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1.
目的:运用网络药理学与分子对接技术探究六味地黄丸治疗肾阴亏虚型老年性便秘的作用机制。方法:通过TCMSP、TCMID、SwissTargetPrediction获取药物的活性成分并筛选,在Genecards、OMIM、TTD、DisGeNET数据库检索与该疾病相关的主要靶点;运用韦恩图获取六味地黄丸与老年性便秘的交集靶点。将以上数据通过STRING获得交集靶点的蛋白网络,构建药物-活性成分-靶点及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并对药物有效成分和核心靶点进行分子对接验证。结果:共获得58个有效活性成分和675个对应靶点,主要有效成分有槲皮素、羟基芫花素、泽泻醇B等;药物-疾病交集靶点296个,包括丝氨酸/ 苏氨酸蛋白激酶 1 (AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)等。GO功能富集共有3175个条目,KEGG通路富集得到215条通路,主要有癌症通路、磷脂酰肌醇3-激酶/苏氨酸蛋白激酶信号通路、癌症中的蛋白聚糖、丝裂原活化蛋白激酶信号通路等。分子对接显示该药物主要有效成分和核心靶点蛋白有较好的结合力。结论:该研究在总体上预测了六味地黄丸治疗肾阴亏虚型老年性便秘的活性成分、靶点和信号通路,表明了其多成分-多靶点-多途径的治疗特点。  相似文献   

2.
目的:基于网络药理学方法探讨玉屏风散治疗过敏性紫癜(HSP)的作用机制。方法:利用TCMSP、Pubchem、Swiss target prediction等数据库平台,对玉屏风散的有效活性成分和有效靶点基因进行检索、收集和筛选。通过Genecards、Disgenet、OMIM数据库查询和挖掘HSP的相关基因和玉屏风散治疗HSP的交集靶点,STRING数据库和Cytoscape 3.9.1 软件构建活性-成分-靶点可视化网络和可视化分析。运用DAVID数据库进行基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:筛选出45个玉屏风散活性成分,212个药物靶点,294个疾病靶点和35个交集靶点,对关键靶点进行蛋白质-蛋白质互作(PPI)网络构建,涉及的主要基因有肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6、血管内皮生长因子A、白细胞介素-1β、肿瘤蛋白p53、基质金属蛋白酶-9、趋化因子c-c配体2、白细胞介素-10、丝氨酸蛋白酶抑制因子肽酶抑制因子、CXC趋化因子配体8等。GO功能富集分析得到条目数337个,其中生物过程条目284个,分子功能条目35个,细胞组成条目22个。KEGG通路富集分析得到信号通路101条,主要涉及高级糖基化终末产物-受体信号通路、流体剪切应力和动脉粥样硬化信号通路、脂质和动脉硬化信号通路、疟疾信号通路、白细胞介素-17信号传导通路、TNF信号通路、核因子-κB信号通路等。结论:玉屏风散可能通过多成分、多靶点、多通路治疗HSP。  相似文献   

3.
目的:基于网络药理学探讨固表防感汤发挥免疫调节的作用机制。方法:在TCMSP平台中检索黄芪、大枣的活性成分及其可能的作用靶点,在OMIM及GeneCards中设置关键词检索免疫调节的关键靶点,将两者检索所得靶点取交集得到固表防感汤的免疫调节靶点,将交集靶点导入STRING数据库中进行蛋白质-蛋白质相互作用网络分析,使用 Metascape数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,通过Cytoscape3.9软件分析得到药物成分-疾病靶点-通路网络图。结果:固表防感汤中进行免疫调节的主要关键活性成分为槲皮素、β-胡萝卜素、β-谷甾醇、山柰酚等,其作用于人类V-Rel网状内皮增生病毒癌基因同源物A、肿瘤坏死因子、白细胞介素-6、白细胞介素-10等相关靶点。GO功能富集分析结果显示,固表防感汤在生物过程上通过脂多糖类合成反应、细胞迁移正向调控、造血相关及细胞凋亡等通路来发挥免疫调节作用;分子功能则体现在细胞因子受体结合、激酶结合及活性调节、血红素结合、蛋白域结合等方面。细胞组分主要分布在脂筏、囊泡腔、转录调节复合物、细胞质膜外侧、线粒体外膜等。KEGG通路富集分析结果显示,其通过代谢相关、免疫细胞、细胞因子、肿瘤相关方面的信号通路等多条信号通路发挥免疫调节作用。结论:固表防感汤中多种活性成分通过代谢相关、免疫细胞、细胞因子、肿瘤相关方面的多条信号通路发挥免疫调节作用,为该方在临床上的进一步使用提供了理论基础。  相似文献   

