基于网络药理学和分子对接技术探讨杜仲-续断治疗复发性流产作用机制

目的：采用网络药理学和分子对接技术探讨杜仲-续断治疗复发性流产（RSA）的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库（TCMSP）检索杜仲-续断的活性成分和基因靶点。在GeneCards、OMIM和PharmGkb数据库收集RSA疾病靶点,在Cytoscape 3.7.2软件中构建活性成分-靶点网络,基于STRING数据构建杜仲-续断治疗RSA靶点高置信度互作网络,根据拓扑分析参数筛选杜仲-续断治疗RSA的核心靶点。使用AutoDock Vina软件对关键药物成分与核心靶点进行分子对接。对疾病与药物交集靶点进行GO生物学过程富集分析和KEGG通路注释分析。结果：通过筛选获得杜仲-续断治疗RSA有效活性成分26种,预测靶点119个,涉及11个核心靶点。GO富集分析显示杜仲-续断主要参与对脂多糖反应、细胞氧化应激、R固醇激素调节等生物过程,KEGG富集分析结果显示杜仲-续断药对与磷脂酰肌醇-3-激酶（PI3K）/丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶（Akt/PKB）、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、血管内皮生长因子（VEGF）信号通路等关系密切。结论：杜仲-续断治疗RSA的作用机制涉及多成分、多靶点和多通路,为进一步探究其药理作用及临床治疗提供理论基础。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨石菖蒲治疗缺血性脑卒中的作用机制

目的：借助网络药理学和分子对接技术研究石菖蒲治疗缺血性脑卒中（CIS）的作用机制。方法：以“石菖蒲”为关键词在中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索其活性成分和作用靶点,利用Uniprot数据库对靶点蛋白信息进行标准化,构建中药、成分、靶点网络。利用GeneCards、TTD、OMIM和DRUGBANK 4个数据库检索CIS相关疾病靶点。将疾病和药物靶点导入微生信软件绘制韦恩图得到交集靶点,使用在线软件String 11.0建立蛋白质相互作用（PPI）网络。采用Cytoscape 3.7.2软件对PPI网络进行可视化分析,筛选出核心靶点。在Metascape数据库对核心靶点进行GO富集分析及KEGG通路分析。最后采用分子对接技术确定石菖蒲的有效成分作用于CIS的核心靶点。结果：获得38个潜在作用靶点,PPI网络拓扑分析发现RAC-α丝氨酸/蛋白激酶（AKT1）、肿瘤坏死因子（TNF）可能是石菖蒲治疗CIS的核心基因。GO富集分析结果显示石菖蒲可能是通过对血压的负向调节、调控白细胞迁移等炎症反应、神经递质合成过程、血管生成以及血液循环等生物学过程来发挥作用。KEGG通路富集分析表明,石菖蒲作用于CIS中的通路涉及血流剪切应力与动脉粥样硬化、钙信号通路、cAMP信号通路、VEG通路以及炎症和癌症等通路。分子对接技术验证了石菖蒲有效成分中的山柰酚与潜在靶点AKT1和TNF具有较好的结合活性。结论：石菖蒲的主要活性成分山柰酚可能通过作用于AKT1等多个靶点,调控钙信号通路等多条信号通路,从而发挥血管生成、抗神经细胞凋亡、抗炎、抑制细胞凋亡等作用,来达到预防或治疗CIS的目的。     

