐、高营养盐和高叶绿素 a浓度区 ,小清河口东测的湾顶区域为高温、高盐、相对低的营养盐和叶绿素 a浓度区。此次观测到的盐度较 1997年以前有明显升高。莱州湾各层平均的 N/ P和 Si/ N分别为 16.73和 1.67,都比 1998～ 1999年渤海中部的值大 ,但 N/ P比 1992 ,1995和 1996年莱州湾的 N/ P明显偏低。叶绿素 a浓度与硅酸盐浓度之间有较好的相关关系 (α=0 .0 1) ,表、中、底 3层叶绿素 a浓度同硅酸盐浓度的线性相关系数分别为 :0 .5 4 ,0 .68和 0 .67     

辽宁地区活动断裂对输油管道影响的研究

本文对辽宁地区６个输油管道段两侧１０ｋｍ范围内的断层活动性进行了研究，其中有５条晚更新世－全新世断裂与管道相交，交叉点共有８处。在此基础上，重点研究了跨断层输油管道的震害特点，给出了不同地震烈度下剪切与弯曲破坏概率及震害预测结果。     

祁连山老虎沟12号冰川退缩对细菌优势种群影响的初步研究

随着全球冰川正在越来越多的地区融化, 冰川微生物资源很可能会由于冰川退缩而未被人类所发现就已受到生存的威胁而濒危.以祁连山老虎沟12号冰川消融区和末端雪样及末端土样为研究对象, 采用培养方法、分子鉴定, 研究冰川雪样优势菌群在冰川末端土样的分布状况及生理生化指标变化情况, 分析冰川细菌优势菌群在冰川退缩后适应非雪环境的能力.结果表明: 冰川末端雪样优势菌为1BW1和1BW2所代表的Pedobacter, 该属在冰川消融区雪样和冰川末端土样中未分离到; 冰川消融区雪样优势菌为2BW所代表的Acinetobacter, 该属在冰川末端雪样中的数量较少, 在冰川末端土样中的数量更少.不同采样位点16S rRNA序列相似性高的菌株其生理生化特征比相同采样位点的大.因此, 冰川冰退缩可能会引发冰川雪样中的优势种群不能适应新环境而灭绝. 应加强冰川细菌资源利用和保护的研究基础.     

日降水量空间插值方法研究

采用反距离权重法和普通克里格方法对26°~34°N, 103°~115°E范围内2004年逐日降水量进行空间插值试验分析, 分辨率为1 km×1 km。采用交叉检验方法和准确率方法对两种方法插值的总体效果及不同等级的降水插值效果进行综合对比。结果表明:两种方法插值效果近似, 插值结果与实测值相关系数分别为0.83和0.82。但对日雨量较大的情况, 两种方法插值效果均有所降低, 相关系数为0.66和0.67。两种方法的实测值与插值结果的相关系数在不同季节非常接近, 并且均以春季最大, 其次为冬、秋季, 夏季相关系数最小; 通过采用平均误差、平均绝对误差和均方根3个指标衡量及不同等级雨量的插值准确率统计比较, 普通克里格方法插值效果略好于反距离权重法。     

全球增暖的另一可能原因初探

太阳是地球流体(大气和海洋等)运动的最终能量源,地球环境,尤其是气候的变化不能不与太阳活动有关.目前,普遍将全球增暖归结为温室气体含量增加所导致的温室效应的加剧,这无疑是有一定依据和有道理的.但从科学上来讲,人类活动所引起温室气体增加的影响,并非是唯一原因.基于已有的一些研究结果,从太阳活动的观点所进行的初步分析表明,太阳活动也可能是引起近世纪全球增暖的另一个重要原因.太阳活动的影响主要包括太阳辐射的直接影响和引发地磁场变化的间接影响两个方面,地球磁场的变化将可通过动力过程和热力过程而影响大气环流和气候的变化.     

青海日月山断裂德州段断错地貌的高分辨率遥感影像解译

青海日月山断裂带是青藏高原东北缘柴达木—祁连活动地块内部的一条NNW走向的右旋走滑兼逆冲断裂。 本文基于ENVI 5.1遥感图像处理平台对研究区高分一号多光谱(分辨率8 m)和全色(分辨率2 m)影像进行融合, 获取了高保真、 高分辨率的卫星遥感影像。 通过多尺度、 多角度、 多层次的构造解译以及对比, 将日月山西支断裂的海晏段划分为德州段(F_1-3)和海晏段(F_1-4)两个次级段, 同时利用高分辨率Google Earth影像对德州段断错微地貌进行了解译、 分析, 结合对德州段野外地质考察, 进一步验证了影像解译结果。 研究表明: 日月山断裂的德州段由5条次级段落组成(f₁, f₂, f₃, f₄, f₅), 并且该段断裂晚更新世以来活动性明显, 以右旋走滑为主兼有逆倾滑分量; 断裂在晚更新世以来发生过多期断层活动, 其中全新世断层活动可划分为两期, 最新一期水平位错量为6.5~8.7 m, 第二期水平位错量为12.3~14 m; 晚更新世也可划分出两期活动, 第一期水平位错量为16~20 m, 第二期水平位错量为28.5~47 m。     

一种基于重要性评估的河网分级方法

提出了一种改进的河网分级方法,该方法首先对河段的重要性程度进行评估,并利用树结构实现河网的拓扑关系;之后基于河段重要性指数筛选河网主干,并利用主干抽离算法对河网进行逐层遍历;最后基于遍历结果完成河网地层次划分。试验表明,新方法在算法性能和分级结果上均优于传统方法,因此,新方法能够更好地应用于实际的河网分级工作中。     

Impact assessment of urbanization on flood risk in the Yangtze River Delta

The Yangtze River Delta region is the region with highest urbanization speed in China. In this study, 6 typical urbanization areas in Yangtze River Delta were selected as the objectives of study. Flood risk assessment index system was established based on the flood disaster formation mechanism, and analytic hierarchy process was utilized to define the weight of indices. The flood hazard, the exposure of disaster bearing body, the vulnerability of disaster bearing body and the comprehensive flood risk corresponding to three typical years in different urbanization stages, 1991, 2001 and 2006 were assessed. The results show that the flood hazard and the exposure of disaster bearing body in the 6 areas are all with an increasing trend in the process of urbanization, among which, the increasing trend of the exposure of disaster bearing body is especially obvious. Though the vulnerabilities of disaster bearing body in the 6 areas are all with decreasing trend owe to the enhancement of flood control and disaster mitigation capability, the comprehensive flood risks in the 6 areas increased as a whole, which would pose a serious threat to urban sustainable development. Finally, effective countermeasures for flood risk management of urbanization areas in Yangtze River Delta were put forward based on the assessment results.     

ODP与冲绳海槽海底热水活动研究

本文简要介绍了ＯＤＰ与海底热水活动研究，冲绳海槽中部现代海底热水活动区热水活动研究简况及其热水活动特征；就冲绳海槽中部热水活动研究中存在的问题与ＯＤＰ在冲绳海槽热水区钻探的科学目标进行了讨论。