对虾白斑症病毒(WSSV)部分克隆片段的序列测定及PCR扩增

对克隆的 WSSV基因组 Xba 1.8kb片段进行序列测定 ,根据所测定的核酸序列 ,通过计算机软件分析 ,设计出一对 PCR引物。所设计的 PCR引物能从纯化 WSSV及患白斑症的对虾组织中扩增出长为 92 1bp的目的 DNA片段 ,并且能检测出 0 .2～ 0 .4μg病虾肌肉组织中的 WSSV。健康对虾、感染MBV的斑节对虾仔虾及 SINPV的扩增结果均为阴性。表明所建立的 WSSV PCR检测法灵敏而且特异。     

冲绳日本绒螯蟹线粒体DNA125rRNA序列的研究

采集日本冲绳源河川和边野古川的日本绒螯蟹样品参考果蝇与蚤状线粒体ＤＮＡ１２ｒＲＮＡ基因片段序列进行了其相同片段的引物设计、ＰＣＲ扩增及序列测定。结果表明冲绳两河川４只日本绒螯蟹的碱基序列完全相同,为４５８ｂｐ,其Ａ、Ｔ、Ｇ、Ｃ含量分别为１６０ｂｐ（３４．９４％）、１７９ｂｐ（３９．０８％）、４９ｂｐ（１０．７０％）、７０ｂｐ（１５．２８％）同果与蚤状蚤相同基因片段的序列含量相似。     

凡纳滨对虾对虾杆状病毒PCR检测方法的建立及初步应用

根据Gen Bank中公布的对虾杆状病毒(Baculovirus penaei,BP)基因片段序列,设计1对特异性检测引物,建立快速检测凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)对虾杆状病毒的PCR方法。用该方法对BP阳性虾进行PCR扩增,结果得到380 bp的特异性扩增条带,与实验设计相符,而对白斑综合征病毒(WSSV)、桃拉病毒(TSV)、传染性皮下及造血器官坏死病毒(IHHNV)阳性虾和健康虾的扩增结果为阴性。测序比对结果证实,该PCR方法检测结果准确,最低可检测出约1 pg的病毒DNA。利用建立的PCR方法对来自广东、广西、福建、海南和浙江的2 722份临床病料进行检测,共检出阳性病料133份,表明该PCR方法可用于对虾杆状病毒的临床快速检测。     

斑节对虾虾苗白斑综合症杆状病毒的检测和养殖跟踪

利用２步ＰＣＲ检测技术对湛江和阳西地区的虾苗进行白斑综合病杆状病毒（ＷＳＳＶ）检测。在仔虾２日龄最早检测得到病毒,有２５％的虾苗带有ＷＳＳＶ病毒。带病毒虾苗和不带病毒虾苗分别在不同养殖模式的养殖过程中跟踪。前者在湛江湖光镇普通虾塘跟踪养殖,它们在变化的环境中容易发病,ｐＨ、盐度和温度是重要的诱发因子,在养殖５０～６０ｄ时发病死亡;后者在高位池和普通池养殖跟踪,它们对变化的环境有较大的适应性,养殖时间为８０～１１０ｄ,在相对优良的养殖技术条件下大部分可望养殖成功。环境中有ＷＳＳＶ病原传入,不带病毒虾苗在养殖后期可以带有ＷＳＳＶ病毒,出现白斑虾。跟踪有普通池有爆发病害,但是时间延后,跟踪的高位池没有爆发病害。     

冲绳日本绒螯蟹线粒体DNA 12S rRNA序列的研究

采集日本冲绳源河川和边野古川的日本绒螯蟹样品 ,参考果蝇与蚤状氵蚤线粒体 DNA12 Sr RNA基因片段序列进行了其相同片段的引物设计、PCR扩增及序列测定。结果表明冲绳两河川 4只日本绒螯蟹的碱基序列完全相同 ,为 4 58bp,其 A、T、G、C含量分别为 16 0 bp(34.94 % )、 179bp(39.0 8% )、4 9bp(10 .70 % )、70 bp(15.2 8% ) ,同果蝇与蚤状氵蚤相同基因片段的序列含量相似。     