基于数据挖掘、网络药理学和分子对接研究中药治疗消化性溃疡的作用机制

目的：研究中药治疗消化性溃疡（PU）的作用机制。方法：检索2020年版《中华人民共和国药典》与药智数据库中中药治疗PU的处方,利用Spss Modeler进行数据挖掘得到核心药物。从TCMSP数据库中获取核心中药的主要活性成分及作用靶点,GeneCards、OMIM、DrugBank、DisGenet数据库中获取疾病靶点,取交集靶点。对交集靶点进行可视化分析,筛选后得到核心靶点与核心成分,并进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析和分子对接。结果：获得甘草、延胡索、白芍、白及、党参5味核心药物,药物聚为 3 类,核心活性成分为槲皮素、山柰酚、木犀草素、柚皮素、柱头甾醇,核心靶点为环加氧酶（PTGS2）、表皮细胞因子（EGF）、表皮生长因子受体（EGFR）、白细胞介素-6（IL-6）、胱天蛋白酶（CASP3）等16个。获得603条GO条目,主要涉及氧化应激反应、蛋白磷酸化、泛素蛋白连接酶等。KEGG富集条目共 118 条通路,核心靶点主要富集在肿瘤坏死因子、白细胞介素-17(IL-17)等信号通路。结论：5味中药治疗PU可能是通过调控PTGS2、EGF等靶点及TNF、IL-17、MAPK、HIF-1等通路的表达来实现。     

基于网络药理学探讨化痰祛瘀汤治疗缺血性中风的潜在作用机制

目的：基于网络药理学研究方法,探讨化痰祛瘀汤治疗缺血性中风的潜在作用机制。方法：运用TCMSP和相关文献记载检索筛选化痰祛瘀汤的主要活性化合物及相关作用靶点,通过Uniprot数据库获取作用靶点的标准名称,通过GeneCards数据库获取疾病的相关靶标,通过STRING数据库和Cytoscape 3.6.1软件构建与本病相关的核心靶点蛋白互作PPI网络。利用R语言软件对核心靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果：根据筛选条件得到化痰祛瘀汤207个有效化合物和176个药物相应靶点,根据平均度值7.43,筛选出核心靶点48个。GO功能富集分析得到条目89条（P＜0.05）,KEGG通路富集分析得到158条通路与本病有关（P＜0.05）。化痰祛瘀汤中的活性化合物可能通过乙肝信号通路、MAPK信号通路、AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路、Th17细胞分化信号通路、C型凝集素受体信号通路、内分泌抵抗信号通路、细胞凋亡信号通路、Toll样受体信号通路等途径作用于JUN、MAPK3、MAPK1、TNF、IL6、AKT1、ESR1等核心靶点发挥其疗效。结论：化痰祛瘀汤与缺血性中风发病过程中的炎症反应、动脉粥样硬化、神经细胞凋亡、免疫反应等生物过程具有潜在的关联性与治疗作用。本研究为本药的临床应用及后续的效应机制研究提供了一定的理论基础。     

基于网络药理学及分子对接探讨牛膝-杜仲-桑寄生治疗膝骨关节炎的作用机制

目的：利用网络药理学平台整合分析牛膝-杜仲-桑寄生治疗膝骨关节炎（KOA）的分子机制,为药组的使用提供理论依据。方法：通过TCMSP平台筛选药组有效成分及靶点,与KOA靶点取交集制作韦恩图,构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络图,筛选关键成分和核心基因,对核心靶点进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：筛选出药组有效成分41种,作用靶点239个;主要有槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、黄芩素、汉黄芩素、β-胡萝卜素等关键成分;磷酸激酶B1（AKT1）、半胱氨酸蛋白酶3（CASP3）、白细胞介素-6（IL-6）、肿瘤坏死因子（TNF）、血管内皮生长因子（VEGF)等核心基因。关键信号通路有晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体（AGE-RAGE）通路、TNF通路、脂肪与动脉粥样硬化通路、磷脂酰肌醇3-激酶/磷酸激酶B（PI3K/Akt）通路等,分子对接结果显示活性成分与核心基因结合能力较强。结论：牛膝-杜仲-桑寄生药组可以通过多靶点、多通路发挥抗炎、抗氧化、调控细胞凋亡及稳定关节内环境的作用,达到治疗膝骨关节炎的目的。     

