桂枝-柴胡治疗慢性心衰伴抑郁的网络药理学研究

目的：运用网络药理学方法挖掘桂枝-柴胡治疗慢性心力衰竭（CHF）伴抑郁（MDD）的主要活性成分、靶点及信号通路,探究其潜在作用机制。方法：通过TCMSP数据库和相关文献检索桂枝-柴胡主要活性成分及其作用靶点,经BATMAN-TCM平台对预测靶点予以补充,构建药物靶点库;通过GeneCards、DisGeNET数据库分别获取CHF与抑郁相关靶标,二者取交集,建立疾病靶标库;利用R语言将药物靶点库与疾病靶标库取交集,构建Venn图;通过STRING数据库和Cytoscape 3.7.1软件及其内在插件构建化合物-靶标网络及PPI核心网络;最后利用DAVID数据库对核心网络靶点进行GO富集和KEGG通路注释分析。结果：筛选出桂枝-柴胡有27个活性成分,288个靶基因;筛选出CHF伴MDD相关靶基因882个,药物与疾病Venn图提取关键靶点83个,PPI核心网络构建筛选出12个关键基因;GO分析（P＜0.05且靶点基因富集度>10%）得到19条生物过程,13条细胞组分表达过程,8个分子功能相关过程;KEGG分析（P＜0.05）显示72条信号通路,包括HIF-1信号通路、TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路、神经活性配体-受体相互作用信号通路等。结论：桂枝-柴胡活性成分通过多成分、多靶点、多通路发挥CHF伴MDD的治疗作用。     

基于网络药理学探讨玉屏风散治疗支气管哮喘的作用机制

目的：运用网络药理学筛选玉屏风散治疗支气管哮喘的作用靶标及信号通路,为临床治疗提供有力依据。方法：利用TCMSP筛选中药活性成分和有效成分靶点信息。利用Uniprot数据库和Excel找出有效成分靶点信息基因名。在GeneCards、OMIM、Drugbank数据库搜集疾病相关靶标,采用Venny软件对中药靶点基因与疾病靶点基因取交集,得到Venny交集图。将各个中药靶点基因共同输入Cytoscape软件,得到中药-靶标调控网络。通过String软件构建中药-疾病共同靶标的蛋白互作网络。将中药-疾病共同靶点基因进行GO和KEGG功能富集分析,采用Cytoscape软件做出共同靶点通路。结果：筛选得到玉屏风散治疗支气管哮喘的主要活性成分17个,中药-疾病共同靶点基因114个,推断其作用机制可能与糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、癌症途径、IL-17信号通路、PI3K-Akt信号通路等相关,并且可能起到关键作用。结论：基于网络药理学探讨玉屏风散治疗支气管哮喘的作用机制,有利于临床治疗。     

基于网络药理学与分子对接法探讨补肾骨蚀方治膝骨关节炎的作用机制

目的：基于网络药理学与分子对接法探讨补肾骨蚀方治疗膝骨关节炎（KOA）的作用机制。方法：通过TCMSP数据库筛选补肾骨蚀方的活性成分及相关靶点,通过Genecards、OMIM数据库获取KOA相关基因数据。使用R软件获取补肾骨蚀方与疾病的交集靶点,利用STRING数据库对交集靶点构建蛋白互作网络,利用R软件进行GO与KEGG富集分析,运行Autodock Vina对活性成分及关键蛋白进行对接。结果：补肾骨蚀方有效成分84种,相关靶点240个,KOA相关靶点2270个,交集靶点124个。GO富集显示包括生物过程相关条目2334条,细胞成分相关条目70条,分子功能相关条目169条。KEGG功能富集分析发现前列腺癌、肿瘤坏死因子信号通路、人巨细胞病毒感染、流体切应力和动脉粥样硬化、糖尿病并发症中AGE-RAGE信号通路、卡波济肉瘤相关疱疹病毒感染等132条信号通路。分子对接初步验证了补肾骨蚀方主要活性成分能与关键靶点发生相互作用。结论：补肾骨蚀方可能通过抑制炎症因子表达,调节骨代谢及抗氧化治疗KOA,这对后续方药研究及临床应用具有指导意义。     