4.
目的:通过网络药理学和免疫浸润探讨中药荜茇抗血吸虫病相关肝细胞癌的作用机制。方法:通过TCMSP、TCMIP数据库查找荜茇主要化学成分及其作用靶点;通过GeneCards、OMIM、TTD数据库收集血吸虫病及肝细胞癌相关靶点,构建“药物-成分-靶点”和“成分-靶点-通路”网络图,对药物和疾病的交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析;通过R语言对交集靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过GEPIA和UALCAN数据库对潜在靶点进行表达差异及生存预后分析;通过TIMER数据库对核心靶点进行免疫浸润分析。结果:获得荜茇抗血吸虫病及肝细胞癌潜在靶点11个,其中肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-1β(IL-1β)、白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-10(IL-10)、环加氧酶2(PTGS2)等可能是荜茇发挥作用的潜在靶点;KEGG通路富集主要涉及肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、C型凝集素受体信号通路等,生物信息学结果表明葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)可能在荜茇治疗血吸虫病相关肝细胞癌过程中发挥重要作用。结论:本研究初步预测了荜茇抗血吸虫病相关肝细胞癌的分子机制,为进一步深入研究及临床应用提供了理论依据。  相似文献   

5.
目的:运用网络药理学方法探讨参芪复方治疗2型糖尿病(T2DM)的作用靶点及机制。方法:采用TCMSP平台筛选出参芪复方8味中药的活性成分及成分相关靶点,运用GeneCards、OMIM数据库筛选出与T2DM相关的疾病靶点,成分靶点与疾病靶点的交集基因即为参芪复方治疗T2DM的潜在作用靶点。通过STRING数据库和Cytoscape 3.7.2 软件构建可视化网络并寻找核心作用靶点,利用DAVID数据库对核心靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:筛选出参芪复方药物活性成分152种及成分相关靶点218个,T2DM的相关靶点12648个,成分与疾病的交集靶点共210个,其中AKT丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、肿瘤蛋白P53(TP53)、白细胞介素6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)等可能是参芪复方发挥效应的关键靶点;GO功能分析共涉及255个条目,主要涉及细胞核、RNA转录、DNA等,KEGG通路分析共涉及96条通路,主要包括核因子激活的B细胞的κ-轻链增强(NF-κB)信号通路、环磷酸腺苷(cAMP)信号通路、雷帕霉素靶蛋白(mTOR)信号通路、转化生成因子-β(TGF-β)信号通路等。结论:参芪复方可能通过多种活性成分介导多靶点、多通路发挥治疗T2DM的作用。  相似文献   

6.
目的:基于网络药理学探讨凉血五花汤加味治疗玫瑰痤疮的作用机制。方法:通过TCMSP获取凉血五花汤加味的有效活性成分及其对应靶点,从GeneCards、DrugBank、OMIM、TTD数据库检索玫瑰痤疮靶点,运用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-成分-靶点网络图,借用STRING数据库构建药物和疾病交集靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,通过DAVID数据库与微生信在线生物信息学分析可视化云平台对核心靶点基因进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:从凉血五花汤加味中筛选出42个活性成分,关键成分包括槲皮素、山柰酚、木犀草素、β-胡萝卜素、青蒿素等,预测靶点222个,药物疾病共同靶点45个,核心靶点为白细胞介素-6(IL-6)、表皮生长因子受体(EGFR)、肿瘤坏死因子(TNF)、半胱氨酸蛋白酶-3(CASP3)、基质金属蛋白酶-9(MMP9)等;GO功能和KEGG通路富集分析筛选出114条信号通路,主要涉及TNF、白细胞介素-17(IL-17)、高级糖基化终末产物-受体(AGE-RAGE)、NOD样受体(NLR)信号通路等。结论:凉血五花汤加味可能基于多成分、多靶点、多通路的特点,相互协同发挥对玫瑰痤疮的治疗作用。  相似文献   