基于网络药理学探讨参芪复方治疗2型糖尿病的作用机制

目的：运用网络药理学方法探讨参芪复方治疗2型糖尿病（T2DM）的作用靶点及机制。方法：采用TCMSP平台筛选出参芪复方8味中药的活性成分及成分相关靶点,运用GeneCards、OMIM数据库筛选出与T2DM相关的疾病靶点,成分靶点与疾病靶点的交集基因即为参芪复方治疗T2DM的潜在作用靶点。通过STRING数据库和Cytoscape 3.7.2 软件构建可视化网络并寻找核心作用靶点,利用DAVID数据库对核心靶点进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：筛选出参芪复方药物活性成分152种及成分相关靶点218个,T2DM的相关靶点12648个,成分与疾病的交集靶点共210个,其中AKT丝氨酸/苏氨酸激酶1（AKT1）、肿瘤蛋白P53（TP53）、白细胞介素6（IL-6）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、丝裂原活化蛋白激酶1（MAPK1）等可能是参芪复方发挥效应的关键靶点;GO功能分析共涉及255个条目,主要涉及细胞核、RNA转录、DNA等,KEGG通路分析共涉及96条通路,主要包括核因子激活的B细胞的κ-轻链增强（NF-κB）信号通路、环磷酸腺苷（cAMP）信号通路、雷帕霉素靶蛋白（mTOR）信号通路、转化生成因子-β（TGF-β）信号通路等。结论：参芪复方可能通过多种活性成分介导多靶点、多通路发挥治疗T2DM的作用。     

基于网络药理学及分子对接探讨苏子降气汤治疗哮喘的潜在机制

目的：运用网络药理学及分子对接技术预测并验证苏子降气汤治疗哮喘的作用机制。方法：通过TCMSP和UniProt数据库预测苏子降气汤的活性成分及靶点,根据GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET数据库筛选哮喘相关靶点,利用Venny 2.1平台筛选中药和疾病共同基因,利用Cytoscape 3.9.1进行可视化分析;利用 STRING 数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络图,利用Bioconductor 数据库和R版本4.1.3 (64 bit)软件进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,并通过 Autodock 软件对核心成分及靶点进行分子对接。结果：筛选出54种化合物,257个靶点,涉及哮喘的治疗靶点共134个。其中槲皮素、木犀草素、丹参酮ⅡA、黄芩素等为关键活性成分。丝裂原激活蛋白激酶14（MAPK14）、表皮生长因子受体（FGFR）、原癌基因蛋白(MYC)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、缺氧诱导因子1A（HIF1A）、肿瘤蛋白P53(TP53) 为关键基因靶点。GO功能和KEGG通路富集分析得到人巨细胞病毒感染、MAPK信号通路、磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路等多条信号通路。将核心成分与核心靶点进行分子对接验证,大部分结合能＜-5 kal·mol^-1,具有较强的结合能力。结论：苏子降气汤通过抗炎、调节免疫等多靶点、多通路治疗哮喘,为后续分子机制研究提供了理论基础。     

基于数据挖掘和网络药理学探讨功能性消化不良伴抑郁情绪的用药规律和作用机制

目的：基于数据挖掘与网络药理学探究中医药治疗功能性消化不良（FD）伴抑郁情绪的用药规律,预测核心药物的潜在作用机制,以期为临床治疗提供参考。方法：检索中国知网（CNKI）、万方数据（WANFANG DATA）、维普中文科技期刊数据库（VIP）中关于中医药治疗FD伴抑郁情绪的文献,对处方中药物进行使用频次、性味归经、关联规则及聚类分析。利用TCMSP和Uniprot数据库对核心药物成分靶点进行预测和规范,与疾病靶点取交集靶点后构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,基于DAVID数据库进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：共纳入处方74首,中药90味。其中柴胡的使用频次最高;高频药物药味以辛、苦为主,药性以温、平为主,多归脾、肺、胃经;关联规则提示“柴胡-白芍”关联性最强;聚类分析将中药分为3类。网络药理学分析得到治疗FD伴抑郁情绪的核心药对“柴胡-白芍”,核心成分包括槲皮素、β-谷甾醇、异鼠李素、豆甾醇等,核心靶点为蛋白激酶Bα（AKT1）、肿瘤抗原p53（TP53）、丝裂原活化蛋白激酶1（MAPK1）等,信号通路主要涉及糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物及其受体（AGE/RAGE）信号通路、脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B（PI3K/Akt）信号通路等。结论：中医药治疗FD伴抑郁情绪多选用辛温及归脾、胃、肺经之品,核心药对“柴胡-白芍”通过多靶点作用于多通路防治FD伴抑郁情绪,为进一步发掘其潜在作用机制提供方向。     