基于网络药理学的仙鹤草-鸡血藤治疗原发免疫性血小板减少症的作用机制研究

目的：基于网络药理学方法研究仙鹤草-鸡血藤治疗原发免疫性血小板减少症（ITP）的作用机制。方法：通过TCMSP平台筛选仙鹤草-鸡血藤的活性成分及其对应的靶基因,搜索疾病靶点、仙鹤草-鸡血藤治疗ITP的共同靶标基因,构建仙鹤草-鸡血藤活性成分-ITP靶标基因关系网络图、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果：获得仙鹤草-鸡血藤活性成分29种,作用靶点663个,疾病相关靶点1001个,成分-疾病-靶点47个。PPI网络显示,肿瘤坏死因子、白介素-6、白介素-1β、信号转导及转录激活蛋白3等靶点与仙鹤草-鸡血藤治疗ITP的关系最为密切。GO功能富集分析中,生物过程主要集中在对炎症反应、细胞对有机化合物的反应、对脂多糖的反应等;分子功能主要集中在蛋白结合、细胞因子活性、相同的蛋白质结合等;细胞组分主要集中在细胞外间隙、等离子膜外侧、细胞外区域等。KEGG 通路富集分析主要包括肿瘤坏死因子信号通路、趋化因子信号通路、Toll样受体信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶-丝氨酸-苏氨酸激酶信号通路等。结论：仙鹤草-鸡血藤可通过多靶标、多途径发挥治疗ITP的作用。     

基于网络药理学研究桃仁-红花的药效活性成分及其治疗葡萄胎的分子机制研究

目的：基于网络药理学预测桃仁-红花治疗葡萄胎（HM）的分子作用机制。方法：以网络药理学方法为基础,依托中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）筛选桃仁-红花的活性成分及作用靶点;借助GeneCards、OMIM、Drug Bank、PharmGKB等数据库筛选葡萄胎的疾病靶标,绘制Venn图,构建药对-疾病“活性成分-作用靶点”网络图,绘制蛋白互作网络（PPI）,完成GO和 KEGG 富集分析,进一步用分子对接来验证和筛选靶点。结果：研究共筛选得到槲皮素、木犀草素等8个活性成分,分别作用于AKT1、TP53、EGFR等39个相关靶点;GO富集分析显示桃仁-红花的活性成分主要涉及凝血、改善血流动力学、调控细胞凋亡和细胞增殖、抗炎等生物学过程。KEGG富集通路HM有显著作用的有MAPK信号通路、血流剪切应力与动脉粥样硬化信号通路等;分子对接进一步验证了槲皮素与AKT1的相关性。结论：桃仁-红花药对包括槲皮素、木犀草素等8个活性成分,其治疗葡萄胎主要通过多靶点多通路起作用,为后续临床治疗葡萄胎提供了新的思路。     

基于网络药理学探讨附子-细辛对高血压病的作用机制

目的：基于网络药理学研究附子-细辛对高血压病的作用机制。方法：运用TCMSP数据库挖掘出附子-细辛的有效成分及药物预测靶点,采用5个生物信息数据库检索出高血压病的疾病预测靶标,构建药物靶点-疾病靶标交集,使用Cytoscape生物信息分析软件绘制“成分-靶点-疾病”中药调控网络,基于STRING数据库构建“药物-疾病”相关靶点的蛋白互作网络（PPI）,并对其进行GO和KEGG的生物信息学分析。结果：通过生物利用度和类药性筛选得到附子-细辛的有效成分29个,对应药物靶点1807个,高血压病的疾病靶标8505个,构建的药物靶点-疾病靶标交集80个。与高血压病密切相关的GO富集条目91个,KEGG信号通路123条,主要涉及流体剪切应力与动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、白细胞介素（IL）-17信号通路、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）信号通路、PI3K-Akt信号通路等。结论：附子-细辛药对与高血压病密切相关,能够通过一条或多条通路协同发挥药效作用,考虑其可能是通过干预血液的流体剪切应力影响动脉粥样硬化与心血管重塑再生而实现的。     