7.
目的:基于网络药理学探讨六味地黄丸合缩泉丸治疗尿崩症(DI)的作用机制。方法:利用TCMSP和 UniProt 数据库获取六味地黄丸合缩泉丸的有效成分和作用靶点,通过GeneCards、OMIM、DrugBank数据库预测疾病靶点,将有效成分靶点与疾病靶点取交集,构建韦恩图获取共同靶点,运用STRING数据库和Cytoscape 3.8.2软件绘制交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,经拓扑分析得到关键靶点,并进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:共获得六味地黄丸合缩泉丸有效成分 31 个,作用于 185 个靶点,DI靶点共 897 个,六味地黄丸合缩泉丸与DI交集靶点 39 个,主要有效成分有槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、薯蓣皂苷元等,关键靶点包括丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、白细胞介素-1β(IL-1β)、基质金属蛋白酶(MMP9)、过氧化物酶体增生激活受体(PPARG)、趋化因子(CCL2)、肿瘤蛋白TP53(p53)等。GO功能富集得到1667个条目,包括生物过程1582个、分子功能78个、细胞组分7个;KEGG通路富集得到110条通路,主要涉及动脉粥样硬化信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、疟疾、肿瘤坏死因子信号通路等。结论:本研究初步揭示了六味地黄丸合缩泉丸治疗DI的作用机制,并通过数据分析侧面印证了中医辨证论治理论体系的正确性,可为进一步研究提供借鉴。  相似文献   

8.
目的:基于网络药理学方法研究仙鹤草-鸡血藤治疗原发免疫性血小板减少症(ITP)的作用机制。方法:通过TCMSP平台筛选仙鹤草-鸡血藤的活性成分及其对应的靶基因,搜索疾病靶点、仙鹤草-鸡血藤治疗ITP的共同靶标基因,构建仙鹤草-鸡血藤活性成分-ITP靶标基因关系网络图、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:获得仙鹤草-鸡血藤活性成分29种,作用靶点663个,疾病相关靶点1001个,成分-疾病-靶点47个。PPI网络显示,肿瘤坏死因子、白介素-6、白介素-1β、信号转导及转录激活蛋白3等靶点与仙鹤草-鸡血藤治疗ITP的关系最为密切。GO功能富集分析中,生物过程主要集中在对炎症反应、细胞对有机化合物的反应、对脂多糖的反应等;分子功能主要集中在蛋白结合、细胞因子活性、相同的蛋白质结合等;细胞组分主要集中在细胞外间隙、等离子膜外侧、细胞外区域等。KEGG 通路富集分析主要包括肿瘤坏死因子信号通路、趋化因子信号通路、Toll样受体信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶-丝氨酸-苏氨酸激酶信号通路等。结论:仙鹤草-鸡血藤可通过多靶标、多途径发挥治疗ITP的作用。  相似文献   