基于网络药理学与分子对接研究肉豆蔻治疗抑郁症的作用机制

目的：基于网络药理学方法与分子对接技术研究肉豆蔻治疗抑郁症的作用机制。方法：通过中药系统药理学分析平台TCMSP,获得肉豆蔻的活性成分和作用靶点;利用Uniprot数据库构建中药-成分-靶点网络;从GeneCards、OMIM、DrugBank数据库获得抑郁症疾病靶点、肉豆蔻及抑郁症共有靶点;通过Venny 2.1.0平台、String平台进行肉豆蔻与抑郁症共同靶点相互作用分析;利用Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白互作（PPI）网络,采用Metascape平台对核心靶点进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;采用分子对接技术确定肉豆蔻有效成分作用于抑郁症的核心靶点。结果：获得42个潜在作用靶点。乙酰胆碱酯酶（ACHE）、钠依赖性血清素转运体（SLC6A4）、一氧化氮合酶（NOS3）、Alpha-2A肾上腺素能受体（ADRA2A）可能是肉豆蔻治疗抑郁症的核心基因。肉豆蔻作用于抑郁症的通路涉及神经受体相互作用、钙信号通路。分子对接技术验证了肉豆蔻有效成分中的β-谷甾醇与潜在靶点ACHE和NOS3具有较好的结合活性。结论：肉豆蔻的主要活性成分β-谷甾醇可能通过作用于ACHE等多个靶点来调控神经受体相互作用、钙信号通路等多条信号通路,从而发挥抗抑郁作用。     

基于网络药理学探讨泻白散治疗小儿喘息性支气管炎的作用机制

目的：基于网络药理学方法分析中医名方泻白散治疗小儿喘息性支气管炎的作用机制。方法：通过TCMSP数据库获取泻白散的有效成分及其作用蛋白-基因靶点,通过GeneCards、Drug Bank等数据库获取主要疾病靶点。利用STRING数据平台进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析,运用Metascape数据平台进行基因本体（GO）功能与京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。采用Cytoscape 3.8.0软件建立“中药-共同靶点-主要通路”网络。结果：获得泻白散治疗小儿喘息性支气管炎的主要活性成分为山柰酚、槲皮素、甘草查尔酮A、柚皮素、18α-羟基甘草酸等;其核心靶点为丝裂原活化蛋白激酶 1（MAPK1）、丝裂原活化蛋白激酶 3（MAPK3）、核因子κ-B激酶亚基β抑制剂（IKBKB）、白细胞介素-6（IL-6）、肿瘤坏死因子（TNF）、丝裂原活化蛋白激酶8（MAPK8）、半胱天冬酶-3（CASP3）和丝裂原活化蛋白激酶14（MAPK14）等。通过分子对接验证,大部分靶点与化合物都有较好的结合效果。靶点富集通路包括白细胞介素-17信号通路（IL-17 signaling pathway）、肿瘤坏死因子信号通路（TNF signaling pathway）和缺氧诱导因子-1信号通路（HIF-1 signaling pathway）等诸多炎症通路。结论：泻白散可通过多靶点、多通路的互相作用,降低喘息性支气管炎的炎症风暴,并缓解气道痉挛。本研究结果为泻白散治疗小儿喘息性支气管炎提供了理论基础。     