凡纳滨对虾肠道上皮细胞微胞子虫PCR检测方法的建立与应用

根据Gen Bank中对虾肠道上皮细胞微胞子虫(Enterocytozoon hepatopenaei,EHP)的基因保守序列,设计一对特异性引物,通过优化PCR扩增条件,建立快速检测凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)EHP的PCR方法。用该方法对EHP阳性虾进行PCR扩增,得到与实验设计相符的330 bp特异性扩增条带,而对白斑综合症病毒(WSSV)、桃拉病毒(TSV)、传染性皮下及造血器官坏死病毒(IHHNV)、对虾杆状病毒(BP)、"棉花虾"微孢子虫、黏孢子虫的阳性虾,以及健康虾的扩增结果为阴性。测序比对发现,PCR产物序列与Gen Bank EHP基因序列的同源性为99.8%,表明该PCR方法检测结果准确。敏感性试验表明,该方法最低可检测出约100 fg的EHP质粒DNA。用该PCR方法检测广东、广西、江苏、山东、海南等地的755份临床样品,共检出阳性样品21份。该PCR方法可用于凡纳滨对虾EHP的快速检测。     

草鱼种质退化相关SRAP分子标记的筛选

采用相关序列扩增多态性(sequence-realted amplified polymorphism,SRAP)技术分析野生草鱼和家养草鱼,并筛选与草鱼种质退化相关的分子遗传标记。共进行88对引物组合的检测,产生标记数目共计905个。依据标记在群体中出现的频率和变化规律,共筛选出21个可能与种质相关的特异性标记,对这些特异性标记进行测序并将测序结果进行BLAST分析,发现测得片段中有8个片段能在GeneBank中找到同源性较高的序列,而其他片段与数据库中序列的相似性较低。     

一株H_5亚型禽流感病毒血凝素基因的克隆与序列分析

根据GenBank中发表的H5亚型禽流感病毒HA基因序列设计2对引物,用RT-PCR方法从禽流感病毒广东分离病毒株(A/Chicken/Guangdong/1997)中扩增HA基因cDNA片段,并将其克隆至pMD-18T载体进行核苷酸序列测定。结果表明:用2对引物所扩增的片段大小分别约为1300 bp和800 bp,经序列拼接获得的HA基因cDNA长度约为1601 bp,编码533个氨基酸,与国内己发表的11个代表株的核苷酸和氨基酸序列同源性为分别为96.9%~99.9%和86.5%~93.0%;HA基因编码的氨基酸序列的系统进化树也表明A/Chicken/Guang-dong/1997、A/Goose/Huadong/01/2000、A/Ck/Hk/37.4/2002、A/Chicken/Zhoukou/2/02、A/Duck/Guangxi/53/2002、A/Duck/Fujian/01/2002等毒株处于同一进化枝,亲缘关系较近;而与A/Silly/Chicken/Hongkong/SF189/01株处于不同进化枝,亲缘关系较远。     

草鱼种质退化相关SRAP分子标记的筛选

采用相关序列扩增多态性（sequence-reared amplified polymorphism，SRAP）技术分析野生草鱼和家养草鱼，并筛选与草鱼种质退化相关的分子遗传标记。共进行88对引物组合的检测，产生标记数目共计905个。依据标记在群体中出现的频率和变化规律，共筛选出21个可能与种质相关的特异性标记，对这些特异性标记进行测序并将测序结果进行BLAST分析，发现测得片段中有8个片段能在GeneBank中找到同源性较高的序列，而其他片段与数据库中序列的相似性较低。     