9.
目的:运用网络药理学方法探讨浙贝母治疗小儿腺样体肥大的作用机制。方法:应用 TCMSP平台及UniPort数据库检索并筛选浙贝母的活性成分及其对应的靶基因,通过GeneCards数据库获取腺样体肥大的靶点基因,并筛选浙贝母有效活性成分与腺样体肥大的交集靶点,使用Cytoscape 3.9.0软件绘制蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,预测其关键靶点;对交集靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:浙贝母治疗腺样体肥大的有效化合物包含天竺葵素、β-谷甾醇、贝母辛碱、浙贝树脂醇、6-甲氧基-2-乙酰基-3-甲基-1,4-萘醌-8-O-β-D-吡喃葡萄糖苷,相关潜在靶点涉及腺苷受体(AR)、过氧化物酶体增生激活受体γ(PPARG)、糖皮质激素受体(NR3C1)等。GO功能富集分析显示预测靶点主要与雌二醇的反应、药物反应、对脂多糖的反应、相同蛋白结合、凋亡过程的正调控等分子功能相关。KEGG通路富集分析显示潜在基因主要集中在凋亡-多物种、肿瘤蛋白p53、白细胞介素-17、肿瘤坏死因子(TNF)、血管内皮生长因子等信号通路。结论:浙贝母可能通过诱导凋亡、减轻炎症反应、调节免疫系统等多靶点、多通路发挥治疗腺样体肥大的作用。  相似文献   

10.
目的:通过网络药理学及分子对接技术探讨全真一气汤治疗慢性阻塞性肺疾病(COPD)的作用机制。方法:通过TCMSP、ETCM筛选全真一气汤活性成分,利用TCMSP和Swiss Target Prediction数据库预测潜在靶点,通过GeneCards、DisGeNET、DrugBank数据库收集COPD靶点,并取疾病及药物靶点交集。利用Cytoscape 3.9.1软件构建药物-成分-靶点可视化网络,利用STRING平台构建交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图并筛选核心靶点,利用Metascape平台对交集靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。关键成分和核心靶点蛋白采用Auto Dock Vina进行分子对接。结果:筛选得到全真一气汤有效成分44种,作用靶点295个,疾病靶点1865个,核心靶点为转录激活因子3(STAT3)、肉瘤基因(SRC)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、肿瘤蛋白p53(TP53)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、染色体基因(JUN)、人雌激素受体α(ESR1);GO功能主要涉及对无机物的反应、蛋白激酶活性、膜筏等,KEGG信号通路主要涉及磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、肿瘤坏死因子(TNF)等;分子对接结果显示关键成分与核心靶点结合较好。结论:全真一气汤可通过多成分、多靶点、多途径治疗COPD,本研究结果为中医药治疗COPD的实验研究提供了参考。  相似文献   

11.
目的:基于网络药理学研究香附治疗女性青春期后痤疮的作用机制。方法:通过TCMSP数据库获取香附的活性成分与相应靶点,采用GeneCard数据库获得与痤疮相关的疾病靶点,使用STRING数据库和Cytoscape 3.7.1软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,应用Bioconductor数据库进行基因本体(GO)功能、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:香附的有效活性成分共18种,痤疮相关靶点570个,潜在靶点21个,药物-疾病靶点21个。PPI 网络显示,白细胞介素-6、血管内皮生长因子A、白三醇过氧化物酶体增殖物激活受体γ、表皮生长因子受体、白三烯醇雌激素受体的连接程度最高。GO功能富集分析结果显示,交集基因主要参与了整合素结合、核受体活性、配体激活转录因子活性、ATP酶结合等。KEGG通路主要涉及脂质与动脉粥样硬化、流体剪切应力与动脉粥样硬化、肿瘤坏死因子信号通路、磷脂酰肌醇-3激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路等。结论:香附可通过调节多种生物学功能和各项通路治疗女性青春期后痤疮,为临床运用香附治疗女性青春期后痤疮提供了理论支持。  相似文献   

12.
目的:利用网络药理学平台整合分析牛膝-杜仲-桑寄生治疗膝骨关节炎(KOA)的分子机制,为药组的使用提供理论依据。方法:通过TCMSP平台筛选药组有效成分及靶点,与KOA靶点取交集制作韦恩图,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,筛选关键成分和核心基因,对核心靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:筛选出药组有效成分41种,作用靶点239个;主要有槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、黄芩素、汉黄芩素、β-胡萝卜素等关键成分;磷酸激酶B1(AKT1)、半胱氨酸蛋白酶3(CASP3)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、血管内皮生长因子(VEGF)等核心基因。关键信号通路有晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)通路、TNF通路、脂肪与动脉粥样硬化通路、磷脂酰肌醇3-激酶/磷酸激酶B(PI3K/Akt)通路等,分子对接结果显示活性成分与核心基因结合能力较强。结论:牛膝-杜仲-桑寄生药组可以通过多靶点、多通路发挥抗炎、抗氧化、调控细胞凋亡及稳定关节内环境的作用,达到治疗膝骨关节炎的目的。  相似文献   