基于网络药理学探讨赤芍抗血吸虫病及肝纤维化的作用机制

目的：通过网络药理学方法探讨赤芍有效成分治疗血吸虫病及肝纤维化的潜在作用机制。方法：通过TCMSP数据库检索并收集赤芍有效成分及其对应的作用靶点,借助UniProt数据库将靶点蛋白的genename转换为genesymbol;通过GeneCards、OMIM、TTD疾病数据库搜集血吸虫病及肝纤维化相关靶点;将赤芍成分靶点和疾病靶点取交集,获得赤芍治疗血吸虫病及肝纤维化的潜在靶点,利用Cytoscape 3.8.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”和“成分-靶点-通路”网络;通过STRING数据库对交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析,采用Cytoscape 3.8.2软件进行分析和可视化呈现;通过Metascape数据库进行基因本体（GO）功能、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：筛选得到赤芍活性成分29种,成分靶点与血吸虫病及肝纤维化疾病的交集靶点19个,其中肿瘤抑制蛋白（TP53）、前列腺素内过氧化物合酶（PTGS2）、肿瘤坏死因子（TNF）、基质金属蛋白酶9（MMP9）、白细胞介素-6（IL-6）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、白细胞介素8（IL-8）、缺氧诱导因子1A（HIF1A）、转化生长因子B1（TGFB1）、基质金属蛋白酶2（MMP2）为核心靶点,涉及的主要信号通路为癌症信号通路、乙型肝炎、糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物及其受体（AGE-RAGE）信号通路、动脉粥样硬化。结论：本研究初步预测了赤芍抗血吸虫病及肝纤维化的作用机制,可为今后药效物质基础研究提供参考。     

基于数据挖掘和网络药理学探讨中医药防治冠心病室性早搏的用药规律

目的：基于数据挖掘筛选中医药防治冠心病室性早搏的核心药物,利用网络药理学探讨其作用机制。方法：检索中国知网（CNKI）、万方数据（WANFANG DATA）、维普中文科技期刊数据库（VIP）中有关中医药防治冠心病室性早搏的文献,使用Excel表格和古今医案云平台V2.3.5进行频次统计、关联、聚类和网络分析。利用TCMSP数据库获取核心药物主要化学成分,结合Swiss Target Prediction数据库预测活性成分作用靶点;运用OMIM、GeneCards、DrugBank等数据库获取冠心病室性早搏相关靶点;采用UniProt数据库匹配相关靶点基因;运用Cytoscape 3.9.1软件构建蛋白质-蛋白质相互作用网络图;采用Metascape平台进行基因本体（GO）功能、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：共筛选出124篇文献,包含124首方,涉及160味中药。高频药物排前6位的依次为甘草、丹参、酸枣仁、当归、黄芪、党参。药味以甘、苦、辛为主;药性以温、平、微寒、寒为主;归经以心、肝、脾、肺为主。获得18组关联药物、4首聚类处方。获得核心药物有效成分78种、药物靶点326个、疾病靶点1609个、疾病-药物交集靶点141个。GO功能富集分析获得生物过程5526个、细胞组分474个、分子功能787个,KEGG通路富集分析获得253条信号通路。结论：防治冠心病室性早搏的中药主要通过调控白细胞介素-6、肿瘤坏死因子、蛋白激酶Bα等核心关键靶点,糖尿病并发病中晚期糖基化产物-晚期糖基化终末产物受体信号通路、松弛素信号通路及钙信号通路等来发挥治疗冠心病室性早搏的作用。     

基于网络药理学探讨当归芍药散治疗复发性流产的作用机制

目的：利用网络药理学技术研究当归芍药散治疗复发性流产（RSA）的潜在作用机制。方法：通过TCMSP数据库寻找、筛选、预测当归芍药散中5味中药的化学活性成分和对应靶点,通过OMIM数据库、GeneCards 数据库获取与RSA相关的疾病靶点;利用Venny对当归芍药散药物靶点、RSA疾病靶点取交集、绘制韦恩图,从而预测当归芍药散-RSA潜在作用靶点;利用Cytoscape软件构建“当归芍药散—成分—RSA—靶点”网络;分别借助String平台、R软件对RSA药物-疾病潜在作用靶点构建蛋白相互作用网络、分析GO 生物过程、分析KEGG 通路。结果：当归芍药散主要通过芍药苷、芍药内酯苷、泽泻醇、儿茶素、川芎内酯A等30个活性成分作用于IL6、AKT1、JUN、TNF、PTGS2等84个与疾病相关的靶点。通过AGE-RAGE信号通路、肿瘤坏死因子信号通路（TNF）、白细胞介素（IL）-17信号通路、TOLL样受体信号通路、脂多糖反应等生物过程和代谢通路,调节MAPK信号通路和NF-κB信号通路,以达到平衡机体TNF、IL等炎性因子含量,避免了过度自身免疫的发生,从而改善妊娠结局。结论：本研究反应了当归芍药散具有多成分、多靶点、多通路的特点,为当归芍药散治疗复发性流产提供新思路和理论依据。     