粤西镇海湾近江牡蛎线粒体16S rRNA基因序列变异分析

采用聚合酶链式反应(PCR)技术对粤西镇海湾水域的近江牡蛎Crassostrea rivularis (Gould)群体27个个体的线粒体DNA16S rRNA基因序列片段进行扩增，获得大约500bp的扩增产物。PCR产物经纯化后进行序列测定，经Clustal X同源排序，除去引物及部分端部序列，得到414bp的核苷酸片段。27个个体共检测到2个变异位点，均为颠换位点，没发现碱基位点插入、缺失及转换位点，共3种单倍型，每个单倍型只有一个碱基的差异。运用DNASP软件计算得该群体的核苷酸多样性和平均核苷酸差异数分别为0．00036和0．14815。此结果提示镇海湾近江牡蛎群体遗传多样性已很低，很有必要从其他分布区引进近江牡蛎亲贝来扩大该种群的遗传多样性。     

抗草甘磷转基因大豆多重PCR检测及假阳性问题探讨

以大豆病基因类似物(RGA)基因为对照,用RR大豆中的外源CaMV35S启动子、CP4-EPSPS引物,应用多重PCR方法,从RR大豆中扩增出预期大小的DNA片段。结果表明:将扩增产物回收后测序,经同源性分析扩增产物为CaMV35S启动子和CP4-EPSPS的一部分序列;多重PCR检测的灵敏度为0.08%;PCR检测过程中产生假阳性的原因是污染和非特异性扩增。     

抗草甘磷转基因大豆多重POR检测及假阳性问题探讨

以大豆病基因类似物(ROA)基因为对照,用RR大豆中的外源CaMV35S启动子、CP4-EPSPS引物,应用多重PCR方法,从RR大豆中扩增出预期大小的DNA片段.结果表明:将扩增产物回收后测序,经同源性分析扩增产物为CaMV35S启动子和CP4-EPSPS的一部分序列;多重PCR检测的灵敏度为0.08%;PCR检测过程中产生假阳性的原因是污染和非特异性扩增.     

H5、H7和H9亚型禽流感分子鉴别诊断方法的建立

为快速、敏感、特异地鉴别诊断现较为重要的禽流感病毒亚型,根据H5、H7和H9亚型禽流感病毒HA基因序列的保守区域设计出并合成3对特异性引物,利用这3对引物对H5、H7和H9亚型禽流感病毒的HA基因片断进行多联RT-PCR扩增,并对多联RT-PCR检测方法进行敏感性及特异性实验。结果表明:3对引物能特异性地扩增出H5、H7和H9亚型禽流感病毒HA基因片段,大小分别为490bp,365bp和686bp;该检测方法敏感性高,特异性强;初步建立起快速、敏感、特异地鉴别检测H5、H7和H9亚型禽流感病毒的分子诊断方法。     

鱼类致病杀鲑诺卡氏菌(Nocardia salmonicida)特异性PCR检测方法的建立

鱼类诺卡氏菌病是全球性的鱼病,杀鲑诺卡氏菌(Nocardia salmonicida)是引起鱼类诺卡氏菌病的主要病原之一。根据杀鲑诺卡氏菌16S-23S转录间隔区(ITS)序列设计引物,建立特异性PCR检测杀鲑诺卡氏菌的方法。结果表明,筛选的PCR引物可特异性地扩增出杀鲑诺卡氏菌的ITS片段,检测灵敏度(DNA浓度)为28.3 pg·μL-1。检测人工感染杀鲑诺卡氏菌的鱼组织,结果显示,该方法可从未分离到病原菌的病鱼组织中检出阳性片段,较传统细菌分离鉴定方法更为高效灵敏。     

基于支持向量机回归的岩体变形模量预测

岩体变形模量是表征岩体变形特性的最重要参数之一,其获取手段有室内试验与现场试验法、经 验 关 系 法、数 值 模 拟法、人工智能预测方法等。人工智能预测方法中常用的是神经网络方法,但神经网络易陷入局部极小值和过学习而导致低精度,支持向量机回归（ＳＶＲ）方法能有效地避免神经网络的以上缺陷,并在小样本、非线性预测方面具有较大优势,但目前 ＳＶＲ 应用于岩体变形模量预测的研究较少。以某水电站坝址区英安岩的试验数据为依托,采用灰色关联分析筛选出与变形模量最相关的纵波波速作为输入变量。在此基础上,以３个国内的水电站为例,分别建立相应的以实测纵波波速作为输入变量的粒子群算法优化－支持向量机回归（ＰＳＯ－ＳＶＲ）变形模量预测模型,同时,通过与 ＢＰ神经网络（ＢＰ－ＮＮ）、ＲＢＦ神经网络（ＲＢＦ－ＮＮ）２种预测方法进行对比,对比分析表明ＳＶＲ模型具有更高的预测精度,预测效果较好,说明 ＰＳＯ－ＳＶＲ方法更适用于岩体变形模量预测。      