基于网络药理学与分子对接技术探讨青蛇方外用治疗湿疹的作用机制

目的：基于网络药理学与分子对接技术探讨青蛇方外用治疗湿疹的作用机制。方法：应用TCMSP和UniProt数据库平台查询青蛇方组方的有效活性成分及靶基因,与疾病靶基因取交集后构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;应用DAVID数据库,对潜在核心作用靶点基因进行基因本体（GO）功能、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。利用分子对接原理论证青蛇方生物活性成分与核心靶点的分子结合能力。结果：筛选出青蛇方有效成分63种,作用靶点99个;主要有β-谷甾醇、2,4,7-三羟基-9,10-二氢菲、靛蓝素、豆甾醇、色氨酸等关键成分;转录因子AP-1（JUN）、肿瘤坏死因子（TNF）、原癌基因（RELA）、干扰素γ（IFNG）、转化生长因子-β1（TGF-β1）等核心基因。关键信号通路有癌症信号通路、恰加斯病通路、弓形体病通路、脂质和动脉粥样硬化通路等,分子对接结果显示活性成分与核心靶点基因结合能力较强。结论：青蛇方外用可以通过多种活性成分、多种通路有效抑制免疫炎症反应,促进免疫系统正常运行,从而达到治疗湿疹的目的。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨罗汉果治疗糖尿病的作用机制

目的：运用网络药理学和分子对接技术探讨罗汉果治疗糖尿病的作用机制。方法：通过TCMSP平台和Swiss Target Prediction数据库筛选出罗汉果的活性成分及其靶点;利用GeneCard、TTD、OMIM数据库筛选出糖尿病潜在靶点;采用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-活性成分-疾病-靶点的可视化网络;通过STRING数据库对关键靶点构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;利用Metascape数据库进行基因本体（GO）功能以及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;利用Autodock4和Pymol软件对关键活性成分和关键靶点进行分子对接分析和可视化。结果：筛选出有效成分18种,糖尿病靶点146个。GO功能富集分析得到GO条目572条,KEGG通路富集分析得到信号通路167条。分子对接结果显示β-谷甾醇、山柰酚、罗汉果醇等关键活性成分与原癌基因酪氨酸蛋白激酶（SRC）等关键靶点的亲和力较高。结论：罗汉果通过多靶点、多通路发挥抗糖尿病的作用,其关键活性成分通过与SRC、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1（AKT1）、丝裂原活化蛋白激酶3（MAPK-3）等靶点调节晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体（AGE-RAGE）、缺氧诱导因子1（HIF-1）、磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶（PI3K-Akt）等信号通路起到治疗糖尿病的作用。     

基于网络药理学分析七味白术散治疗腹泻的机制

目的：利用网络药理学构建七味白术散药效成分、腹泻、靶点及通路间的网络关系,探讨七味白术散治疗腹泻的作用机制。方法：利用中药系统药理分析平台查询筛选七味白术散的药效成分及对应靶点,从GeneCards数据库获取腹泻相关靶点,使用在线软件Venny 2.1筛选药物与疾病作用的交集靶点;基于David数据库对潜在靶标进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。利用STRING在线数据库构建蛋白相互作用网络;用Cytoscape软件绘制活性成分-疾病靶点关系网络。结果：七味白术散的药效成分有125种,以黄酮类成分为主;其治疗腹泻的关键靶点有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶（AKT1）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、白细胞介素-6（IL-6）、肿瘤抑制因子p53（TP53）等。GO富集分析后得到与生物过程（BP）相关的有药物响应、基因表达调控、细胞凋亡调控和RNA聚合酶II启动子的转录调节;KEGG通路主要涉及乙型肝炎、结直肠癌、胰腺癌、锥虫病、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、膀胱癌等。结论：七味白术散中的主要成分为黄酮类,通过抑制炎症反应及促进肠黏膜修复等途径起到抗腹泻的作用。     