基于生物信息学探讨骨质疏松症与2型糖尿病的关系

目的：基于生物信息学探讨骨质疏松症与 2 型糖尿病的关系。方法：通过基因表达汇编（GEO）数据库检索骨质疏松症和2型糖尿病的相关数据集,并筛选骨质疏松症-2型糖尿病共同差异表达基因,将数据导入STRING数据库找寻关键基因,以一个单细胞测序数据集作为检验集验证关键基因细胞层面的表达水平,对筛选结果进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,并对关键靶点、相关中药进行频数统计及功效分类。结果：骨质疏松症与 2 型糖尿病相关通路集中在 ErbB信号通路、丝活化蛋白激酶（MAPK）信号通路、神经营养素信号通路、NOD样受体信号通路。频数统计结果显示,与骨质疏松症-2型糖尿病关键基因相关的中药有51味,以功效分类,可分为清热解毒药、止痛药、祛风药、补虚药、止呕药。结论：骨质疏松症和2型糖尿病都是复杂的代谢性疾病,涉及众多基因表达网络和信号通路。尽管两种疾病存在复杂的基因网络背景,但是分析结果表明两种疾病之间仍存在高度重合的差异基因表达和信号通路。这表明两种疾病的分子机制密切相关,可能存在共同调控的靶点,因此这些靶点可能成为药物同时干预两种疾病的治疗靶点。     

基于网络药理学及分子对接研究桃仁-红花治疗膝骨关节炎的作用机制

目的：基于网络药理学及分子对接技术研究桃仁-红花治疗膝骨关节炎（KOA）的作用机制。方法：采用TCMSP及Uniprot数据库收集整合桃仁、红花的活性成分及其药理作用靶点,在GeneCards数据库检索KOA的靶点基因,通过Venny获取疾病-药物交互靶点,借助STRING 数据库及Cytoscape软件构建蛋白互作网络图并上传Metascape数据库进行GO功能和 KEGG通路富集分析,最后运用 AutoDock和Pymol将核心有效成分与相应的关键靶点进行分子对接预测。结果：1）桃仁-红花有效活性成分45个,主要成分为槲皮素、山柰酚、木犀草素等;2）KOA与药物的共同靶点120个,丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1（AKT1）、转录因子AP-1（JUN）、肿瘤坏死因子（TNF）、细胞肿瘤抗p53（TP53）、转录因子p65（RELA）、丝裂原激活的蛋白激酶1（MAPK1）、白细胞介素6（IL-6）、热休克蛋白（HSP90AA1）、血管内皮生长因子A （VEGFA）、丝裂原激活的蛋白激酶8（MAPK8）等为关键靶点;3）分子对接结果显示山柰酚可靶向结合AKT1、TNF;4）GO功能富集分析得出桃仁-红花治疗KOA主要涉及细胞增殖、生长因子的反应、细胞应激反应的调节、细胞死亡的正调控等生物合成过程;5）KEGG通路富集分析显示白细胞介素17（IL-17）、雌激素信号通路为桃仁-红花干预KOA的主要信号通路。结论：桃仁-红花中的槲皮素、山柰酚、木犀草素等有效成分通过AKT1、JUN、TNF、TP53、RELA、MAPK1、IL-6、HSP90AA1、VEGFA、MAPK8等关键靶点与IL-17和雌激素信号通路等主要通路发挥抗炎、调控细胞增殖、凋亡及应激反应的方式治疗KOA。     