利用RAPD和ISSR引物对三系杂交水稻及其父母本的鉴定

为了鉴定杂交种子与父母本的亲缘关系，用20条随机引物和21条ISSR引物在供试的一组三系杂交水稻F1、父母本及对照进行扩增。20条RAPD引物共扩增出78个条带，其中28条为多态性条带；21条ISSR引物共扩增出72个条带，其中多态性条带为20条。将这些多态性条带进行聚类分析，F1与父、母亲缘关系较近归为一类．随后它们才与对照归为一类。结果表明RAPD和ISSR引物的PCR扩增均能有效地鉴定三系杂交水稻的杂种F1与组合中父、母本的遗传关系。与RAPD相比ISSR引物在三系杂交水稻及其父母本的鉴定中具有稳定性更好的优点。     

粤西镇海湾近江牡蛎线粒体16S rRNA基因序列变异分析

采用聚合酶链式反应 (PCR)技术对粤西镇海湾水域的近江牡蛎Crassostrearivularis(Gould)群体 2 7个个体的线粒体DNA16SrRNA基因序列片段进行扩增 ,获得大约 5 0 0bp的扩增产物。PCR产物经纯化后进行序列测定 ,经ClustalX同源排序 ,除去引物及部分端部序列 ,得到4 14bp的核苷酸片段。 2 7个个体共检测到 2个变异位点 ,均为颠换位点 ,没发现碱基位点插入、缺失及转换位点 ,共 3种单倍型 ,每个单倍型只有一个碱基的差异。运用DNASP软件计算得该群体的核苷酸多样性和平均核苷酸差异数分别为 0 .0 0 0 36和 0 .14 815。此结果提示镇海湾近江牡蛎群体遗传多样性已很低 ,很有必要从其他分布区引进近江牡蛎亲贝来扩大该种群的遗传多样性     

钼精粉中微量钨的测定

钼精粉中微量钨的测定ＯＮＴＨＥＤＥＴＥＲＭＩＮＡＴＩＯＮＯＦＴＲＡＣＥＷＯＬＦＲＡＭＩＮＭＯＬＹＢＤＥＮＵＭＣＯＮＣＥＮＴＫＡＴＥ钼精粉中微量钨的测定如采用硫氰酸盐光度法，测定钨的主要干扰元素是钼。当５０ｍｌ试剂中含钼大于０．２ｍｇ时，即应用光度法测...     

氢化物-无色散原子荧光光谱法测定微量碲

氢化物—无色散原子荧光光谱法测定黄铁矿及地球化学样品中微量碲，采用硝酸，盐酸，高氯酸分解样品，用浓盐酸将六价碲还原成四价碲，再用硼氢化钾继续还原使碲形成氢化物ＴｅＨ２，在ＡＦＳ１２０１Ｃ原子荧光光谱仪进行测定碲的检示限为０．１８μｇ／ｇ，精密度ＲＳＤ％为６．８％，该方法操作简便、快速、准确、费用低，可应用于大批量地球化学样品的分析。     

结构振动数据数学模型的线性与非线性刻划

对振动测试数据评价参数的数学反演使用时间序列的线性和非线性模型进行了建模,计算结果表明非线性的ＳＥＴＡＲ模型描述测试数据所反映的物理过程比线性ＡＲＭＡＸ模型更趋于合理、全面和客观。非线性ＳＥＴＡＲ模型能较深刻描述被测体系的振动机理和物理行为,为下一步振动数据评判奠定了基础