基于网络药理学探讨黄芪对肾小球肾炎的作用机制

目的：运用网络药理学的方法探讨黄芪治疗肾小球肾炎的作用机制。方法：利用TCMSP平台获取黄芪的活性成分及相关的潜在靶点,通过Gene Cards数据库检索有关肾小球肾炎的相关疾病靶点,对中药-疾病靶点取交集,得到黄芪-肾小球肾炎的药效靶点,并采用Cytoscape3.7.2软件构建黄芪-肾小球肾炎靶点网络;使用String数据库进行蛋白相互作用网络（PPI）的绘制;借助R语言以及Bioconductor数据库对黄芪治疗肾小球肾炎潜在作用靶点进行GO分子功能分析和KEGG通路分析。结果：筛选得到黄芪的20个有效成分及98个中药-疾病共同靶标,GO分子功能显示黄芪治疗肾小球肾炎主要涉及细胞因子受体结合、核激素受体结合、细胞因子活性、受体配体活性、转录因子活性等方面。KEGG通路分析结果显示,黄芪治疗肾小球肾炎核心靶点主要涉及晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体（AGE-RAGE）信号通路、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、白细胞介素-17（IL-17）信号通路、Toll样受体信号通路、缺氧诱导因子-1（HIF-1）信号通路等。结论：黄芪对于肾小球肾炎的治疗作用是多成分-多靶点-多途径的过程,基于网络药理学对此的研究,为临床应用黄芪治疗肾小球肾炎提供了参考价值。     

基于网络药理学与分子对接探讨青风藤干预膝骨关节炎的作用机制

目的：应用网络药理学与分子对接技术探讨青风藤治疗膝骨关节炎（KOA）的作用机制。方法：从TCMSP数据库中提取青风藤的化学成分,获得药物靶点及疾病相关基因,筛选交集靶点,获得青风藤治疗 KOA 的作用靶点。对交集靶点及相关信号通路利用数据库进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。通过分子对接平台进行分子对接。结果：获得青风藤化合物主要化学成分6种、疾病基因643个、药物与疾病交集靶点11个。网络分析结果显示,青风藤通过调控肿瘤信号通路、糖尿病并发症中的糖基化终末产及其受体信号通路（AGE-RAGE）、细胞凋亡信号通路、肿瘤抑制蛋白p53 信号通路（p53）、血清素突触信号通路等作用于前列腺素 G/H 合酶 1（PTGS1）、前列腺素-内过氧化物酶合酶 2（PTGS2）、过氧化物酶体增殖物激活受体（PPARG）、B淋巴细胞瘤-2（Bcl-2）、转化生长因子β-1前蛋白（TGFB1）、胱天蛋白酶3（CASP3）等关键靶点,通过干预细胞凋亡、抑制炎症等发挥治疗KOA的作用。分子对接结果显示,青风藤核心成分β-谷甾醇（beta-sitosterol）、青藤碱（Sinomenine）与核心靶点结合高度稳定。结论：青风藤治疗KOA是多通路、多靶点共同作用的结果,其作用机制与细胞凋亡、炎症关系最为密切。     

基于网络药理学探讨黄芪治疗糖尿病肾病的作用机制

目的：探讨黄芪治疗糖尿病肾病的作用机制。方法：本研究通过中药系统药理学分析平台（TCMSP）数据库获取黄芪中含有的活性成分及成分所对应的靶点,通过GeneCards数据库挖掘糖尿病肾病疾病靶点,结合化合物及疾病靶点,构建成分-靶点网络图,并针对靶点进行基因本体（GO）富集分析及KEGG通路富集分析。结果：黄芪中含有 24个活性成分,对应糖尿病肾病110个靶点,可通过AGE-RAGE 信号通路、PI3K-AKT信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、白细胞介素（IL）-17信号通路等调控糖尿病肾病增殖、凋亡、炎症等过程。结论：网络药理学研究表明黄芪可通过多种通路途经发挥作用,可为今后开展黄芪治疗糖尿病肾病相关实验验证提供依据。     