基于网络药理学探讨补肺强体方治疗小儿反复呼吸道感染的作用机制

目的：基于网络药理学方法分析补肺强体方治疗小儿反复呼吸道感染（RRTI）的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获取补肺强体方有效成分及其蛋白靶点，根据 ADME 筛选中药活性主体，通过Gene Cards、OMIM、TTD等平台获取主要疾病靶点，利用String数据平台进行蛋白质互作网络分析，运用Metascape数据平台进行GO功能与KEGG通路富集分析，采用Cytoscape 3.7.2软件建立“中药-共同靶点-主要通路”网络。结果：最终获得补肺强体方治疗小儿RRTI的核心成分为甘草查尔酮A、β-谷甾醇、木犀草素、芒柄花黄素等；其核心靶点为STAT3、JUN、TNF、MAPK1等蛋白成分。通过分子对接验证，大部分靶点与化合物都有较好的结合效果。富集分析结果显示，补肺强体方可能通过乙型肝炎通路、卡波西氏肉瘤相关疱疹病毒感染通路、人T细胞白血病病毒1感染通路、TNF信号通路、Toll样受体信号通路等多个途径干预小儿RRTI。结论：本研究初步揭示了补肺强体方治疗小儿RRTI的共有成分、多个靶点、具体通路的相互作用机制，为该方的临床应用提供了理论依据及分子生物学基础。     

基于网络药理学和分子对接研究半夏泻心汤治疗反流性食管炎的潜在分子机制

目的：通过网络药理学方法结合分子对接技术研究半夏泻心汤治疗反流性食管炎（RE）的潜在有效成分及分子作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）查找半夏泻心汤活性成分和药物潜在靶点。基于GeneCards、OMIM、DrugBank和TTD数据库获取RE疾病靶点,使用R语言4.0.4得到药物和疾病的交集靶点。采用Cytoscape 3.8.0分析软件筛选并构建“中药-活性成分-靶点”网络,结合STRING数据库对交集靶点进行蛋白互作网络分析,使用R软件进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。利用AutoDock Vina 1.1.2对关键活性成分与作用靶点进行分子对接验证。结果：半夏泻心汤治疗RE共收集到162个活性化学成分和151个靶点,Cytoscape 3.8.0软件筛选出Jun激酶（JUN）、信号传导与转录激活因子3（STAT3）、MYC基因（MYC）、丝裂原活化蛋白激酶3（MAPK3）、肿瘤蛋白p53（TP53）、丝裂原活化蛋白激酶14（MAPK14）、蛋白激酶（AKT1）、丝裂原活化蛋白激酶8（MAPK8）、核转录因子-κB/p65（RELA）、丝裂原活化蛋白激酶1（MAPK1）、肿瘤坏死因子（TNF）、细胞周期蛋白D1（CCND1）等核心靶点和槲皮素、山柰酚、汉黄芩素、柚皮素、黄芩素等关键活性成分。GO富集条目2740个,包括2470个生物过程、84个细胞组成和186个分子功能;KEGG通路富集得到糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物-晚期糖基化终产物受体、白细胞介素17、TNF、p53和缺氧诱导因子-1等信号通路。分子对接结果显示半夏泻心汤的关键活性成分可以对JUN、STAT3、MYC、MAPK3、TP53、MAPK14、AKT1、MAPK8等核心靶点产生调控作用。结论：半夏泻心汤可以通过多成分、多靶点、多通路治疗RE,为半夏泻心汤治疗RE作用机制的进一步阐明提供了指引。     