13.
目的:基于网络药理学研究附子-细辛对高血压病的作用机制。方法:运用TCMSP数据库挖掘出附子-细辛的有效成分及药物预测靶点,采用5个生物信息数据库检索出高血压病的疾病预测靶标,构建药物靶点-疾病靶标交集,使用Cytoscape生物信息分析软件绘制“成分-靶点-疾病”中药调控网络,基于STRING数据库构建“药物-疾病”相关靶点的蛋白互作网络(PPI),并对其进行GO和KEGG的生物信息学分析。结果:通过生物利用度和类药性筛选得到附子-细辛的有效成分29个,对应药物靶点1807个,高血压病的疾病靶标8505个,构建的药物靶点-疾病靶标交集80个。与高血压病密切相关的GO富集条目91个,KEGG信号通路123条,主要涉及流体剪切应力与动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、白细胞介素(IL)-17信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、PI3K-Akt信号通路等。结论:附子-细辛药对与高血压病密切相关,能够通过一条或多条通路协同发挥药效作用,考虑其可能是通过干预血液的流体剪切应力影响动脉粥样硬化与心血管重塑再生而实现的。  相似文献   

14.
目的:运用网络药理学及分子对接技术预测并验证苏子降气汤治疗哮喘的作用机制。方法:通过TCMSP和UniProt数据库预测苏子降气汤的活性成分及靶点,根据GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET数据库筛选哮喘相关靶点,利用Venny 2.1平台筛选中药和疾病共同基因,利用Cytoscape 3.9.1进行可视化分析;利用 STRING 数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,利用Bioconductor 数据库和R版本4.1.3 (64 bit)软件进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并通过 Autodock 软件对核心成分及靶点进行分子对接。结果:筛选出54种化合物,257个靶点,涉及哮喘的治疗靶点共134个。其中槲皮素、木犀草素、丹参酮ⅡA、黄芩素等为关键活性成分。丝裂原激活蛋白激酶14(MAPK14)、表皮生长因子受体(FGFR)、原癌基因蛋白(MYC)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、缺氧诱导因子1A(HIF1A)、肿瘤蛋白P53(TP53) 为关键基因靶点。GO功能和KEGG通路富集分析得到人巨细胞病毒感染、MAPK信号通路、磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路等多条信号通路。将核心成分与核心靶点进行分子对接验证,大部分结合能<-5 kal·mol-1,具有较强的结合能力。结论:苏子降气汤通过抗炎、调节免疫等多靶点、多通路治疗哮喘,为后续分子机制研究提供了理论基础。  相似文献   

15.
目的:运用网络药理学方法探讨阳和汤治疗三阴性乳腺癌的潜在作用机制。方法:通过TCMSP数据库和HERB数据库筛选得到阳和汤的有效成分并预测其相关作用靶点,构建有效成分-靶点相互作用网络图,通过DisGeNET和GeneCards数据库获取三阴性乳腺癌的相关靶点,运用仙桃学术工具在线venny分析获取阳和汤与三阴性乳腺癌的交集靶点,STRING数据库及Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,并进行基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。进一步通过FerrDb数据库获取铁死亡相关靶点,并与阳和汤、三阴性乳腺癌靶点取交集,进行PPI网络图构建及GO功能、KEGG通路富集分析。结果:筛选得到阳和汤的有效成分86个,其中核心成分为槲皮素、山柰酚等,对应作用靶点207个,三阴性乳腺癌的相关靶点1748个,两者共同靶点89个,其中核心靶点为蛋白激酶B(Akt1)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、磷脂酰肌醇-3激酶调节亚基1(PIK3R1)等,通过KEGG分析发现,阳和汤治疗三阴性乳腺癌涉及PI3K-Akt信号通路、黏附连接等主要信号通路。进一步获取铁死亡的调控靶点487个,其中MAPK1、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)为铁死亡参与阳和汤治疗三阴性乳腺癌的核心靶点。结论:阳和汤治疗三阴性乳腺癌主要涉及多个关键靶点和信号通路,推测铁死亡通路可能是其重要的作用机制。  相似文献   