基于网络药理学探讨玉屏风散治疗过敏性紫癜的作用机制

目的：基于网络药理学方法探讨玉屏风散治疗过敏性紫癜（HSP)的作用机制。方法：利用TCMSP、Pubchem、Swiss target prediction等数据库平台,对玉屏风散的有效活性成分和有效靶点基因进行检索、收集和筛选。通过Genecards、Disgenet、OMIM数据库查询和挖掘HSP的相关基因和玉屏风散治疗HSP的交集靶点,STRING数据库和Cytoscape 3.9.1 软件构建活性-成分-靶点可视化网络和可视化分析。运用DAVID数据库进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：筛选出45个玉屏风散活性成分,212个药物靶点,294个疾病靶点和35个交集靶点,对关键靶点进行蛋白质-蛋白质互作（PPI）网络构建,涉及的主要基因有肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素-6、血管内皮生长因子A、白细胞介素-1β、肿瘤蛋白p53、基质金属蛋白酶-9、趋化因子c-c配体2、白细胞介素-10、丝氨酸蛋白酶抑制因子肽酶抑制因子、CXC趋化因子配体8等。GO功能富集分析得到条目数337个,其中生物过程条目284个,分子功能条目35个,细胞组成条目22个。KEGG通路富集分析得到信号通路101条,主要涉及高级糖基化终末产物-受体信号通路、流体剪切应力和动脉粥样硬化信号通路、脂质和动脉硬化信号通路、疟疾信号通路、白细胞介素-17信号传导通路、TNF信号通路、核因子-κB信号通路等。结论：玉屏风散可能通过多成分、多靶点、多通路治疗HSP。     

基于网络药理学探讨散结消瘤方治疗乳腺癌的作用机制

目的：基于网络药理学方法探究散结消瘤方治疗乳腺癌的主要作用靶标和主要通路。方法:通过TCMSP平台检索散结消瘤方的活性成分及其对应靶标。利用UniProt和GeneCards数据库获得潜在靶标基因。使用Cytoscape 3.9.0软件构建散结消瘤方的“成分-靶标”网络。使用Bioinformatics平台将药物靶蛋白和疾病靶点相映射,并绘制Venny图。结合STRING数据库及Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。利用Database for Annotation、DAVID生物信息资源数据库对散结消瘤方的作用靶标进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果:获得散结消瘤方主要活性成分196种,包括β-谷甾醇、木犀草素、甘草查尔酮及槲皮素等,其中与乳腺癌相关的作用靶标有112个,包括肿瘤蛋白P53、雌激素受体1、丝氨酸特异性蛋白激酶1、原癌基因、氨基端激酶等。涉及的生物过程为激素应答、无机物反应等;细胞组分为激酶结合、蛋白质激酶结合等;分子功能为转录调节复合物、膜筏等。主要涉及癌症途径、脂质和动脉粥样硬化、磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶信号、乙型肝炎等通路。结论：散结消瘤方治疗乳腺癌具有多靶点、多机制的优势,为散结消瘤方治疗乳腺癌具体作用机制和新药的研发提供依据。     