基于数据挖掘和网络药理学探讨中药治疗化疗相关性恶心呕吐的用药规律和机制

目的：分析和挖掘中医药治疗化疗相关性恶心呕吐（CINV）的用药特点、潜在关联规则及配伍规律,并借助网络药理学和分子对接技术探讨高频药物干预CINV的作用机制。方法：收集中国知网（CNKI）、万方数据（WANFANG DATA）、维普中文科技期刊数据库（VIP）中2000年1月1日至2020年12月31日发表的中医药治疗CINV的随机对照文献,采用统计描述、关联规则、聚类分析等方法探讨中药治疗CINV的用药规律。利用 TCMSP数据库收集相关活性成分,进行靶点预测,利用DAVID数据库进行京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,使用分子对接技术对核心化学成分与关键靶点进行分子对接验证。结果：共纳入符合要求的文献101篇,涉及中药141味;高频核心药物主要有甘草、半夏、茯苓、白术和陈皮,中药功效以补虚和化痰为主;关联组合提升度较高者为“半夏-大枣-甘草→生姜”等;共筛选得到核心药物活性成分131个,作用靶点151个,认为高频核心药物可能通过神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路和5-羟色胺能突触等作用机制对CINV发挥作用。结论：中医药治疗CINV以健脾化痰止呕为法,多采用补虚药、化痰药、理气药,其中甘草、半夏、茯苓、白术、陈皮为高频核心药物,网络药理学和分子对接结果进一步验证了高频核心药物治疗CINV的微观作用机制。     

基于网络药理学和分子对接探讨石韦大枣汤干预白细胞减少症的作用机制

目的：基于网络药理学和分子对接技术探究石韦大枣汤治疗白细胞减少症的作用机制。方法：通过TCMSP数据库筛选石韦大枣汤治疗白细胞减少症的活性成分和潜在靶点,构建石韦大枣汤与白细胞减少症蛋白质-蛋白质相互作用网络（PPI）,分析基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路,采用分子对接技术对主要活性成分与核心靶点进行分子对接。结果：石韦大枣汤中有效成分28种,93个靶点作用于白细胞减少症,关键靶点有靶向细胞周期蛋白D1（CCND1）、可调控信号传导和转录激活子3（STAT3）、半胱氨酸天冬氨酸特异性蛋白酶3（CASP3）、缺氧诱导因子1A（HIF1A）等,涉及KEGG富集分析确定信号通路包括脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B（PI3K Akt）信号通路、晚期搪基化终产物及其受体（AGE RAGE）信号通路、Janus激酶-信号转导与转录激活因子（JAK STAT） 信号通路等多条通路。分子对接结果显示,槲皮素与血管内皮生长因子A（VEGFA）大分子蛋白,β-谷甾醇与CASP3有良好的结合性。结论：石韦大枣汤治疗白细胞减少症具有多靶点、多通路的特点,为深入研究其作用机制提供了新依据。     

基于网络药理学和分子对接探析养心活血通脉汤治疗稳定性冠心病的作用机制

目的：运用网络药理学和分子对接技术探析养心活血通脉汤治疗稳定性冠心病的作用机制。方法：应用TCMSP、Herb、TCMID平台检索养心活血通脉汤成分及作用靶点;经GeneCards、OMIM、DisGeNET平台获取稳定性冠心病靶点;运用Cytoscape 3.9.1建立“药物-活性成分-靶点”网络及蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,筛选核心靶点。由Metascape平台进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。利用Auto Dock Tools软件进行有效成分与和核心靶点分子对接。结果：养心活血通脉汤治疗稳定性冠心病主要成分为槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、芒柄花黄素、黄芩素、丹参酮ⅡA,关键靶点为肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素-6（IL-6）、丝氨酸/苏氨酸激酶1（AKT1）、白细胞介素-1β（IL-1β）、血管内皮生长因子（VEGFA）,关键通路为脂质和动脉粥样硬化（Lipid and atherosclerosis）、磷脂酰肌醇3激酶-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1信号通路（PI3K-Akt信号通路）、肿瘤坏死因子信号通路（TNF信号通路）、丝裂原活化蛋白激酶信号通路（MAPK信号通路）、糖基化终产物/受体信号通路（AGE-RAGE信号通路）等。分子对接结果显示各有效成分与各核心靶点结合活性较好。结论：养心活血通脉汤治疗稳定性冠心病作用机制主要为降脂、抗动脉粥样硬化、抗炎、抗心肌损伤。