16.
目的:基于网络药理学方法分析中医名方泻白散治疗小儿喘息性支气管炎的作用机制。方法:通过TCMSP数据库获取泻白散的有效成分及其作用蛋白-基因靶点,通过GeneCards、Drug Bank等数据库获取主要疾病靶点。利用STRING数据平台进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析,运用Metascape数据平台进行基因本体(GO)功能与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。采用Cytoscape 3.8.0软件建立“中药-共同靶点-主要通路”网络。结果:获得泻白散治疗小儿喘息性支气管炎的主要活性成分为山柰酚、槲皮素、甘草查尔酮A、柚皮素、18α-羟基甘草酸等;其核心靶点为丝裂原活化蛋白激酶 1(MAPK1)、丝裂原活化蛋白激酶 3(MAPK3)、核因子κ-B激酶亚基β抑制剂(IKBKB)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、丝裂原活化蛋白激酶8(MAPK8)、半胱天冬酶-3(CASP3)和丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)等。通过分子对接验证,大部分靶点与化合物都有较好的结合效果。靶点富集通路包括白细胞介素-17信号通路(IL-17 signaling pathway)、肿瘤坏死因子信号通路(TNF signaling pathway)和缺氧诱导因子-1信号通路(HIF-1 signaling pathway)等诸多炎症通路。结论:泻白散可通过多靶点、多通路的互相作用,降低喘息性支气管炎的炎症风暴,并缓解气道痉挛。本研究结果为泻白散治疗小儿喘息性支气管炎提供了理论基础。  相似文献   

17.
目的:通过网络药理学和分子对接技术,探讨黄芪-白花蛇舌草抗非小细胞肺癌(NSCLC)的潜在活性成分和作用机制。方法:利用TCMSP和Uniprot数据库获取黄芪-白花蛇舌草的主要活性成分及靶点基因;GeneCards、OMIM数据库获取NSCLC靶点基因;绘制韦恩图得到疾病和活性成分共同靶点;STRING数据库构建中药成分靶蛋白-疾病靶蛋白的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;Cytoscape 3.9.1软件绘制成分-靶点网络图,通过网络拓扑分析筛选出关键靶点及成分;DAVID数据库及Bioinformatics平台进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;PyMol软件和AotoDock软件绘制相应的分子对接图。结果:经筛选共得到653个黄芪-白花蛇舌草活性成分靶点和6178个疾病靶点,两者交集靶点154个。GO功能富集到747个生物过程、83个分子功能和150个细胞组分,KEGG通路富集分析得到167条信号通路。分子对接结果显示,PTGS1蛋白与活性成分槲皮素、山柰酚、芒柄花黄素均结合稳定。结论:黄芪-白花蛇舌草可能通过槲皮素、山柰酚、芒柄花黄素等成分,PTGS1、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、白细胞介素-6(IL-6)等靶点,丝裂原激活的蛋白激酶(MAPK)、磷脂酰肌醇3 激酶-蛋白激酶 B(PI3K-Akt)等信号通路治疗NSCLC,初步预测了黄芪-白花蛇舌草对NSCLC的作用机制,为深入揭示其治疗NSCLC的分子机制提供了理论基础。  相似文献   