基于网络药理学探讨荷叶抗非酒精性脂肪肝的作用机制

目的：基于网络药理学探讨荷叶抗非酒精性脂肪肝（NAFLD）的作用机制。方法：利用TCMSP平台和Swiss Target Prediction 等数据库搜集荷叶活性成分和作用靶点。通过GeneCard、GenCLiP3数据库获取NAFLD的相关靶点,利用Cytoscape 3.8.2 软件构建荷叶成分-疾病-靶点蛋白网络。使用STRING数据库和Cytoscape 3.8.2 软件构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,进行基因本体（GO）功能与京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：获得荷叶活性成分15种,潜在靶点441个,疾病相关靶点1316个,成分-疾病-靶点161个。PPI网络显示,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、白细胞介素6、肿瘤抑制基因 p53、血管内皮生长因子、肿瘤坏死因子等靶点与荷叶抗NAFLD的关系最密切。GO功能主要有药物的反应、凋亡过程的负调控、胞液、核浆、细胞质、线粒体酶结合、细胞因子活性、转录因子结合等。KEGG通路主要涉及乙型肝炎、癌症的途径、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、Toll样受体信号通路、NOD样受体信号通路、缺氧诱导因子-1信号通路等。结论：荷叶通过调控161个靶点参与TNF信号通路、Toll样受体信号通路、NOD样受体信号通路等作用于NAFLD。     

基于网络药理学探究晕清降压方治疗代谢性高血压病的作用机制

目的：通过网络药理学方法筛选国医大师刘祖贻验方晕清降压方治疗代谢性高血压病的作用成分,并探讨其潜在作用机制。方法：从TCMSP及BATMAN-TCM数据库中筛选出晕清降压方的活性成分及作用靶点。从OMIM及GeneCards中筛选出代谢性高血压病的靶点。利用Bioinformatics & Evolutionary Genomics平台将晕清降压方成分靶点与代谢性高血压病的靶点进行映射,获得晕清降压方-代谢性高血压病的共同靶点,并将其导入STRING数据库获得蛋白-蛋白网络模型,构建“活性成分-靶点”网络,对共同靶点进行GO富集分析及KEGG富集分析。结果：晕清降压方有114种活性成分可能通过143个靶点发挥抗代谢性高血压病的作用;GO富集分析及KEGG富集分析显示,晕清降压方治疗代谢性高血压病主要通过PI3K-AKT信号通路、流体剪切力与动脉粥样硬化、AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、内分泌抵抗等发挥作用。结论：从晕清降压方的12味中药中筛选出114个具有抗代谢性高血压病的活性成分,这些活性成分通过多个靶点、多条通路发挥抗代谢性高血压病的作用。     

基于网络药理学与体外细胞实验探讨复方清痹片治疗类风湿性关节炎的作用机制

目的：基于网络药理学与体外细胞实验探讨复方清痹片治疗类风湿性关节炎(RA)的作用机制。方法：基于TCMID、TCMSP和DrugBank数据库筛选复方清痹片的活性成分并预测潜在活性成分靶点;基于GeneCard、OMIM等数据库筛选RA疾病靶点;明确复方清痹片活性成分与RA的共同潜在靶标;利用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,并通过DAVID数据库进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,RT-PCR检测复方清痹片对肿瘤坏死因子（TNF-α）诱导的人类风湿性关节炎成纤维样滑膜细胞（HFLS-RA）模型白介素6（IL-6）、TNF-α、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1（AKT1）和血管内皮生长因子A（VEGFA）mRNA表达的影响。结果：筛选出217种潜在活性成分以及158个潜在靶点;IL-6、TNF、AKT1、白蛋白（ALB）、VEGFA等是复方清痹片治疗RA的关键靶点;复方清痹片主要通过炎性因子、趋化因子、免疫调控等信号通路来发挥治疗RA的作用。复方清痹片能够抑制HFLS-RA增殖,下调IL-6、TNF、AKT1和VEGFA mRNA的表达,这与网络药理学预测的结果相一致。结论：本研究揭示了复方清痹片治疗RA“活性成分-靶点-通路”的复杂关系,为后续该药的临床应用提供了研究基础。     