18.
目的:基于网络药理学探讨补阳还五汤治疗高血压性脑出血的作用机制。方法:通过TCMSP获取补阳还五汤中药的主要化学成分及活性物,利用UniProt数据库规范化合物作用的蛋白质靶点。通过Swiss ADME平台筛选潜在化学成分,将筛选后的化合物通过SwissTargetPrediction平台获取其靶点;通过GeneCards数据库获取疾病的主要靶点,利用Venny分析工具绘制Venny图,并得到两者交集靶点。利用STRING11.5及Cytoscape 3.9.1构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。利用Metascape数据平台对潜在靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:获得药物活性成分黄芪17种、赤芍14种、川芎6种、当归2种、红花17种、桃仁19种,作用靶点646个,疾病靶点489个,药物-疾病交集靶点77个。关键基因主要为白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、血管内皮生长因子(VEGFA)、环加氧酶2(PTGS2)等。GO功能富集条目涉及炎症反应、对脂多糖的反应、膜筏、囊泡腔、抗氧化活性、激酶结合等。KEGG信号通路主要包括磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K-Akt)、白细胞介素-17(IL-17)等信号通路。结论:补阳还五汤治疗高血压性脑出血具有多成分、多靶点、多通路的特点,能起到抗炎、抗凋亡等作用,从而减少神经细胞凋亡,减轻脑水肿,改善神经功能损伤。  相似文献   

19.
目的:运用网络药理学和分子对接技术探析养心活血通脉汤治疗稳定性冠心病的作用机制。方法:应用TCMSP、Herb、TCMID平台检索养心活血通脉汤成分及作用靶点;经GeneCards、OMIM、DisGeNET平台获取稳定性冠心病靶点;运用Cytoscape 3.9.1建立“药物-活性成分-靶点”网络及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选核心靶点。由Metascape平台进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。利用Auto Dock Tools软件进行有效成分与和核心靶点分子对接。结果:养心活血通脉汤治疗稳定性冠心病主要成分为槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、芒柄花黄素、黄芩素、丹参酮ⅡA,关键靶点为肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、白细胞介素-1β(IL-1β)、血管内皮生长因子(VEGFA),关键通路为脂质和动脉粥样硬化(Lipid and atherosclerosis)、磷脂酰肌醇3激酶-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1信号通路(PI3K-Akt信号通路)、肿瘤坏死因子信号通路(TNF信号通路)、丝裂原活化蛋白激酶信号通路(MAPK信号通路)、糖基化终产物/受体信号通路(AGE-RAGE信号通路)等。分子对接结果显示各有效成分与各核心靶点结合活性较好。结论:养心活血通脉汤治疗稳定性冠心病作用机制主要为降脂、抗动脉粥样硬化、抗炎、抗心肌损伤。  相似文献   

20.
目的:研究中药治疗消化性溃疡(PU)的作用机制。方法:检索2020年版《中华人民共和国药典》与药智数据库中中药治疗PU的处方,利用Spss Modeler进行数据挖掘得到核心药物。从TCMSP数据库中获取核心中药的主要活性成分及作用靶点,GeneCards、OMIM、DrugBank、DisGenet数据库中获取疾病靶点,取交集靶点。对交集靶点进行可视化分析,筛选后得到核心靶点与核心成分,并进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析和分子对接。结果:获得甘草、延胡索、白芍、白及、党参5味核心药物,药物聚为 3 类,核心活性成分为槲皮素、山柰酚、木犀草素、柚皮素、柱头甾醇,核心靶点为环加氧酶(PTGS2)、表皮细胞因子(EGF)、表皮生长因子受体(EGFR)、白细胞介素-6(IL-6)、胱天蛋白酶(CASP3)等16个。获得603条GO条目,主要涉及氧化应激反应、蛋白磷酸化、泛素蛋白连接酶等。KEGG富集条目共 118 条通路,核心靶点主要富集在肿瘤坏死因子、白细胞介素-17(IL-17)等信号通路。结论:5味中药治疗PU可能是通过调控PTGS2、EGF等靶点及TNF、IL-17、MAPK、HIF-1等通路的表达来实现。  相似文献   

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