基于网络药理学及分子对接探讨苏子降气汤治疗哮喘的潜在机制

目的：运用网络药理学及分子对接技术预测并验证苏子降气汤治疗哮喘的作用机制。方法：通过TCMSP和UniProt数据库预测苏子降气汤的活性成分及靶点,根据GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET数据库筛选哮喘相关靶点,利用Venny 2.1平台筛选中药和疾病共同基因,利用Cytoscape 3.9.1进行可视化分析;利用 STRING 数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络图,利用Bioconductor 数据库和R版本4.1.3 (64 bit)软件进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,并通过 Autodock 软件对核心成分及靶点进行分子对接。结果：筛选出54种化合物,257个靶点,涉及哮喘的治疗靶点共134个。其中槲皮素、木犀草素、丹参酮ⅡA、黄芩素等为关键活性成分。丝裂原激活蛋白激酶14（MAPK14）、表皮生长因子受体（FGFR）、原癌基因蛋白(MYC)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、缺氧诱导因子1A（HIF1A）、肿瘤蛋白P53(TP53) 为关键基因靶点。GO功能和KEGG通路富集分析得到人巨细胞病毒感染、MAPK信号通路、磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路等多条信号通路。将核心成分与核心靶点进行分子对接验证,大部分结合能＜-5 kal·mol^-1,具有较强的结合能力。结论：苏子降气汤通过抗炎、调节免疫等多靶点、多通路治疗哮喘,为后续分子机制研究提供了理论基础。     

基于网络药理学和分子对接探讨固元健脑方防治HT-CSVD的作用机制

目的：基于网络药理学和分子对接技术探讨固元健脑方防治高血压脑小血管病（HT-CSVD）的作用机制。方法：通过TCMSP及BATMAN-TCM和文献检索预测固元健脑方活性成分及靶点,通过GeneCards和OMIM数据库获取疾病靶点;使用Metascape构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,使用Metascape数据库分析基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路;应用Cytoscape 3.2.1进行可视化分析;采用Autodock Tools 1.5.7及Pymol 2.4.0对核心靶点和化合物进行分子对接。结果：筛选出固元健脑方治疗靶点277个,HT-CSVD靶点5173个,固元健脑方治疗HT-CSVD的靶点230个;其中连环蛋白1（CTNNB1）、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK3）和B细胞淋巴瘤-2基因（Bcl-2）为关键基因靶点,槲皮素、山柰酚、木犀草素和5-羟甲基糠醛为关键活性成分;GO功能富集分析得到激素反应、循环系统进程、细胞对脂质的反应等条目。KEGG通路富集分析得到癌症途径、CAMP、细胞衰老、脂质与动脉粥样硬化、MAPK等信号通路;分子对接结果显示4种主要候选化合物与CTNNB1有较强的结合。结论：固元健脑方可通过多种活性成分、多个靶点、多条通路拮抗HT-CSVD的神经损伤而发挥治疗作用。     

基于网络药理学探讨凉血五花汤加味治疗玫瑰痤疮的作用机制

目的：基于网络药理学探讨凉血五花汤加味治疗玫瑰痤疮的作用机制。方法：通过TCMSP获取凉血五花汤加味的有效活性成分及其对应靶点,从GeneCards、DrugBank、OMIM、TTD数据库检索玫瑰痤疮靶点,运用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-成分-靶点网络图,借用STRING数据库构建药物和疾病交集靶点蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,通过DAVID数据库与微生信在线生物信息学分析可视化云平台对核心靶点基因进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：从凉血五花汤加味中筛选出42个活性成分,关键成分包括槲皮素、山柰酚、木犀草素、β-胡萝卜素、青蒿素等,预测靶点222个,药物疾病共同靶点45个,核心靶点为白细胞介素-6（IL-6）、表皮生长因子受体（EGFR）、肿瘤坏死因子（TNF）、半胱氨酸蛋白酶-3（CASP3）、基质金属蛋白酶-9（MMP9）等;GO功能和KEGG通路富集分析筛选出114条信号通路,主要涉及TNF、白细胞介素-17（IL-17）、高级糖基化终末产物-受体（AGE-RAGE）、NOD样受体（NLR）信号通路等。结论：凉血五花汤加味可能基于多成分、多靶点、多通路的特点,相互协同发挥对玫瑰痤疮的治疗作用。